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使用 PhenoCycler-Fusion 对福尔马林固定石蜡包埋的人类组织进行高通量、全玻片成像的方案。

Protocol for high-plex, whole-slide imaging of human formalin-fixed paraffin-embedded tissue using PhenoCycler-Fusion.

机构信息

Queensland Spatial Biology Centre, Wesley Research Institute, Level 8 East Wing, The Wesley Hospital, Auchenflower, QLD 4066, Australia; Frazer Institute, Faculty of Medicine, The University of Queensland, Brisbane, QLD 4102, Australia.

Akoya Biosciences, The Spatial Biology Company, Marlborough, MA, USA.

出版信息

STAR Protoc. 2024 Sep 20;5(3):103226. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103226. Epub 2024 Jul 18.

DOI:10.1016/j.xpro.2024.103226
PMID:39031553
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11314888/
Abstract

Single-cell spatial analysis of proteins is rapidly becoming increasingly important in revealing biological insights. Here, we present a protocol for automated high-plex multi-slide immunofluorescence staining and imaging of human head and neck cancer formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) sections using PhenoCycler-Fusion 2.0 technology. We describe steps for preparing human head and neck cancer FFPE tissues, staining with a panel of immunophenotyping markers, and Flow Cell assembly. We then detail procedures for setting up for a PhenoCycler-Fusion run, post-run Flow Cell removal, and downstream analyses. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Jhaveri et al..

摘要

单细胞空间分析技术在揭示生物学见解方面的作用日益重要。在这里，我们提出了一种使用 PhenoCycler-Fusion 2.0 技术对人头颈癌福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）切片进行自动化高内涵多幻灯片免疫荧光染色和成像的方案。我们描述了用人头颈癌 FFPE 组织进行准备、用免疫表型标志物进行染色以及 Flow Cell 组装的步骤。然后，我们详细介绍了 PhenoCycler-Fusion 运行的设置、Flow Cell 去除以及下游分析的程序。有关该方案使用和执行的完整详细信息，请参阅 Jhaveri 等人的研究。

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