• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

通过氟核磁共振监测蛋白质-金属结合——以新德里金属β-内酰胺酶1为例的研究。

Monitoring protein-metal binding by F NMR - a case study with the New Delhi metallo-β-lactamase 1.

作者信息

Rydzik Anna M, Brem Jürgen, Chandler Shane A, Benesch Justin L P, Claridge Timothy D W, Schofield Christopher J

机构信息

The Department of Chemistry , University of Oxford , 12 Mansfield Road , Oxford , OX1 3TA , UK . Email:

出版信息

RSC Med Chem. 2020 Feb 21;11(3):387-391. doi: 10.1039/c9md00416e. eCollection 2020 Mar 1.

DOI:10.1039/c9md00416e
PMID:33479644
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7484990/
Abstract

F NMR protein observed spectroscopy is evaluated as a method for analysing protein metal binding using the New Delhi metallo-β-lactamase 1. The results imply F NMR is useful for analysis of different metallated protein states and investigations on equilibrium states in the presence of inhibitors. One limitation is that F labelling may affect metal ion binding. The sensitive readout of changes in protein behaviour observed by F NMR spectra coupled with the broad scope of tolerated conditions ( buffer variations) means F NMR should be further investigated for studying metal ion interactions and the inhibition of metallo-enzymes during drug discovery.

摘要

利用新德里金属β-内酰胺酶1,对氟核磁共振蛋白质观测光谱法作为一种分析蛋白质金属结合的方法进行了评估。结果表明,氟核磁共振对于分析不同金属化的蛋白质状态以及研究抑制剂存在时的平衡状态很有用。一个局限性是氟标记可能会影响金属离子结合。氟核磁共振光谱所观测到的蛋白质行为变化的灵敏读出,再加上广泛的耐受条件范围(缓冲液变化),意味着在药物研发过程中,对于研究金属离子相互作用以及金属酶的抑制作用,应进一步研究氟核磁共振。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/72b8c7094eb6/c9md00416e-f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/0970aa93b0f7/c9md00416e-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/ebccbe06ff9c/c9md00416e-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/e81d08ed4d38/c9md00416e-f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/2ab5859d5290/c9md00416e-f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/72b8c7094eb6/c9md00416e-f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/0970aa93b0f7/c9md00416e-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/ebccbe06ff9c/c9md00416e-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/e81d08ed4d38/c9md00416e-f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/2ab5859d5290/c9md00416e-f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/245d/7484990/72b8c7094eb6/c9md00416e-f5.jpg

相似文献

1
Monitoring protein-metal binding by F NMR - a case study with the New Delhi metallo-β-lactamase 1.通过氟核磁共振监测蛋白质-金属结合——以新德里金属β-内酰胺酶1为例的研究。
RSC Med Chem. 2020 Feb 21;11(3):387-391. doi: 10.1039/c9md00416e. eCollection 2020 Mar 1.
2
Monitoring conformational changes in the NDM-1 metallo-β-lactamase by 19F NMR spectroscopy.通过19F核磁共振光谱监测NDM-1金属β-内酰胺酶的构象变化。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Mar 17;53(12):3129-33. doi: 10.1002/anie.201310866. Epub 2014 Feb 24.
3
F-NMR Reveals the Role of Mobile Loops in Product and Inhibitor Binding by the São Paulo Metallo-β-Lactamase.F-NMR 揭示了 São Paulo 金属β-内酰胺酶在产物和抑制剂结合中移动环的作用。
Angew Chem Int Ed Engl. 2017 Mar 27;56(14):3862-3866. doi: 10.1002/anie.201612185. Epub 2017 Mar 2.
4
and screening of new Delhi metallo-β-lactamase-1 inhibitors from endophytic spp.从内生种筛选新德里金属β-内酰胺酶-1 抑制剂
J Biomol Struct Dyn. 2022;40(24):13593-13605. doi: 10.1080/07391102.2021.1990132. Epub 2021 Oct 16.
5
Discovery of potential inhibitors against New Delhi metallo-β-lactamase-1 from natural compounds: in silico-based methods.从天然化合物中发现针对新德里金属β-内酰胺酶 1 的潜在抑制剂:基于计算机的方法。
Sci Rep. 2021 Jan 27;11(1):2390. doi: 10.1038/s41598-021-82009-6.
6
Investigating the position of the hairpin loop in New Delhi metallo-β-lactamase, NDM-1, during catalysis and inhibitor binding.研究新德里金属β-内酰胺酶NDM-1中发夹环在催化和抑制剂结合过程中的位置。
J Inorg Biochem. 2016 Mar;156:35-9. doi: 10.1016/j.jinorgbio.2015.10.011. Epub 2015 Oct 22.
7
A Cephalosporin Prochelator Inhibits New Delhi Metallo-β-lactamase 1 without Removing Zinc.头孢菌素螯合剂在不除去锌的情况下抑制新德里金属β-内酰胺酶 1。
ACS Infect Dis. 2020 May 8;6(5):1264-1272. doi: 10.1021/acsinfecdis.0c00083. Epub 2020 Apr 29.
8
Novel metallo-β-lactamases inhibitors restore the susceptibility of carbapenems to New Delhi metallo-lactamase-1 (NDM-1)-harbouring bacteria.新型金属β-内酰胺酶抑制剂恢复了碳青霉烯类药物对携带新德里金属β-内酰胺酶 1(NDM-1)的细菌的敏感性。
Br J Pharmacol. 2024 Jan;181(1):54-69. doi: 10.1111/bph.16210. Epub 2023 Sep 6.
9
Distinct Inhibition Modes of New Delhi Metallo-β-lactamase-1 Revealed by NMR Spectroscopy.核磁共振光谱揭示新德里金属β-内酰胺酶-1的独特抑制模式
JACS Au. 2023 Feb 27;3(3):849-859. doi: 10.1021/jacsau.2c00651. eCollection 2023 Mar 27.
10
Real-time monitoring of New Delhi metallo-β-lactamase activity in living bacterial cells by 1H NMR spectroscopy.通过 1H NMR 光谱实时监测活细菌细胞中的新德里金属β-内酰胺酶活性。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Feb 17;53(8):2130-3. doi: 10.1002/anie.201308636. Epub 2014 Jan 23.

引用本文的文献

1
Distinct Inhibition Modes of New Delhi Metallo-β-lactamase-1 Revealed by NMR Spectroscopy.核磁共振光谱揭示新德里金属β-内酰胺酶-1的独特抑制模式
JACS Au. 2023 Feb 27;3(3):849-859. doi: 10.1021/jacsau.2c00651. eCollection 2023 Mar 27.
2
Different Conformations Revealed by NMR Underlie Resistance to Ceftazidime/Avibactam and Susceptibility to Meropenem and Imipenem among D179Y Variants of KPC β-Lactamase.D179Y 变异型 KPC 酶通过 NMR 揭示的不同构象导致对头孢他啶/阿维巴坦的耐药性和对美罗培南及亚胺培南的敏感性。
Antimicrob Agents Chemother. 2022 Apr 19;66(4):e0212421. doi: 10.1128/aac.02124-21. Epub 2022 Mar 21.

本文引用的文献

1
F NMR Monitoring of Reversible Protein Post-Translational Modifications: Class D β-Lactamase Carbamylation and Inhibition.F NMR 监测可逆蛋白翻译后修饰:D 类β-内酰胺酶氨甲酰化和抑制。
Chemistry. 2019 Sep 12;25(51):11837-11841. doi: 10.1002/chem.201902529. Epub 2019 Aug 20.
2
Active-Site Conformational Fluctuations Promote the Enzymatic Activity of NDM-1.活性位点构象变化促进 NDM-1 的酶活性。
Antimicrob Agents Chemother. 2018 Oct 24;62(11). doi: 10.1128/AAC.01579-18. Print 2018 Nov.
3
Past and Present Perspectives on β-Lactamases.
β-内酰胺酶的过去与现在观点。
Antimicrob Agents Chemother. 2018 Sep 24;62(10). doi: 10.1128/AAC.01076-18. Print 2018 Oct.
4
Evolution of New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) in the clinic: Effects of NDM mutations on stability, zinc affinity, and mono-zinc activity.临床中新德里金属β-内酰胺酶(NDM)的演变:NDM 突变对稳定性、锌亲和力和单锌活性的影响。
J Biol Chem. 2018 Aug 10;293(32):12606-12618. doi: 10.1074/jbc.RA118.003835. Epub 2018 Jun 16.
5
Studies on ternary metallo-β lactamase-inhibitor complexes using electrospray ionization mass spectrometry.用电喷雾电离质谱法对三元金属β-内酰胺酶抑制剂复合物进行的研究。
J Am Soc Mass Spectrom. 2006 Jul;17(7):1000-1004. doi: 10.1016/j.jasms.2006.03.010. Epub 2006 Jul 1.
6
An update on β-lactamase inhibitor discovery and development.β-内酰胺酶抑制剂的发现和发展研究进展
Drug Resist Updat. 2018 Jan;36:13-29. doi: 10.1016/j.drup.2017.11.002. Epub 2017 Nov 7.
7
Current NMR Techniques for Structure-Based Drug Discovery.基于结构的药物发现的当前 NMR 技术。
Molecules. 2018 Jan 12;23(1):148. doi: 10.3390/molecules23010148.
8
Probing the Interaction of Aspergillomarasmine A with Metallo-β-lactamases NDM-1, VIM-2, and IMP-7.探究曲霉茉莉酸A与金属β-内酰胺酶NDM-1、VIM-2和IMP-7的相互作用
ACS Infect Dis. 2018 Feb 9;4(2):135-145. doi: 10.1021/acsinfecdis.7b00106. Epub 2017 Nov 9.
9
A general reaction mechanism for carbapenem hydrolysis by mononuclear and binuclear metallo-β-lactamases.单核和双核金属β-内酰胺酶水解碳青霉烯的一般反应机制。
Nat Commun. 2017 Sep 14;8(1):538. doi: 10.1038/s41467-017-00601-9.
10
F-NMR Reveals the Role of Mobile Loops in Product and Inhibitor Binding by the São Paulo Metallo-β-Lactamase.F-NMR 揭示了 São Paulo 金属β-内酰胺酶在产物和抑制剂结合中移动环的作用。
Angew Chem Int Ed Engl. 2017 Mar 27;56(14):3862-3866. doi: 10.1002/anie.201612185. Epub 2017 Mar 2.