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NEMAR:一个神经电磁数据的开放获取数据、工具和计算资源操作平台。

NEMAR: an open access data, tools and compute resource operating on neuroelectromagnetic data.

机构信息

Swartz Center of Computational Neuroscience, INC, UCSD, La Jolla, CA 92093-0559, USA.

CERCO, CNRS, Paul Sabatier University, Toulouse 31400, France.

出版信息

Database (Oxford). 2022 Nov 11;2022. doi: 10.1093/database/baac096.

DOI:10.1093/database/baac096
PMID:36367313
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9650770/
Abstract

To preserve scientific data created by publicly and/or philanthropically funded research projects and to make it ready for exploitation using recent and ongoing advances in advanced and large-scale computational modeling methods, publicly available data must use in common, now-evolving standards for formatting, identifying and annotating should share data. The OpenNeuro.org archive, built first as a repository for magnetic resonance imaging data based on the Brain Imaging Data Structure formatting standards, aims to house and share all types of human neuroimaging data. Here, we present NEMAR.org, a web gateway to OpenNeuro data for human neuroelectromagnetic data. NEMAR allows users to search through, visually explore and assess the quality of shared electroencephalography (EEG), magnetoencephalography and intracranial EEG data and then to directly process selected data using high-performance computing resources of the San Diego Supercomputer Center via the Neuroscience Gateway (nsgportal.org, NSG), a freely available web portal to high-performance computing serving a variety of neuroscientific analysis environments and tools. Combined, OpenNeuro, NEMAR and NSG form an efficient, integrated data, tools and compute resource for human neuroimaging data analysis and meta-analysis. Database URL: https://nemar.org.

摘要

为了保存由公共和/或慈善资助的研究项目创建的科学数据,并利用先进和大规模计算建模方法的最新进展对其进行开发利用,公开可用的数据必须使用通用的、不断发展的格式、识别和注释标准。OpenNeuro.org 档案库最初是作为基于脑成像数据结构格式标准的磁共振成像数据存储库构建的,旨在存储和共享所有类型的人类神经影像学数据。在这里,我们介绍了 NEMAR.org,这是一个用于人类神经电磁数据的 OpenNeuro 数据的网络网关。NEMAR 允许用户搜索、可视化探索和评估共享脑电图 (EEG)、脑磁图和颅内 EEG 数据的质量,然后通过圣地亚哥超级计算机中心的高性能计算资源直接处理选定的数据,该资源通过神经科学门户 (nsgportal.org,NSG) 提供,这是一个免费的高性能计算门户,为各种神经科学分析环境和工具提供服务。OpenNeuro、NEMAR 和 NSG 相结合,为人类神经影像学数据分析和荟萃分析提供了高效、集成的数据、工具和计算资源。数据库 URL:https://nemar.org。

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