用于DNA序列操作的数据结构。
Data structures for DNA sequence manipulation.
作者信息
Lawrence C B
出版信息
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):205-16. doi: 10.1093/nar/14.1.205.
Abstract
Two data structures designated Fragment and Construct are described. The Fragment data structure defines a continuous nucleic acid sequence from a unique genetic origin. The Construct defines a continuous sequence composed of sequences from multiple genetic origins. These data structures are manipulated by a set of software tools to simulate the construction of mosaic recombinant DNA molecules. They are also used as an interface between sequence data banks and analytical programs.
摘要
描述了两种数据结构，分别为片段（Fragment）和构建体（Construct）。片段数据结构定义了来自唯一遗传来源的连续核酸序列。构建体定义了由来自多个遗传来源的序列组成的连续序列。通过一组软件工具来操作这些数据结构，以模拟镶嵌重组DNA分子的构建。它们还用作序列数据库与分析程序之间的接口。
相似文献
1
用于DNA序列操作的数据结构。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):205-16. doi: 10.1093/nar/14.1.205.
2
一个用于DNA和蛋白质序列操作与分析的便捷且适应性强的微机环境。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):479-88. doi: 10.1093/nar/14.1.479.
3
GENEUS是一个用于DNA和蛋白质序列分析的计算机系统，包含一个用于EMBL数据库的信息检索系统。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):273-84. doi: 10.1093/nar/14.1.273.
4
甲基化阻断及综合DNA分析程序的其他改进
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):255-64. doi: 10.1093/nar/14.1.255.
5
一套适用于VAX的综合序列分析程序。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 1):387-95. doi: 10.1093/nar/12.1part1.387.
6
DNA和蛋白质序列的计算机操作。
Curr Protoc Mol Biol. 2001 May;Chapter 7:Unit7.7. doi: 10.1002/0471142727.mb0707s30.
7
用于处理核酸序列的计算机程序。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 1):379-86. doi: 10.1093/nar/12.1part1.379.
8
用于发表的DNA序列自动制备。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):65-73. doi: 10.1093/nar/14.1.65.
9
一个用于PDP - 11的FORTRAN IV语言的DNA序列分析综合程序包。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):239-54. doi: 10.1093/nar/14.1.239.
10
用于揭示B-DNA双螺旋三维总体结构对一级结构依赖性的计算机图形程序。
Nucleic Acids Res. 1986 Jan 10;14(1):381-7. doi: 10.1093/nar/14.1.381.
引用本文的文献
1
人群中没有智慧：大数据时代的基因组注释——现状与未来展望。
Microb Biotechnol. 2018 Jul;11(4):588-605. doi: 10.1111/1751-7915.13284. Epub 2018 May 28.
本文引用的文献
1
一种用于计算机核酸序列存储、检索和操作的设计。
Nucleic Acids Res. 1982 May 11;10(9):3013-24. doi: 10.1093/nar/10.9.3013.
2
一种面向DNA的计算机语言的形式化描述。
Nucleic Acids Res. 1982 Jan 11;10(1):69-84. doi: 10.1093/nar/10.1.69.
3
GENESIS，一个基于知识的用于遗传数据表示和实验规划的基因工程模拟系统。
Nucleic Acids Res. 1982 Jan 11;10(1):323-40. doi: 10.1093/nar/10.1.323.
4
限制酶切位点和功能位点水平上的重组DNA数据管理
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):739-50. doi: 10.1093/nar/12.1part2.739.
5
KLONER：一个通过限制酶切图谱操作来模拟重组DNA策略的计算机程序。
Nucleic Acids Res. 1984 Jan 11;12(1 Pt 2):731-7. doi: 10.1093/nar/12.1part2.731.
Zotero 插件