Suppr超能文献

使用秀丽隐杆线虫进行 RNA 测序实验分析工作流程。

RNA Sequencing Experimental Analysis Workflow Using Caenorhabditis elegans.

机构信息

Department of Biological Sciences, University of North Texas, Denton, TX, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2024;2812:115-141. doi: 10.1007/978-1-0716-3886-6_6.

Abstract

RNA sequencing is an approach to transcriptomic profiling that enables the detection of differentially expressed genes in response to genetic mutation or experimental treatment, among other uses. Here we describe a method for the use of a customizable, user-friendly bioinformatic pipeline to identify differentially expressed genes in RNA sequencing data obtained from C. elegans, with attention to the improvement in reproducibility and accuracy of results.

摘要

RNA 测序是一种转录组谱分析方法,可用于检测基因变异或实验处理等因素引起的差异表达基因。在这里,我们描述了一种使用可定制、用户友好的生物信息学管道来识别从秀丽隐杆线虫获得的 RNA 测序数据中差异表达基因的方法,重点是提高结果的可重复性和准确性。

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