• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

从佐治亚州伦普金县土壤中分离出的噬菌体鲁奇（AS1）的基因组序列与注释

Genome sequence and annotation of phage Ruchi (AS1) isolated from soil in Lumpkin County, Georgia.

作者信息

Tatum Brooke, Murray Payton, Bicknell Claire, Webb Shane A, Kanak Alison

机构信息

Department of Biology, University of North Georgia, Dahlonega, Georgia, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Apr 11;13(4):e0122423. doi: 10.1128/mra.01224-23. Epub 2024 Mar 11.

DOI:10.1128/mra.01224-23
PMID:38466103
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11008183/
Abstract

Ruchi a temperate, AS1 subcluster bacteriophage isolated in Lumpkin County, Georgia using host , possesses a genome of 38,571 bp and 67.7% GC. Annotation of this virus revealed 64 predicted reading frames, no predicted tRNA genes, and a close evolutionary relationship to AS1 phage Basilisk.

摘要

鲁奇是一种温和型噬菌体，属于AS1亚群，于佐治亚州伦普金县使用宿主分离得到，其基因组有38571个碱基对，GC含量为67.7%。对这种病毒的注释显示有64个预测的阅读框，没有预测的tRNA基因，并且与AS1噬菌体巴兹尔isk有密切的进化关系。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0cc5/11008183/4f4e732e50dd/mra.01224-23.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0cc5/11008183/4f4e732e50dd/mra.01224-23.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0cc5/11008183/4f4e732e50dd/mra.01224-23.f001.jpg

相似文献

1
Genome sequence and annotation of phage Ruchi (AS1) isolated from soil in Lumpkin County, Georgia.从佐治亚州伦普金县土壤中分离出的噬菌体鲁奇（AS1）的基因组序列与注释
Microbiol Resour Announc. 2024 Apr 11;13(4):e0122423. doi: 10.1128/mra.01224-23. Epub 2024 Mar 11.
2
Genome sequence and annotation of phage Vulpecula (AS1) isolated from soil in Dahlonega, Georgia.从佐治亚州达洛尼加土壤中分离出的噬菌体Vulpecula（AS1）的基因组序列及注释
Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0009024. doi: 10.1128/mra.00090-24. Epub 2024 Feb 22.
3
Genome sequence of bacteriophage Janeemi isolated on from soil collected in New York.从纽约采集的土壤中分离出的噬菌体Janeemi的基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2024 Jul 18;13(7):e0017724. doi: 10.1128/mra.00177-24. Epub 2024 Jun 11.
4
Genome and characteristics of AZ cluster phage London.AZ簇噬菌体伦敦株的基因组与特性
Microbiol Resour Announc. 2023 Nov 16;12(11):e0081923. doi: 10.1128/MRA.00819-23. Epub 2023 Oct 31.
5
Genome Sequence and Annotation of Bacteriophage Tokki Isolated on Arthrobacter globiformis B-2979.从球形节杆菌B-2979中分离出的噬菌体Tokki的基因组序列与注释
Microbiol Resour Announc. 2022 Oct 20;11(10):e0080322. doi: 10.1128/mra.00803-22. Epub 2022 Sep 19.
6
Genomic sequence identification of phage Ascela.噬菌体阿斯克拉的基因组序列鉴定
Microbiol Resour Announc. 2023 Nov 16;12(11):e0077623. doi: 10.1128/MRA.00776-23. Epub 2023 Oct 31.
7
Genome Sequence of Bacteriophage Adumb2043, Isolated from Arthrobacter globiformis in Southern Colorado.从科罗拉多州南部球形节杆菌中分离出的噬菌体Adumb2043的基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2021 Oct 14;10(41):e0077621. doi: 10.1128/MRA.00776-21.
8
Genome sequence of bacteriophage Aoka, a cluster FO phage isolated using .使用……分离得到的簇FO噬菌体Aoka的基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2023 Oct 19;12(10):e0045423. doi: 10.1128/MRA.00454-23. Epub 2023 Sep 22.
9
Complete Genome Sequence of Phage GantcherGoblin Exhibits Both Conservation with Subcluster AU6 Phages and Genetic Novelty.噬菌体GantcherGoblin的全基因组序列显示出与亚群AU6噬菌体的保守性以及遗传新颖性。
Microbiol Resour Announc. 2022 Dec 15;11(12):e0077122. doi: 10.1128/mra.00771-22. Epub 2022 Nov 2.
10
Genome sequence of phage MaGuCo.噬菌体MaGuCo的基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0117923. doi: 10.1128/mra.01179-23. Epub 2024 Feb 20.

本文引用的文献

1
Reassessment of Historical Clinical Trials Supports the Effectiveness of Phage Therapy.历史临床研究的再评估支持噬菌体疗法的有效性。
Clin Microbiol Rev. 2022 Dec 21;35(4):e0006222. doi: 10.1128/cmr.00062-22. Epub 2022 Sep 7.
2
The potential of bacteriophage therapy in the treatment of paediatric respiratory infections.噬菌体疗法在治疗儿童呼吸道感染中的潜力。
Paediatr Respir Rev. 2022 Dec;44:70-77. doi: 10.1016/j.prrv.2022.02.001. Epub 2022 Feb 12.
3
tRNAscan-SE 2.0: improved detection and functional classification of transfer RNA genes.
tRNAscan-SE 2.0：改进的 tRNA 基因检测和功能分类。
Nucleic Acids Res. 2021 Sep 20;49(16):9077-9096. doi: 10.1093/nar/gkab688.
4
Characterization and Genome Sequence of the Mycobacteriophage Donny.分枝杆菌噬菌体唐尼的特性鉴定与基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2020 Jul 23;9(30):e00373-20. doi: 10.1128/MRA.00373-20.
5
Sequencing, Assembling, and Finishing Complete Bacteriophage Genomes.完整噬菌体基因组的测序、组装与完成
Methods Mol Biol. 2018;1681:109-125. doi: 10.1007/978-1-4939-7343-9_9.
6
A broadly implementable research course in phage discovery and genomics for first-year undergraduate students.一门面向本科一年级学生的、可广泛实施的噬菌体发现与基因组学研究课程。
mBio. 2014 Feb 4;5(1):e01051-13. doi: 10.1128/mBio.01051-13.
7
Phamerator: a bioinformatic tool for comparative bacteriophage genomics.Phamerator：一种用于比较噬菌体基因组学的生物信息学工具。
BMC Bioinformatics. 2011 Oct 12;12:395. doi: 10.1186/1471-2105-12-395.
8
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer.使用Glimmer识别细菌基因和内共生体DNA。
Bioinformatics. 2007 Mar 15;23(6):673-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btm009. Epub 2007 Jan 19.
9
The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction.用于蛋白质同源性检测和结构预测的HHpred交互式服务器。
Nucleic Acids Res. 2005 Jul 1;33(Web Server issue):W244-8. doi: 10.1093/nar/gki408.
10
ARAGORN, a program to detect tRNA genes and tmRNA genes in nucleotide sequences.ARAGORN，一个用于在核苷酸序列中检测tRNA基因和tmRNA基因的程序。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 2;32(1):11-6. doi: 10.1093/nar/gkh152. Print 2004.