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(竹亚科:竹族)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of (Bambusoideae: Bambuseae).

作者信息

Zhang Xianzhi, Zhou Renchao, Chen Siyun

机构信息

School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, Guangdong, China.

Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Aug 23;3(2):986-987. doi: 10.1080/23802359.2018.1507645.

DOI:10.1080/23802359.2018.1507645
PMID:33474388
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7799739/
Abstract

is one important ornamental bamboo. In this study, we generated the complete chloroplast (cp) genome of via genome-skimming method. The complete cp genome is 139,460 base-pairs (bp) in size, with a pair of inverted repeats of 21,794 bp which separate a large single copy region of 82,996 bp and a small single copy region of 12,876 bp. The genome contains a total of 131 genes, including 84 protein-coding genes, 8 ribosomal RNAs and 39 transfer RNAs. The GC content of the cp genome is 38.9%. Moreover, phylogenomic inference robustly placed in the paleotropical woody bamboos lineage.

摘要

是一种重要的观赏竹。在本研究中,我们通过基因组浅层测序方法生成了 的完整叶绿体(cp)基因组。完整的cp基因组大小为139,460碱基对(bp),有一对21,794 bp的反向重复序列,将一个82,996 bp的大单拷贝区域和一个12,876 bp的小单拷贝区域分开。该基因组总共包含131个基因,包括84个蛋白质编码基因、8个核糖体RNA和39个转运RNA。cp基因组的GC含量为38.9%。此外,系统发育基因组推断有力地将 置于古热带木本竹谱系中。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/50bf/7799739/8178f64d5312/TMDN_A_1507645_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/50bf/7799739/8178f64d5312/TMDN_A_1507645_F0001_C.jpg
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