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利用Illumina和纳米孔测序数据对鬼笔蘑菇（担子菌门，真菌）进行基因组组装

Genome Assembly of Stinkhorn Mushroom (Basidiomycota, Fungi) Using Illumina and Nanopore Sequencing Data.

作者信息

Ogiso-Tanaka Eri, Itagaki Hiyori, Ohmae Muneyuki, Hosoya Tsuyoshi, Hosaka Kentaro

机构信息

Center for Molecular Biodiversity Research, National Museum of Nature and Science, Tsukuba, Ibaraki, Japan.

Department of Biological Science, Graduate School of Science, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo, Japan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2022 Feb 17;11(2):e0102621. doi: 10.1128/mra.01026-21. Epub 2022 Feb 10.

DOI:10.1128/mra.01026-21
PMID:35142541
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8830316/
Abstract

We report the reference genome of isolate MO-923, which was isolated from Chichijima Island, the Ogasawara (Bonin) Islands, Japan. Oxford Nanopore Technologies MinION and Illumina sequence reads were assembled using NECAT and polished using Pilon to yield a 36.51-Mb genome with 10,625 predicted protein-coding genes.

摘要

我们报告了分离株MO-923的参考基因组，该菌株从日本小笠原（波宁）群岛的父岛分离得到。使用NECAT对牛津纳米孔技术公司的MinION测序读数和Illumina测序读数进行组装，并使用Pilon进行优化，得到了一个36.51兆碱基的基因组，其中预测有10,625个蛋白质编码基因。