• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种野生烟草叶绿体全基因组的组装及系统发育分析

Assembly and phylogenetic analysis of complete chloroplast genome of a wild tobacco .

作者信息

Lin Haifeng, Bai Di

机构信息

College of Information Science and Technology, Nanjing Forestry University, Nanjing, Jiangsu, China.

College of Engineering, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Nov 6;2(2):778-780. doi: 10.1080/23802359.2017.1398600.

DOI:10.1080/23802359.2017.1398600
PMID:33490477
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7800318/
Abstract

() is an annual herb that induces nicotine, volatiles and phenolics in response to damage. In this study, we assembled the complete chloroplast (cp) genome of with the length of 155,886 bp, which was composed of a large single copy region (LSC) of 86,602 bp, a small copy (SSC) region of 18,518 bp and a pair of inverted repeats (IR) of 25,383 bp. This typical cp genome contains 112 unique genes, including 78 protein-coding genes, 30 tRNA genes and four rRNA genes. Phylogenetic analysis of 32 plant cp genomes based on 76 conserved protein-coding genes shows that is evolutionarily close to , then . The complete cp genome sequence of may provide a crucial foundation for the study of evolution, molecular biology and genetic engineering in species.

摘要

(某植物名称)是一种一年生草本植物,受到损伤时会产生尼古丁、挥发性物质和酚类物质。在本研究中,我们组装了(某植物名称)的完整叶绿体(cp)基因组,其长度为155,886 bp,由一个86,602 bp的大单拷贝区域(LSC)、一个18,518 bp的小单拷贝(SSC)区域和一对25,383 bp的反向重复序列(IR)组成。这个典型的cp基因组包含112个独特基因,包括78个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。基于76个保守蛋白质编码基因对32个植物cp基因组进行的系统发育分析表明,(某植物名称)在进化上与(另一植物名称)接近,其次是(又一植物名称)。(某植物名称)的完整cp基因组序列可能为该物种的进化、分子生物学和基因工程研究提供关键基础。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c57/7800318/7e6fb47623a0/TMDN_A_1398600_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c57/7800318/7e6fb47623a0/TMDN_A_1398600_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c57/7800318/7e6fb47623a0/TMDN_A_1398600_F0001_B.jpg

相似文献

1
Assembly and phylogenetic analysis of complete chloroplast genome of a wild tobacco .一种野生烟草叶绿体全基因组的组装及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Nov 6;2(2):778-780. doi: 10.1080/23802359.2017.1398600.
2
Complete chloroplast genome sequence of Coyote tobacco (, Solanaceae).茄科烟草属烟草的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Nov 6;2(2):761-762. doi: 10.1080/23802359.2017.1398611.
3
Complete chloroplast genome sequence and phylogenetic analysis of × 'Fosteri' (Aquifoliaceae).冬青科ב福斯特氏’的叶绿体全基因组序列及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 31;6(10):2799-2800. doi: 10.1080/23802359.2021.1970637. eCollection 2021.
4
The complete chloroplast genome of var. H. T. Chang (Pentaphylacaceae).长叶水石梓变种(五列木科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Jun 9;8(6):639-642. doi: 10.1080/23802359.2023.2220433. eCollection 2023.
5
The complete mitochondrial genome sequence of an annual wild tobacco .一种一年生野生烟草的完整线粒体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Dec 7;2(2):924-925. doi: 10.1080/23802359.2017.1407686.
6
Comparative chloroplast genome analyses of cultivated and wild Capsicum species shed light on evolution and phylogeny.栽培和野生辣椒属物种的叶绿体基因组比较分析揭示了进化和系统发育关系。
BMC Plant Biol. 2024 Aug 24;24(1):797. doi: 10.1186/s12870-024-05513-7.
7
Comparative analysis of complete chloroplast genome sequences of four major Amorphophallus species.比较分析四种主要魔芋属物种的完整叶绿体基因组序列。
Sci Rep. 2019 Jan 28;9(1):809. doi: 10.1038/s41598-018-37456-z.
8
Assembly and phylogenetic analysis of the complete chloroplast genome sequence of ..的完整叶绿体基因组序列的组装与系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 21;4(2):3679-3680. doi: 10.1080/23802359.2019.1678423.
9
Comparison of different annotation tools for characterization of the complete chloroplast genome of Corylus avellana cv Tombul.不同注释工具在鉴定土耳其榛子 cv Tombul 完整叶绿体基因组特征中的比较。
BMC Genomics. 2019 Nov 20;20(1):874. doi: 10.1186/s12864-019-6253-5.
10
The complete chloroplast genome and phylogenetic analysis of (Lamiaceae).唇形科(唇形科植物)的完整叶绿体基因组及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jul 28;7(7):1384-1386. doi: 10.1080/23802359.2022.2101398. eCollection 2022.

本文引用的文献

1
The complete chloroplast genome sequence of an economic plant .一种经济植物的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Jul 31;2(2):483-485. doi: 10.1080/23802359.2017.1361353.
2
Wild tobacco genomes reveal the evolution of nicotine biosynthesis.野生烟草基因组揭示了尼古丁生物合成的进化。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jun 6;114(23):6133-6138. doi: 10.1073/pnas.1700073114. Epub 2017 May 23.
3
Analysis of the Complete Mitochondrial Genome Sequence of the Diploid Cotton by Comparative Genomics Approaches.
利用比较基因组学方法分析二倍体棉花的线粒体全基因组序列
Biomed Res Int. 2016;2016:5040598. doi: 10.1155/2016/5040598. Epub 2016 Oct 25.
4
Up in smoke: I. Smoke-derived germination cues for postfire annual,Nicotiana attenuata torr. Ex. Watson.化为乌有:一、烟雾衍生的出芽线索,促进火灾后一年生烟草,Nicotiana attenuata torr. Ex. Watson。
J Chem Ecol. 1994 Sep;20(9):2345-71. doi: 10.1007/BF02033207.
5
MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0.MEGA6:分子进化遗传学分析版本 6.0。
Mol Biol Evol. 2013 Dec;30(12):2725-9. doi: 10.1093/molbev/mst197. Epub 2013 Oct 16.
6
Two-fold differences are the detection limit for determining transgene copy numbers in plants by real-time PCR.两倍差异是通过实时PCR测定植物中转基因拷贝数的检测限。
BMC Biotechnol. 2004 Jul 13;4:14. doi: 10.1186/1472-6750-4-14.
7
Automatic annotation of organellar genomes with DOGMA.使用DOGMA对细胞器基因组进行自动注释。
Bioinformatics. 2004 Nov 22;20(17):3252-5. doi: 10.1093/bioinformatics/bth352. Epub 2004 Jun 4.