• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

白英（茄科）的基因组序列。

The genome sequence of bittersweet, L. (Solanaceae).

作者信息

Christenhusz Maarten J M

机构信息

Royal Botanic Gardens Kew, Richmond, England, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2023 Sep 19;8:409. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20004.1. eCollection 2023.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.20004.1
PMID:37869734
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10585204/
Abstract

We present a genome assembly from an individual (bittersweet; Eudicot; Magnoliopsida; Solanales; Solanaceae). The genome sequence is 946.3 megabases in span. Most of the assembly is scaffolded into 12 chromosomal pseudomolecules. The mitochondrial and plastid genomes have also been assembled, with lengths of 459.22 kilobases and 161.98 kilobases respectively.

摘要

我们展示了一个来自个体（苦甜茄；真双子叶植物；木兰纲；茄目；茄科）的基因组组装。基因组序列跨度为946.3兆碱基。大部分组装序列被构建成12条染色体假分子。线粒体和质体基因组也已被组装，长度分别为459.22千碱基和161.98千碱基。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/5ae79fb8ccda/wellcomeopenres-8-22150-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/25a208aad1f3/wellcomeopenres-8-22150-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/078fb200a150/wellcomeopenres-8-22150-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/7b16eae0a219/wellcomeopenres-8-22150-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/ea407b8b348a/wellcomeopenres-8-22150-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/5ae79fb8ccda/wellcomeopenres-8-22150-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/25a208aad1f3/wellcomeopenres-8-22150-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/078fb200a150/wellcomeopenres-8-22150-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/7b16eae0a219/wellcomeopenres-8-22150-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/ea407b8b348a/wellcomeopenres-8-22150-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/7c09/10585204/5ae79fb8ccda/wellcomeopenres-8-22150-g0004.jpg

相似文献

1
The genome sequence of bittersweet, L. (Solanaceae).白英（茄科）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Sep 19;8:409. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20004.1. eCollection 2023.
2
The genome sequence of the English holly, L. (Aquifoliaceae).英国冬青（冬青科）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Jan 3;9:1. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20748.1. eCollection 2024.
3
The chloroplast genome sequence of bittersweet (Solanum dulcamara): Plastid genome structure evolution in Solanaceae.甜叶菊（Solanum dulcamara）的叶绿体基因组序列：茄科植物质体基因组结构进化。
PLoS One. 2018 Apr 25;13(4):e0196069. doi: 10.1371/journal.pone.0196069. eCollection 2018.
4
The genome sequence of common knotgrass, L. (Polygonaceae).萹蓄（蓼科）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 1;9:112. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21001.1. eCollection 2024.
5
The genome sequence of common fleabane, (L.) Bernh. (Asteraceae).小飞蓬（Conyza canadensis (L.) Cronquist）（菊科）的基因组序列。 （注：原英文中的属名表述有误，正确的小飞蓬属名是Conyza，种加词是canadensis ，这里按照正确内容翻译并补充完整了拉丁学名）
Wellcome Open Res. 2023 Oct 12;8:447. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20003.1. eCollection 2023.
6
The genome sequence of wood avens, L., 1753.路边青的基因组序列，林奈，1753年。
Wellcome Open Res. 2024 Jul 16;8:371. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19664.2. eCollection 2023.
7
The genome sequence of common ivy, L., 1753.常春藤（学名：Hedera helix L.，1753年命名）的基因组序列
Wellcome Open Res. 2023 Jul 26;8:325. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19662.1. eCollection 2023.
8
The genome sequence of field madder, L., 1753 (Rubiaceae).1753年收录的（茜草科）田茜的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 1;9:126. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21027.1. eCollection 2024.
9
The genome sequence of the Annual Mercury, L., 1753 (Euphorbiaceae).千根癀（大戟科，千根癀属，1753年林奈命名）的基因组序列
Wellcome Open Res. 2024 Mar 1;9:102. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21004.1. eCollection 2024.
10
The genome sequence of rosebay willowherb (L.) Scop., 1771 (syn. L., 1753) (Onagraceae).柳叶菜（L.）斯科波，1771年（同物异名：L.，1753年）（柳叶菜科）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 20;9:163. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21163.1. eCollection 2024.

引用本文的文献

1
Assembly and annotation of Solanum dulcamara and Solanum nigrum plant genomes, two nightshades with contrasting susceptibilities to Ralstonia solanacearum.白英和龙葵植物基因组的组装与注释，这两种茄科植物对青枯雷尔氏菌的易感性形成对比。
G3 (Bethesda). 2025 Jul 9;15(7). doi: 10.1093/g3journal/jkaf119.

本文引用的文献

1
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新：用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
2
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species.致力于完成所有脊椎动物物种的完整且无错误的基因组组装。
Nature. 2021 Apr;592(7856):737-746. doi: 10.1038/s41586-021-03451-0. Epub 2021 Apr 28.
3
Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm.
使用带有 hifiasm 的相定装配图进行单体型解析从头组装。
Nat Methods. 2021 Feb;18(2):170-175. doi: 10.1038/s41592-020-01056-5. Epub 2021 Feb 1.
4
MBG: Minimizer-based sparse de Bruijn Graph construction.MBG：基于最小化器的稀疏德布鲁因图构建。
Bioinformatics. 2021 Aug 25;37(16):2476-2478. doi: 10.1093/bioinformatics/btab004.
5
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
6
The Application of Flow Cytometry for Estimating Genome Size, Ploidy Level Endopolyploidy, and Reproductive Modes in Plants.流式细胞术在植物基因组大小估计、倍性水平、内多倍体和繁殖方式中的应用。
Methods Mol Biol. 2021;2222:325-361. doi: 10.1007/978-1-0716-0997-2_17.
7
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies.Merqury：基因组组装的无参考质量、完整性和相位评估。
Genome Biol. 2020 Sep 14;21(1):245. doi: 10.1186/s13059-020-02134-9.
8
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.
9
Identifying and removing haplotypic duplication in primary genome assemblies.鉴定和去除初级基因组组装中的单倍型重复。
Bioinformatics. 2020 May 1;36(9):2896-2898. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa025.
10
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly.将 Hi-C 链接与组装图整合用于染色体尺度的组装。
PLoS Comput Biol. 2019 Aug 21;15(8):e1007273. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007273. eCollection 2019 Aug.