• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。

Complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).

作者信息

Zhang Yang-Yang, Fan Li-Li, Su Jian-Lin, Xu Lin-Zheng, Li Min, Chen Ling-Yan, Rong Jun-Dong, Zheng Yu-Shan

机构信息

College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian, China.

Key Laboratory of Bamboo Institute, College of Forestry, Fuzhou, Fujian, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jan 24;5(1):790-791. doi: 10.1080/23802359.2019.1710298.

DOI:10.1080/23802359.2019.1710298
PMID:33366752
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748570/
Abstract

is mostly produced in south China; usually cultivated on the banks of the rivers and near villages. We determined the complete chloroplast (cp) genome sequence of using Illumina sequencing data. The complete cp sequence is 139,393 bp, include large single-copy (LSC) region of 82,969 bp, small single-copy (SSC) region of 12,874 bp, a pair of invert repeats (IR) regions of 21,775 bp. Plastid genome contain 132 genes, 85 protein-coding genes, 39 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis based on 28 cp genomes indicates that is closely related to in Bambusodae.

摘要

主要产于中国南方;通常生长在河流两岸和村庄附近。我们利用Illumina测序数据确定了[物种名称]的完整叶绿体(cp)基因组序列。完整的cp序列为139393 bp,包括82969 bp的大单拷贝(LSC)区域、12874 bp的小单拷贝(SSC)区域以及一对21775 bp的反向重复(IR)区域。质体基因组包含132个基因,其中85个蛋白质编码基因、39个tRNA基因和8个rRNA基因。基于28个cp基因组的系统发育分析表明,[物种名称]与竹亚科的[另一物种名称]密切相关。

你提供的原文中部分物种名称缺失,我已用[物种名称]代替,你可根据实际情况补充完整。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5fdf/7748570/84ea53a2fb9d/TMDN_A_1710298_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5fdf/7748570/84ea53a2fb9d/TMDN_A_1710298_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5fdf/7748570/84ea53a2fb9d/TMDN_A_1710298_F0001_C.jpg

相似文献

1
Complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jan 24;5(1):790-791. doi: 10.1080/23802359.2019.1710298.
2
The complete chloroplast genome sequence of var (Bambusodae).竹亚科变种的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Oct 5;5(3):3467-3468. doi: 10.1080/23802359.2020.1823275.
3
The complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jun 21;6(7):2046-2047. doi: 10.1080/23802359.2021.1939175.
4
Complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jun 26;5(3):2609-2610. doi: 10.1080/23802359.2020.1781577.
5
The complete chloroplast genome sequence of (bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 24;6(9):2748-2749. doi: 10.1080/23802359.2021.1967798. eCollection 2021.
6
Complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 6;5(1):306-307. doi: 10.1080/23802359.2019.1702484.
7
The complete chloroplast genome sequence of L.C.Chia & H.L.Fung (Bambusodae).L.C. 贾与H.L. 冯(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jun 28;6(8):2123-2125. doi: 10.1080/23802359.2021.1944361. eCollection 2021.
8
Complete chloroplast genome sequence of (Bambuseae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 23;5(3):2972-2973. doi: 10.1080/23802359.2020.1793699.
9
The complete chloroplast genome sequence of (Bambusoideae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jul 14;6(8):2184-2185. doi: 10.1080/23802359.2021.1944373. eCollection 2021.
10
The complete chloroplast genome sequence of f. (Poaceae: Bambuseae).f.的完整叶绿体基因组序列(禾本科:竹亚科)
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Feb 24;8(2):324-328. doi: 10.1080/23802359.2023.2181648. eCollection 2023.

本文引用的文献

1
Bandage: interactive visualization of de novo genome assemblies.绷带:从头基因组组装的交互式可视化
Bioinformatics. 2015 Oct 15;31(20):3350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btv383. Epub 2015 Jun 22.
2
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
3
OrganellarGenomeDRAW--a suite of tools for generating physical maps of plastid and mitochondrial genomes and visualizing expression data sets.
细胞器基因组绘图软件--一套用于生成质体和线粒体基因组物理图谱以及可视化表达数据集的工具。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W575-81. doi: 10.1093/nar/gkt289. Epub 2013 Apr 22.
4
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
5
Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data.Geneious Basic:一个集成和可扩展的桌面软件平台,用于组织和分析序列数据。
Bioinformatics. 2012 Jun 15;28(12):1647-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts199. Epub 2012 Apr 27.