• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

海洋红藻(红藻门:海膜目)的完整线粒体基因组及系统发育分析

Complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of the marine red alga (Rhodophyta: Halymeniales).

作者信息

Patil Maheshkumar Prakash, Kim Jong-Oh, Kim Kyunghoi, Kim Young-Ryun, Yoon Seokjin

机构信息

Industry-University Cooperation Foundation, Pukyong National University, Busan, Republic of Korea.

Department of Microbiology, Pukyong National University, Busan, Republic of Korea.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jul 28;7(7):1387-1388. doi: 10.1080/23802359.2022.2101399. eCollection 2022.

DOI:10.1080/23802359.2022.2101399
PMID:35923632
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9341338/
Abstract

((Harvey) Kawaguchi & Wang, 2002) is a red alga in the order Halymeniales of the phylum Rhodophyta. The entire mitogenome of was sequenced and compared to related Halymeniales species. The entire circular-mitogenome is 25,988 bp long, has 27.59% GC content, and comprises 25 protein-coding genes (CDS), 23 transfer RNA (tRNA) genes, and three ribosomal RNA (rRNA) genes. In terms of gene synteny and tRNA composition, the mitogenome differs significantly from that of . Phylogenetic analysis shows mitogenome in a branch sister to , indicating a close relationship with other Halymeniales species.

摘要

((哈维)川口和王,2002年)是红藻门海膜目下的一种红藻。对其整个线粒体基因组进行了测序,并与相关的海膜目物种进行了比较。整个环状线粒体基因组长度为25,988 bp,GC含量为27.59%,包含25个蛋白质编码基因(CDS)、23个转运RNA(tRNA)基因和3个核糖体RNA(rRNA)基因。在基因同线性和tRNA组成方面,该线粒体基因组与[具体物种]的线粒体基因组有显著差异。系统发育分析表明,该线粒体基因组位于与[具体物种]姐妹分支中,表明与其他海膜目物种关系密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/289d/9341338/64bbc307c00e/TMDN_A_2101399_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/289d/9341338/64bbc307c00e/TMDN_A_2101399_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/289d/9341338/64bbc307c00e/TMDN_A_2101399_F0001_B.jpg

相似文献

1
Complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of the marine red alga (Rhodophyta: Halymeniales).海洋红藻(红藻门:海膜目)的完整线粒体基因组及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jul 28;7(7):1387-1388. doi: 10.1080/23802359.2022.2101399. eCollection 2022.
2
Complete mitochondrial genome of and comparison with related species in Halymeniales (Rhodophyta).海膜目(红藻门)某物种的完整线粒体基因组及其与相关物种的比较。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Apr 8;6(4):1365-1366. doi: 10.1080/23802359.2021.1908866.
3
Complete mitochondrial genome of the marine red alga Grateloupia angusta (Halymeniales).海洋红藻狭叶蜈蚣藻(海膜目)的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA. 2014 Aug;25(4):269-70. doi: 10.3109/19401736.2013.800500. Epub 2013 Jun 21.
4
The complete sequence of the mitochondrial DNA and phylogenetic analysis of the marine red alga (Rhodophyta: Halymeniales).海洋红藻(红藻门:海膜目)线粒体DNA的全序列及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Feb 3;8(2):222-223. doi: 10.1080/23802359.2022.2160667. eCollection 2023.
5
Mitogenome features and phylogenetic analysis of red algae, (Rhodophyta, Halymeniales).红藻(红藻门,海膜目)的线粒体基因组特征与系统发育分析。
J Genet. 2024;103.
6
Complete Mitogenome Sequencing, Annotation, and Phylogeny of , a Red Alga with Intronic Gene.具有内含子基因的红藻的完整线粒体基因组测序、注释及系统发育分析
Life (Basel). 2023 Jul 28;13(8):1642. doi: 10.3390/life13081642.
7
The complete mitochondrial genome of the terebellid polychaete (Polychaeta; Terebellidae).蛰龙介科多毛纲动物(多毛纲;蛰龙介科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 30;7(11):1919-1921. doi: 10.1080/23802359.2022.2136981. eCollection 2022.
8
Complete mitochondrial genome of sublittoral macroalga Rhodymenia pseudopalmata (Rhodymeniales, Rhodophyta).潮下带大型海藻拟掌状石花菜(红皮藻目,红藻门)的完整线粒体基因组
Mitochondrial DNA. 2014 Aug;25(4):273-4. doi: 10.3109/19401736.2013.800501. Epub 2013 Jun 21.
9
Characterization of the complete mitochondrial genome of Macrotocinclus affinis (Siluriformes; Loricariidae) and phylogenetic studies of Siluriformes.大口脂鲤属(鲶形目;甲鲶科)的完整线粒体基因组特征及鲶形目鱼类的系统发育研究。
Mol Biol Rep. 2021 Jan;48(1):677-689. doi: 10.1007/s11033-020-06120-z. Epub 2021 Jan 13.
10
Characterization and phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of the red alga, Harvey 1860 (Gracilariales: Gracilariaceae) from Vietnam.来自越南的红藻哈维藻(Harvey 1860)(江蓠目:江蓠科)线粒体全基因组的特征分析与系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2024 Sep 9;9(9):1196-1200. doi: 10.1080/23802359.2024.2399925. eCollection 2024.

引用本文的文献

1
Complete Mitogenome Sequencing, Annotation, and Phylogeny of , a Red Alga with Intronic Gene.具有内含子基因的红藻的完整线粒体基因组测序、注释及系统发育分析
Life (Basel). 2023 Jul 28;13(8):1642. doi: 10.3390/life13081642.

本文引用的文献

1
Suppressed IFN-γ- and TNF-α-Induced Inflammation in Human Keratinocytes via Down-Regulation of the NF-κB and STAT1 Pathways.通过下调 NF-κB 和 STAT1 通路抑制人角质形成细胞中 IFN-γ 和 TNF-α 诱导的炎症反应。
Molecules. 2022 Mar 11;27(6):1836. doi: 10.3390/molecules27061836.
2
MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11.MEGA11:分子进化遗传学分析版本 11。
Mol Biol Evol. 2021 Jun 25;38(7):3022-3027. doi: 10.1093/molbev/msab120.
3
Complete mitochondrial genome of and comparison with related species in Halymeniales (Rhodophyta).
海膜目(红藻门)某物种的完整线粒体基因组及其与相关物种的比较。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Apr 8;6(4):1365-1366. doi: 10.1080/23802359.2021.1908866.
4
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.