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从印度德里亚穆纳河河水样本中分离出的耐硝酸盐菌株PTJIIT1005的基因组特征分析

Genomic characterization of PTJIIT1005, a nitrate tolerant strain isolated from water sample of Yamuna River, Delhi, India.

作者信息

Thakur Preeti, Gauba Pammi

机构信息

Department of Biotechnology, Jaypee Institute of Information & Technology, Noida, Uttar Pradesh, India.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2022 Jun 16;11(6):e0022922. doi: 10.1128/mra.00229-22. Epub 2022 May 26.

DOI:10.1128/mra.00229-22
PMID:35616378
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9202406/
Abstract

Here, we report the genome sequence of PTJIIT1005, isolated from a polluted site on the Yamuna River, Delhi. The genome is complete and consists of ~4.5 Mbp with a GC content of 52.62%, 4,259 protein-coding genes, 76 tRNAs, and 4 rRNAs. Strain PTJIIT1005 shows 98.89% average nucleotide identity (ANI) with Lelliottia amnigena.

摘要

在此，我们报告了从德里亚穆纳河一个污染场地分离出的PTJIIT1005的基因组序列。该基因组是完整的，由约450万个碱基对组成，GC含量为52.62%，有4259个蛋白质编码基因、76个tRNA和4个rRNA。PTJIIT1005菌株与嗜水生勒米诺菌的平均核苷酸同一性（ANI）为98.89%。

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