• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

用于比较系统发育学的基于非对称聚类的度量方法。

Asymmetric Cluster-Based Measures for Comparative Phylogenetics.

作者信息

Wagle Sanket, Markin Alexey, Górecki Paweł, Anderson Tavis K, Eulenstein Oliver

机构信息

Department of Computer Science, Iowa State University, Ames, Iowa, USA.

National Animal Disease Center, USDA-ARS, Ames, Iowa, USA.

出版信息

J Comput Biol. 2024 Apr;31(4):312-327. doi: 10.1089/cmb.2023.0338. Epub 2024 Apr 17.

DOI:10.1089/cmb.2023.0338
PMID:38634854
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11057527/
Abstract
摘要
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/da88e606b5ab/cmb.2023.0338_figure6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/ef8bed0b13ef/cmb.2023.0338_figure1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/43d7d67cc484/cmb.2023.0338_figure2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/a62f53902090/cmb.2023.0338_figure3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/203f7372ec3d/cmb.2023.0338_figure4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/13c5f017a2f8/cmb.2023.0338_figure5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/da88e606b5ab/cmb.2023.0338_figure6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/ef8bed0b13ef/cmb.2023.0338_figure1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/43d7d67cc484/cmb.2023.0338_figure2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/a62f53902090/cmb.2023.0338_figure3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/203f7372ec3d/cmb.2023.0338_figure4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/13c5f017a2f8/cmb.2023.0338_figure5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ecf1/11057527/da88e606b5ab/cmb.2023.0338_figure6.jpg

相似文献

1
Asymmetric Cluster-Based Measures for Comparative Phylogenetics.用于比较系统发育学的基于非对称聚类的度量方法。
J Comput Biol. 2024 Apr;31(4):312-327. doi: 10.1089/cmb.2023.0338. Epub 2024 Apr 17.
2
Invariant transformers of Robinson and Foulds distance matrices for Convolutional Neural Network.不变的 Robinson 和 Foulds 距离矩阵变换用于卷积神经网络。
J Bioinform Comput Biol. 2022 Aug;20(4):2250012. doi: 10.1142/S0219720022500123. Epub 2022 Jul 6.
3
Fast local search for unrooted Robinson-Foulds supertrees.无根 Robinson-Foulds 超级树的快速局部搜索。
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform. 2012 Jul-Aug;9(4):1004-13. doi: 10.1109/TCBB.2012.47.
4
Are the duplication cost and Robinson-Foulds distance equivalent?重复成本与罗宾逊-福尔兹距离相等吗？
J Comput Biol. 2014 Aug;21(8):578-90. doi: 10.1089/cmb.2014.0021. Epub 2014 Jul 2.
5
Metrics for phylogenetic networks I: generalizations of the Robinson-Foulds metric.系统发育网络的度量标准 I：罗宾逊 - 福尔兹度量标准的推广
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform. 2009 Jan-Mar;6(1):46-61. doi: 10.1109/TCBB.2008.70.
6
Building alternative consensus trees and supertrees using k-means and Robinson and Foulds distance.使用 K-均值和罗宾逊-福尔德斯距离构建替代共识树和超级树。
Bioinformatics. 2022 Jun 27;38(13):3367-3376. doi: 10.1093/bioinformatics/btac326.
7
The -Robinson-Foulds Dissimilarity Measures for Comparison of Labeled Trees.用于比较带标签树的罗宾逊 - 福尔兹差异度量
J Comput Biol. 2024 Apr;31(4):328-344. doi: 10.1089/cmb.2023.0312. Epub 2024 Jan 25.
8
The Generalized Robinson-Foulds Distance for Phylogenetic Trees.系统发育树的广义 Robinson-Foulds 距离。
J Comput Biol. 2021 Dec;28(12):1181-1195. doi: 10.1089/cmb.2021.0342. Epub 2021 Oct 29.
9
A Linear Time Solution to the Labeled Robinson-Foulds Distance Problem.线性时间解决带标签的罗宾逊-福尔德斯距离问题。
Syst Biol. 2022 Oct 12;71(6):1391-1403. doi: 10.1093/sysbio/syac028.
10
Robinson-Foulds supertrees.罗宾逊-福尔兹超树
Algorithms Mol Biol. 2010 Feb 24;5:18. doi: 10.1186/1748-7188-5-18.

引用本文的文献

1
The path-label reconciliation (PLR) dissimilarity measure for gene trees.用于基因树的路径标签协调（PLR）差异度量。
Algorithms Mol Biol. 2025 Aug 19;20(1):16. doi: 10.1186/s13015-025-00284-8.

本文引用的文献

1
A Practical Guide to Design and Assess a Phylogenomic Study.《系统发育基因组学研究设计与评估实用指南》
Genome Biol Evol. 2022 Sep 6;14(9). doi: 10.1093/gbe/evac129.
2
Classes of explicit phylogenetic networks and their biological and mathematical significance.显式系统发育网络的分类及其生物学和数学意义。
J Math Biol. 2022 May 3;84(6):47. doi: 10.1007/s00285-022-01746-y.
3
Dissecting Incongruence between Concatenation- and Quartet-Based Approaches in Phylogenomic Data.剖析系统发育基因组数据中基于串联和四联体的方法之间的不一致性。
Syst Biol. 2021 Aug 11;70(5):997-1014. doi: 10.1093/sysbio/syab011.
4
Information theoretic generalized Robinson-Foulds metrics for comparing phylogenetic trees.基于信息论的广义 Robinson-Foulds 度量在比较系统发生树中的应用。
Bioinformatics. 2020 Dec 22;36(20):5007-5013. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa614.
5
Comparing Phylogenetic Trees by Matching Nodes Using the Transfer Distance Between Partitions.通过使用分区之间的转移距离匹配节点来比较系统发育树。
J Comput Biol. 2017 May;24(5):422-435. doi: 10.1089/cmb.2016.0204. Epub 2017 Feb 8.
6
Inference of Transmission Network Structure from HIV Phylogenetic Trees.从HIV系统发育树推断传播网络结构
PLoS Comput Biol. 2017 Jan 13;13(1):e1005316. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005316. eCollection 2017 Jan.
7
Phylo.io: Interactive Viewing and Comparison of Large Phylogenetic Trees on the Web.Phylo.io：在网络上对大型系统发育树进行交互式查看和比较。
Mol Biol Evol. 2016 Aug;33(8):2163-6. doi: 10.1093/molbev/msw080. Epub 2016 Apr 19.
8
A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing.利用靶向下一代 DNA 测序技术对鸟类（Aves）进行全面的系统发育分析。
Nature. 2015 Oct 22;526(7574):569-73. doi: 10.1038/nature15697. Epub 2015 Oct 7.
9
Phylotranscriptomic analysis of the origin and early diversification of land plants.陆地植物起源与早期多样化的系统发育转录组学分析
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Nov 11;111(45):E4859-68. doi: 10.1073/pnas.1323926111. Epub 2014 Oct 29.
10
Efficient error correction algorithms for gene tree reconciliation based on duplication, duplication and loss, and deep coalescence.基于复制、复制和丢失以及深度合并的基因树 reconcile 的高效纠错算法。
BMC Bioinformatics. 2012 Jun 25;13 Suppl 10(Suppl 10):S11. doi: 10.1186/1471-2105-13-S10-S11.