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(兰科)的完整质体基因组。

Complete plastid genome of (Orchidaceae).

作者信息

Wang Min-Hua, Ma Liang

机构信息

College of Landscape Architecture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 9;4(2):3423-3424. doi: 10.1080/23802359.2019.1674736.

DOI:10.1080/23802359.2019.1674736
PMID:33366022
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7707356/
Abstract

is one of the most important genera in Orchidaceae. In this study, we used the next-generation sequencing technology and assembled a complete plastid genome of a recently published new species of , . The plastome was 151,883 bp in length, containing a large single-copy region (LSC) of 87,189 bp, and a small single-copy region (SSC) of 12,150 bp, and two inverted repeat regions (IR) of 26,272 bp. A total of 123 genes were predicted, including 38 tRNA genes, 8 rRNA genes, and 77 protein-coding genes. Phylogenetic analysis of 44 representative plastome of the genus and outgroup suggested to be sister to

摘要

是兰科最重要的属之一。在本研究中,我们使用下一代测序技术,组装了最近发表的一种新物种的完整质体基因组。该质体基因组长度为151,883 bp,包含一个87,189 bp的大单拷贝区域(LSC)、一个12,150 bp的小单拷贝区域(SSC)和两个26,272 bp的反向重复区域(IR)。共预测到123个基因,包括38个tRNA基因、8个rRNA基因和77个蛋白质编码基因。对该属44个代表性质体基因组和外类群的系统发育分析表明, 与 为姐妹关系

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/64c1/7707356/c2e3980bfd45/TMDN_A_1674736_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/64c1/7707356/c2e3980bfd45/TMDN_A_1674736_F0001_B.jpg
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