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杨柳科(杨柳科)的完整叶绿体基因组序列。

Complete chloroplast genome sequence of (Salicaceae).

作者信息

Liu Xiaojin, Xu Daping, Zhang Ningnan, Hong Zhou

机构信息

Research Institute of Tropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Guangzhou, P.R. China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 15;5(3):2819-2820. doi: 10.1080/23802359.2020.1789514.

DOI:10.1080/23802359.2020.1789514
PMID:33457961
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7782329/
Abstract

is a large evergreen tree species belonging to Salicaceae family, and its wood is tough, fine-grained, which makes it a good source of commercial use for building construction and furniture manufacturing. In this study, we sequenced the complete chloroplast genome of based on next generation sequencing and used these data to assess genomic resources. The size of the chloroplast genome was 157,852 bp, including a large single-copy region (85,888 bp), a small single-copy region (16,592 bp), and a pair of inverted repeats regions (27,686 bp). The overall GC content of the chloroplast genome was 36.6%. The plastome of was predicted to contain 112 unique genes, including 78 protein coding genes, 30 tRNA genes and 4 rRNA genes. The reconstructed phylogeny revealed that was monophyletic and was sister to , and

摘要

是一种属于杨柳科的大型常绿树种,其木材坚韧、纹理细密,这使其成为建筑施工和家具制造商业用途的良好来源。在本研究中,我们基于下一代测序对 的完整叶绿体基因组进行了测序,并使用这些数据来评估基因组资源。 的叶绿体基因组大小为157,852 bp,包括一个大单拷贝区域(85,888 bp)、一个小单拷贝区域(16,592 bp)和一对反向重复区域(27,686 bp)。 的叶绿体基因组总体GC含量为36.6%。预测 的质体基因组包含112个独特基因,包括78个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。重建的系统发育表明 是单系的,并且 与 、 是姐妹关系,以及

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9399/7782329/b060501b4303/TMDN_A_1789514_F0001_B.jpg
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