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和 (半翅目:扁蝽科)的完整线粒体基因组:fulgoroidea 中的基因组比较和系统发育推断。

Complete Mitochondrial Genomes of and (Hemiptera: Flatidae): Genomic Comparison and Phylogenetic Inference in Fulgoroidea.

机构信息

Department of Applied Biology, College of Agriculture and Life Sciences, Chonnam National University, Gwangju 61186, Korea.

Experiment and Analysis Division, Honam Regional Office, Animal and Plant Quarantine Agency, Gunsan 54096, Korea.

出版信息

Curr Issues Mol Biol. 2021 Sep 30;43(3):1391-1418. doi: 10.3390/cimb43030099.

DOI:10.3390/cimb43030099
PMID:34698117
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8929015/
Abstract

The complete mitochondrial genomes (mitogenomes) of two DNA barcode-defined haplotypes of and one of (Hemiptera: Flatidae) were sequenced and compared to those of other Fulgoroidea species. Furthermore, the mitogenome sequences were used to reconstruct phylogenetic relationships among fulgoroid families. The three mitogenomes, including that of the available species of Flatidae, commonly possessed distinctive structures in the 1702-1836 bp A+T-rich region, such as two repeat regions at each end and a large centered nonrepeat region. All members of the superfamily Fulgoroidea, including the Flatidae, consistently possessed a motiflike sequence (TAGTA) at the and junction. The phylogenetic analyses consistently recovered the familial relationships of (((((Ricaniidae + Issidae) + Flatidae) + Fulgoridae) + Achilidae) + Derbidae) in the amino acid-based analysis, with the placement of Cixiidae and Delphacidae as the earliest-derived lineages of fulgoroid families, whereas the monophyly of Delphacidae was not congruent between tree-constructing algorithms.

摘要

两段线粒体基因组(mitogenomes)的完整序列被测定并比较,它们分别来自两种 DNA 条码定义的 和 (半翅目:叶蝉科)的单倍型,以及一种 (半翅目:飞虱科)。此外,线粒体基因组序列被用于重建飞虱总科各科之间的系统发育关系。这三个线粒体基因组,包括已有的 科物种,通常在富含 A+T 的 1702-1836bp 区域具有独特的结构,例如每个末端的两个重复区域和一个大的中心非重复区域。所有飞虱总科成员,包括 科,都在 和 交界处一致地具有一个 motiflike 序列(TAGTA)。基于氨基酸的分析一致地恢复了((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((() )))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))。)))))))))))。)))))))))))。))))))))))))。此外,这些均为半胱氨酸、脯氨酸、谷氨酸和赖氨酸残基,它们分别位于血红蛋白分子的 146、147、171 和 172 位。其中,146 和 171 位的两个半胱氨酸残基通过二硫键相连,位于血红蛋白分子的表面,而 172 和 172 位的两个赖氨酸残基则位于血红蛋白分子的内部。

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