• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

对祖先卟啉单胞菌属菌毛蛋白Ffp1的计算机模拟分析显示，其与菌毛蛋白（Fim）和微纤毛蛋白（Mfa）存在差异。

In silico analysis of Ffp1, an ancestral Porphyromonas spp. fimbrillin, shows differences with Fim and Mfa.

作者信息

Acuña-Amador Luis, Barloy-Hubler Frederique

机构信息

Laboratorio de Investigación en Bacteriología Anaerobia, Centro de Investigación en Enfermedades Tropicales, Facultad de Microbiología, Universidad de Costa Rica, San José, Costa Rica.

Université de Rennes 1, CNRS, UMR 6553 ECOBIO (Écosystèmes, Biodiversité, Évolution), 35042 Rennes, France.

出版信息

Access Microbiol. 2024 Jul 11;6(7). doi: 10.1099/acmi.0.000771.v3. eCollection 2024.

DOI:10.1099/acmi.0.000771.v3
PMID:39130734
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11316588/
Abstract

Scant information is available regarding fimbrillins within the genus , with the notable exception of those belonging to , which have been extensively researched for several years. Besides and , a third adhesin called filament-forming protein 1 (Ffp1) has recently been described and seems to be pivotal for outer membrane vesicle (OMV) production. We aimed to investigate the distribution and diversity of type V fimbrillin, particularly Ffp1, in the genus . A bioinformatics phylogenomic analysis was conducted using all accessible genomes to generate a domain search for fimbriae, using hidden Markov model profiles. Ffp1 was identified as the sole fimbrillin present in all analysed genomes. After manual verification (i.e. biocuration) of both structural and functional annotations and 3D modelling, this protein was determined to be a type V fimbrillin, with a closer structural resemblance to a fimbrillin than to FimA or Mfa1 from . It appears that Ffp1 is an ancestral fimbria, transmitted through vertical inheritance and present across all species. Additional investigations are necessary to elucidate the biogenesis of Ffp1 fimbriae and their potential role in OMV production and niche adaptation.

摘要

关于该属内的菌毛蛋白，目前可获得的信息很少，属于[具体属名]的菌毛蛋白是个显著例外，它们已经被广泛研究了数年。除了[具体菌毛蛋白1]和[具体菌毛蛋白2]，最近还描述了第三种[属名]黏附素，称为丝状形成蛋白1（Ffp1），它似乎对外膜囊泡（OMV）的产生至关重要。我们旨在研究V型菌毛蛋白，特别是Ffp1，在[属名]中的分布和多样性。使用所有可获取的[属名]基因组进行了生物信息学系统发育基因组分析，利用隐马尔可夫模型谱对菌毛进行结构域搜索。Ffp1被确定为所有分析基因组中唯一存在的菌毛蛋白。在对结构和功能注释以及三维建模进行人工验证（即生物编目）后，该蛋白被确定为V型菌毛蛋白，与[具体属名]的菌毛蛋白相比，其结构与[具体属名]的菌毛蛋白更相似，而与[其他属名]的FimA或Mfa1不同。似乎Ffp1是一种祖传菌毛，通过垂直遗传传递，存在于所有[属名]物种中。需要进一步研究以阐明Ffp1菌毛的生物发生及其在OMV产生和生态位适应中的潜在作用。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/0eda6f741d85/acmi-6-00771-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/b1564e028155/acmi-6-00771-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/04f3de4f00cd/acmi-6-00771-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/c25d84207fa7/acmi-6-00771-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/1309b603f817/acmi-6-00771-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/0eda6f741d85/acmi-6-00771-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/b1564e028155/acmi-6-00771-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/04f3de4f00cd/acmi-6-00771-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/c25d84207fa7/acmi-6-00771-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/1309b603f817/acmi-6-00771-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a4f9/11316588/0eda6f741d85/acmi-6-00771-g005.jpg

相似文献

1
In silico analysis of Ffp1, an ancestral Porphyromonas spp. fimbrillin, shows differences with Fim and Mfa.对祖先卟啉单胞菌属菌毛蛋白Ffp1的计算机模拟分析显示，其与菌毛蛋白（Fim）和微纤毛蛋白（Mfa）存在差异。
Access Microbiol. 2024 Jul 11;6(7). doi: 10.1099/acmi.0.000771.v3. eCollection 2024.
2
Phylogenetic diversity in and gene clusters between and , as a potential cause of host specificity.[具体物种]和[具体物种]之间[相关基因]和基因簇中的系统发育多样性，作为宿主特异性的一个潜在原因。 （注：由于原文中部分内容缺失具体指代，翻译可能不够完整准确，仅根据现有内容进行了大致翻译。）
J Oral Microbiol. 2020 Jun 19;12(1):1775333. doi: 10.1080/20002297.2020.1775333.
3
FimA and Mfa1 fimbriae: Current insights on localization, function, biogenesis, and genotype.FimA和Mfa1菌毛：关于定位、功能、生物发生及基因型的最新见解
Jpn Dent Sci Rev. 2021 Nov;57:190-200. doi: 10.1016/j.jdsr.2021.09.003. Epub 2021 Oct 7.
4
Structural domains of Porphyromonas gingivalis recombinant fimbrillin that mediate binding to salivary proline-rich protein and statherin.牙龈卟啉单胞菌重组菌毛蛋白的结构域，其介导与富含脯氨酸的唾液蛋白和磷蛋白的结合。
Infect Immun. 1996 May;64(5):1631-7. doi: 10.1128/iai.64.5.1631-1637.1996.
5
Expression of a functional Porphyromonas gingivalis fimbrillin polypeptide in Escherichia coli: purification, physicochemical and immunochemical characterization, and binding characteristics.牙龈卟啉单胞菌菌毛蛋白多肽在大肠杆菌中的功能性表达：纯化、理化及免疫化学特性鉴定和结合特性研究
Infect Immun. 1993 Aug;61(8):3570-3. doi: 10.1128/iai.61.8.3570-3573.1993.
6
Porphyromonas (Bacteroides) gingivalis fimbrillin: size, amino-terminal sequence, and antigenic heterogeneity.牙龈卟啉单胞菌（拟杆菌）菌毛蛋白：大小、氨基末端序列及抗原异质性
Infect Immun. 1991 Jan;59(1):383-9. doi: 10.1128/iai.59.1.383-389.1991.
7
Structural and antigenic characterization of a novel genotype of Mfa1 fimbriae in .肺炎支原体中新型Mfa1菌毛基因型的结构和抗原特性研究 。（你提供的原文不完整，我根据常见语境补充了完整表述，若与你原意不符请指出）
J Oral Microbiol. 2023 May 21;15(1):2215551. doi: 10.1080/20002297.2023.2215551. eCollection 2023.
8
Distribution of and fimbrial genotypes in subgingival plaques.龈下菌斑中菌毛基因型的分布情况。 （你提供的原文中“Distribution of and fimbrial genotypes”这里少了具体的内容，我按照完整意思翻译了。）
PeerJ. 2018 Aug 27;6:e5581. doi: 10.7717/peerj.5581. eCollection 2018.
9
Transformation and expression of a cloned fimA gene in Porphyromonas gingivalis.牙龈卟啉单胞菌中克隆的fimA基因的转化与表达
Infect Immun. 1999 Apr;67(4):2013-8. doi: 10.1128/IAI.67.4.2013-2018.1999.
10
Generation and purification of recombinant fimbrillin from Porphyromonas (Bacteroides) gingivalis 381.牙龈卟啉单胞菌（拟杆菌属）381重组菌毛蛋白的产生与纯化
Infect Immun. 1993 Mar;61(3):1040-7. doi: 10.1128/iai.61.3.1040-1047.1993.

引用本文的文献

1
Antibodies with specificity to glycan motifs that decorate OMV cargo proteins.对修饰外膜泡运载蛋白的聚糖基序具有特异性的抗体。
mSphere. 2025 Mar 25;10(3):e0090724. doi: 10.1128/msphere.00907-24. Epub 2025 Feb 26.

本文引用的文献

1
phytools 2.0: an updated R ecosystem for phylogenetic comparative methods (and other things).phytools 2.0：一个更新的用于系统发育比较方法（和其他内容）的 R 生态系统。
PeerJ. 2024 Jan 5;12:e16505. doi: 10.7717/peerj.16505. eCollection 2024.
2
From sequences to species: Charting the phytoplasma classification and taxonomy in the era of taxogenomics.从序列到物种：绘制分类基因组学时代的植原体分类与分类学图谱。
Front Microbiol. 2023 Mar 9;14:1123783. doi: 10.3389/fmicb.2023.1123783. eCollection 2023.
3
Whole Genome Analyses Accurately Identify spp. and Limit Taxonomic Ambiguity.
全基因组分析能准确鉴定 spp.，并限制分类学上的模糊性。
Int J Mol Sci. 2022 Nov 3;23(21):13456. doi: 10.3390/ijms232113456.
4
Genome-based taxonomic classification of the closest-to-Comamonadaceae group supports a new family Sphaerotilaceae fam. nov. and taxonomic revisions.基于基因组的最接近丛毛单胞菌科群的分类学分类支持一个新的科 Sphaerotilaceae 科。nov. 和分类修订。
Syst Appl Microbiol. 2022 Nov;45(6):126352. doi: 10.1016/j.syapm.2022.126352. Epub 2022 Aug 27.
5
In Silico Study of Cell Surface Structures of Involved in Its Maintenance within the Gut Microbiota.在肠道微生物群内维持其结构的细胞表面结构的计算机模拟研究。
Int J Mol Sci. 2022 Aug 20;23(16):9411. doi: 10.3390/ijms23169411.
6
A roadmap for the functional annotation of protein families: a community perspective.蛋白质家族功能注释的路线图：社区视角。
Database (Oxford). 2022 Aug 12;2022. doi: 10.1093/database/baac062.
7
Profiles of Natural and Designed Protein-Like Sequences Effectively Bridge Protein Sequence Gaps: Implications in Distant Homology Detection.天然和设计的类似蛋白质序列的特征有效地填补了蛋白质序列缺口：在远距离同源性检测中的意义。
Methods Mol Biol. 2022;2449:149-167. doi: 10.1007/978-1-0716-2095-3_5.
8
Characterization of the O-Glycoproteome of Porphyromonas gingivalis.牙龈卟啉单胞菌 O-糖蛋白组的特征分析。
Microbiol Spectr. 2022 Feb 23;10(1):e0150221. doi: 10.1128/spectrum.01502-21. Epub 2022 Jan 5.
9
fIDBAC: A Platform for Fast Bacterial Genome Identification and Typing.fIDBAC：一个用于快速细菌基因组鉴定和分型的平台。
Front Microbiol. 2021 Oct 18;12:723577. doi: 10.3389/fmicb.2021.723577. eCollection 2021.
10
Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network.使用三轨神经网络准确预测蛋白质结构和相互作用。
Science. 2021 Aug 20;373(6557):871-876. doi: 10.1126/science.abj8754. Epub 2021 Jul 15.