• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

ATP 驱动的细菌液相对流分离。

ATP-Driven Separation of Liquid Phase Condensates in Bacteria.

机构信息

Centre de Biochimie Structurale, CNRS UMR 5048, INSERM U1054, Université de Montpellier, 60 rue de Navacelles, 34090 Montpellier, France.

Laboratoire Charles Coulomb (L2C), Université de Montpellier, CNRS, Montpellier, France.

出版信息

Mol Cell. 2020 Jul 16;79(2):293-303.e4. doi: 10.1016/j.molcel.2020.06.034.

DOI:10.1016/j.molcel.2020.06.034
PMID:32679076
Abstract

Liquid-liquid phase-separated (LLPS) states are key to compartmentalizing components in the absence of membranes; however, it is unclear whether LLPS condensates are actively and specifically organized in the subcellular space and by which mechanisms. Here, we address this question by focusing on the ParABS DNA segregation system, composed of a centromeric-like sequence (parS), a DNA-binding protein (ParB), and a motor (ParA). We show that parS and ParB associate to form nanometer-sized, round condensates. ParB molecules diffuse rapidly within the nucleoid volume but display confined motions when trapped inside ParB condensates. Single ParB molecules are able to rapidly diffuse between different condensates, and nucleation is strongly favored by parS. Notably, the ParA motor is required to prevent the fusion of ParB condensates. These results describe a novel active mechanism that splits, segregates, and localizes non-canonical LLPS condensates in the subcellular space.

摘要

液-液相分离(LLPS)状态是在没有膜的情况下分隔成分的关键;然而,目前尚不清楚 LLPS 凝聚物是否在亚细胞空间中被主动且特异性地组织,以及通过哪些机制。在这里,我们通过关注 ParABS DNA 分离系统来解决这个问题,该系统由一个类似于着丝粒的序列(parS)、一个 DNA 结合蛋白(ParB)和一个马达(ParA)组成。我们表明,parS 和 ParB 结合形成纳米级的圆形凝聚物。ParB 分子在核质体积内快速扩散,但在被囚禁在 ParB 凝聚物内时表现出受限的运动。单个 ParB 分子能够在不同的凝聚物之间快速扩散,而且 parS 强烈促进成核。值得注意的是,ParA 马达是防止 ParB 凝聚物融合所必需的。这些结果描述了一种新的主动机制,该机制可将非典型的 LLPS 凝聚物在亚细胞空间中分裂、分离和定位。

相似文献

1
ATP-Driven Separation of Liquid Phase Condensates in Bacteria.ATP 驱动的细菌液相对流分离。
Mol Cell. 2020 Jul 16;79(2):293-303.e4. doi: 10.1016/j.molcel.2020.06.034.
2
Directed and persistent movement arises from mechanochemistry of the ParA/ParB system.定向且持续的运动源于ParA/ParB系统的机械化学作用。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Dec 22;112(51):E7055-64. doi: 10.1073/pnas.1505147112. Epub 2015 Dec 8.
3
CTP-controlled liquid-liquid phase separation of ParB.CTP 控制 ParB 的液-液相分离。
J Mol Biol. 2022 Jan 30;434(2):167401. doi: 10.1016/j.jmb.2021.167401. Epub 2021 Dec 10.
4
Supercoiled DNA and non-equilibrium formation of protein complexes: A quantitative model of the nucleoprotein ParBS partition complex.超螺旋 DNA 和蛋白质复合物的非平衡形成:核蛋白 ParBS 分配复合物的定量模型。
PLoS Comput Biol. 2021 Apr 16;17(4):e1008869. doi: 10.1371/journal.pcbi.1008869. eCollection 2021 Apr.
5
Phase-separated ParB enforces diverse DNA compaction modes and stabilizes the parS-centered partition complex.相分离的 ParB 强制不同的 DNA 压缩模式,并稳定以 parS 为中心的分区复合物。
Nucleic Acids Res. 2024 Aug 12;52(14):8385-8398. doi: 10.1093/nar/gkae533.
6
In vivo assembly of bacterial partition condensates on circular supercoiled and linear DNA.细菌分区凝聚物在环状超螺旋DNA和线性DNA上的体内组装。
Mol Microbiol. 2025 Mar;123(3):232-244. doi: 10.1111/mmi.15297. Epub 2024 Aug 7.
7
DNA segregation under Par protein control.Par 蛋白控制下的 DNA 分离。
PLoS One. 2019 Jul 18;14(7):e0218520. doi: 10.1371/journal.pone.0218520. eCollection 2019.
8
CTP and coordinate ParB partition complex dynamics and ParA-ATPase activation for ParABS-mediated DNA partitioning.CTP 与 ParB 分隔复合动力学协同作用,激活 ParA-ATP 酶,以实现 ParABS 介导的 DNA 分隔。
Elife. 2021 Jul 21;10:e65651. doi: 10.7554/eLife.65651.
9
Dynamic ParB-DNA interactions initiate and maintain a partition condensate for bacterial chromosome segregation.动态 ParB-DNA 相互作用启动并维持细菌染色体分离的分隔冷凝物。
Nucleic Acids Res. 2023 Nov 27;51(21):11856-11875. doi: 10.1093/nar/gkad868.
10
ATP-regulated interactions between P1 ParA, ParB and non-specific DNA that are stabilized by the plasmid partition site, parS.ATP 调节的 P1 ParA、ParB 与非特异性 DNA 之间的相互作用,这些作用通过质粒分配位点 parS 稳定。
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(2):801-12. doi: 10.1093/nar/gkr747. Epub 2011 Sep 28.

引用本文的文献

1
Orchestrated long-distance gene activation by a ParB-like BisD-CTP DNA clamp in low-frequency transfer competence development in Pseudomonas putida.恶臭假单胞菌低频转移能力发育过程中,一种类似ParB的BisD-CTP DNA夹子介导的长距离基因激活作用
Nucleic Acids Res. 2025 Aug 11;53(15). doi: 10.1093/nar/gkaf802.
2
A blueprint for biomolecular condensation driven by bacterial microcompartment encapsulation peptides.由细菌微区室包封肽驱动的生物分子凝聚蓝图。
Nat Commun. 2025 Aug 11;16(1):7378. doi: 10.1038/s41467-025-62772-0.
3
Interfacial effects determine nonequilibrium phase behaviors in chemically driven fluids.
界面效应决定了化学驱动流体中的非平衡相行为。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2025 Jul 29;122(30):e2501145122. doi: 10.1073/pnas.2501145122. Epub 2025 Jul 23.
4
Expanding the diversity of bacterial DNA partitioning: A CTP-independent ParAB system for plasmid partitioning in .扩展细菌DNA分配的多样性:一种不依赖CTP的用于质粒分配的ParAB系统 于…… (原文此处不完整)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2025 Jul 8;122(27):e2406398122. doi: 10.1073/pnas.2406398122. Epub 2025 Jul 2.
5
Active droplets controlled by enzymatic reactions.由酶促反应控制的活性液滴。
J R Soc Interface. 2025 May;22(226):20240803. doi: 10.1098/rsif.2024.0803. Epub 2025 May 7.
6
Mesoscale molecular assembly is favored by the active, crowded cytoplasm.中尺度分子组装受到活跃、拥挤的细胞质的青睐。
PRX Life. 2024 Sep;2(3). doi: 10.1103/prxlife.2.033001. Epub 2024 Jul 10.
7
BR-Bodies Facilitate Adaptive Responses and Survival During Copper Stress in .BR 小体有助于在……铜胁迫期间的适应性反应和存活
bioRxiv. 2025 Mar 11:2025.03.11.642215. doi: 10.1101/2025.03.11.642215.
8
Electrostatics of salt-dependent reentrant phase behaviors highlights diverse roles of ATP in biomolecular condensates.盐依赖性折返相行为的静电学突出了ATP在生物分子凝聚物中的多种作用。
Elife. 2025 Mar 3;13:RP100284. doi: 10.7554/eLife.100284.
9
Chemically Informed Coarse-Graining of Electrostatic Forces in Charge-Rich Biomolecular Condensates.富含电荷的生物分子凝聚物中静电力的化学信息粗粒化
ACS Cent Sci. 2025 Feb 11;11(2):302-321. doi: 10.1021/acscentsci.4c01617. eCollection 2025 Feb 26.
10
Polyphosphate: The "Dark Matter" of Bacterial Chromatin Structure.多聚磷酸盐:细菌染色质结构中的“暗物质”。
Mol Microbiol. 2025 Mar;123(3):279-293. doi: 10.1111/mmi.15350. Epub 2025 Feb 18.