• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

Want to track pandemic variants faster? Fix the bioinformatics bottleneck.

作者信息

Hodcroft Emma B, De Maio Nicola, Lanfear Rob, MacCannell Duncan R, Minh Bui Quang, Schmidt Heiko A, Stamatakis Alexandros, Goldman Nick, Dessimoz Christophe

出版信息

Nature. 2021 Mar;591(7848):30-33. doi: 10.1038/d41586-021-00525-x.

DOI:10.1038/d41586-021-00525-x
PMID:33649511
Abstract
摘要

相似文献

1
Want to track pandemic variants faster? Fix the bioinformatics bottleneck.想更快追踪新冠病毒变种？解决生物信息学瓶颈问题。
Nature. 2021 Mar;591(7848):30-33. doi: 10.1038/d41586-021-00525-x.
2
India's COVID crisis flags need to forecast variants.印度的新冠危机凸显了预测病毒变种的必要性。
Nature. 2021 Jun;594(7861):9. doi: 10.1038/d41586-021-01427-8.
3
Alarming COVID variants show vital role of genomic surveillance.令人担忧的新冠病毒变种凸显了基因组监测的重要作用。
Nature. 2021 Jan;589(7842):337-338. doi: 10.1038/d41586-021-00065-4.
4
How bad is Omicron? What scientists know so far.奥密克戎毒株有多严重？科学家目前所了解的情况。
Nature. 2021 Dec;600(7888):197-199. doi: 10.1038/d41586-021-03614-z.
5
Coronavirus variants are spreading in India - what scientists know so far.新冠病毒变种正在印度传播——目前科学家所了解的情况。
Nature. 2021 May;593(7859):321-322. doi: 10.1038/d41586-021-01274-7.
6
Will Omicron end the pandemic? Here's what experts say.奥密克戎会终结这场大流行吗？以下是专家们的看法。
Nature. 2022 Feb;602(7895):20-21. doi: 10.1038/d41586-022-00210-7.
7
COVID mink analysis shows mutations are not dangerous - yet.新冠病毒水貂分析表明，目前这些突变尚无危险。
Nature. 2020 Nov;587(7834):340-341. doi: 10.1038/d41586-020-03218-z.
8
COVID vaccines slash viral spread - but Delta is an unknown.新冠疫苗大幅减少病毒传播——但德尔塔毒株情况不明。
Nature. 2021 Aug;596(7870):17-18. doi: 10.1038/d41586-021-02054-z.
9
Evolving threat.不断演变的威胁。
Science. 2021 Aug 20;373(6557):844-849. doi: 10.1126/science.373.6557.844.
10
How severe are Omicron infections?奥密克戎感染有多严重？
Nature. 2021 Dec;600(7890):577-578. doi: 10.1038/d41586-021-03794-8.

引用本文的文献

1
Variant evolution graph: Can we infer how SARS-CoV-2 variants are evolving?变异进化图：我们能否推断出严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）变体是如何进化的？
PLoS One. 2025 Jun 9;20(6):e0323970. doi: 10.1371/journal.pone.0323970. eCollection 2025.
2
Ultrafast classical phylogenetic method beats large protein language models on variant effect prediction.超快经典系统发育方法在变异效应预测方面胜过大型蛋白质语言模型。
Adv Neural Inf Process Syst. 2024;37:130265-130290.
3
Epidemic-induced local awareness behavior inferred from surveys and genetic sequence data.

本文引用的文献

1
Scientists call for fully open sharing of coronavirus genome data.科学家呼吁全面开放共享新冠病毒基因组数据。
Nature. 2021 Feb;590(7845):195-196. doi: 10.1038/d41586-021-00305-7.
2
Establishment and lineage dynamics of the SARS-CoV-2 epidemic in the UK.英国 SARS-CoV-2 疫情的建立和谱系动态。
Science. 2021 Feb 12;371(6530):708-712. doi: 10.1126/science.abf2946. Epub 2021 Jan 8.
3
Genomic Evidence of In-Flight Transmission of SARS-CoV-2 Despite Predeparture Testing.基因组证据表明，尽管在出发前进行了检测，但仍有 SARS-CoV-2 在飞行途中传播。
从调查和基因序列数据推断出的疫情引发的局部认知行为。
Nat Commun. 2025 May 22;16(1):4758. doi: 10.1038/s41467-025-59508-5.
4
Characterizing spatial epidemiology in a heterogeneous transmission landscape using the spatial transmission count statistic.使用空间传播计数统计量来描述异质传播环境中的空间流行病学。
Commun Med (Lond). 2025 May 9;5(1):165. doi: 10.1038/s43856-025-00888-6.
5
Concepts and Methods for Predicting Viral Evolution.预测病毒进化的概念与方法
Methods Mol Biol. 2025;2890:253-290. doi: 10.1007/978-1-0716-4326-6_14.
6
Improved resolution of avian influenza virus using Oxford Nanopore R10 sequencing chemistry.使用牛津纳米孔R10测序技术提高禽流感病毒的分辨率。
Microbiol Spectr. 2024 Nov 7;12(12):e0188024. doi: 10.1128/spectrum.01880-24.
7
Identifying changes in viral fitness using population genetic structure.利用群体遗传结构识别病毒适应性的变化。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Jul 9;121(28):e2410274121. doi: 10.1073/pnas.2410274121. Epub 2024 Jun 27.
8
Concepts and methods for predicting viral evolution.预测病毒进化的概念与方法。
bioRxiv. 2024 Nov 30:2024.03.19.585703. doi: 10.1101/2024.03.19.585703.
9
Concepts and methods for predicting viral evolution.预测病毒进化的概念和方法。
ArXiv. 2024 Nov 27:arXiv:2403.12684v3.
10
Virus sequencing performance during the SARS-CoV-2 pandemic: a retrospective analysis of data from multiple rounds of external quality assessment in Austria.新冠疫情期间的病毒测序表现：奥地利多轮外部质量评估数据的回顾性分析
Front Mol Biosci. 2024 Feb 5;11:1327699. doi: 10.3389/fmolb.2024.1327699. eCollection 2024.
Emerg Infect Dis. 2021 Mar;27(3):687-693. doi: 10.3201/eid2703.204714. Epub 2021 Jan 5.
4
Genomic epidemiology reveals transmission patterns and dynamics of SARS-CoV-2 in Aotearoa New Zealand.基因组流行病学揭示了 SARS-CoV-2 在新西兰的传播模式和动态。
Nat Commun. 2020 Dec 11;11(1):6351. doi: 10.1038/s41467-020-20235-8.
5
Phylogenetic analysis of SARS-CoV-2 in Boston highlights the impact of superspreading events.波士顿地区 SARS-CoV-2 的系统进化分析强调了超级传播事件的影响。
Science. 2021 Feb 5;371(6529). doi: 10.1126/science.abe3261. Epub 2020 Dec 10.
6
No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2.没有证据表明 SARS-CoV-2 反复出现的突变会增加传染性。
Nat Commun. 2020 Nov 25;11(1):5986. doi: 10.1038/s41467-020-19818-2.
7
Stability of SARS-CoV-2 phylogenies.SARS-CoV-2 系统发育的稳定性。
PLoS Genet. 2020 Nov 18;16(11):e1009175. doi: 10.1371/journal.pgen.1009175. eCollection 2020 Nov.
8
Deep Mutational Scanning of SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain Reveals Constraints on Folding and ACE2 Binding.深度突变扫描 SARS-CoV-2 受体结合域揭示了折叠和 ACE2 结合的限制。
Cell. 2020 Sep 3;182(5):1295-1310.e20. doi: 10.1016/j.cell.2020.08.012. Epub 2020 Aug 11.
9
Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution.Nextstrain：实时追踪病原体进化。
Bioinformatics. 2018 Dec 1;34(23):4121-4123. doi: 10.1093/bioinformatics/bty407.
10
Data sharing: Make outbreak research open access.数据共享：使疫情研究开放获取。
Nature. 2015 Feb 26;518(7540):477-9. doi: 10.1038/518477a.