• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

卫星的基因组序列,(胡夫纳格尔,1766年)

The genome sequence of the satellite, (Hufnagel, 1766).

作者信息

Crowley Liam, Lees David, Hutchinson Finley

机构信息

Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, Oxfordshire, UK.

Natural History Museum, London, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2022 Oct 19;7:266. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18105.1. eCollection 2022.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.18105.1
PMID:39131099
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11316177/
Abstract

We present a genome assembly from an individual female (the satellite; Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Noctuidae). The genome sequence is 467 megabases in span. The entire assembly (100%) is scaffolded into 32 chromosomal pseudomolecules with the W and Z sex chromosomes assembled. The complete mitochondrial genome was also assembled and is 15.5 kilobases in length. Gene annotation of this assembly on Ensembl has identified 18,065 protein coding genes.

摘要

我们展示了一个来自个体雌性(卫星;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)的基因组组装结果。基因组序列跨度为467兆碱基。整个组装(100%)被构建成32个染色体假分子,其中W和Z性染色体已组装完成。完整的线粒体基因组也已组装完成,长度为15.5千碱基。在Ensembl上对该组装进行的基因注释已鉴定出18,065个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/5d501c3ee102/wellcomeopenres-7-20076-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/2f804b89b810/wellcomeopenres-7-20076-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/ad35bbc96d8d/wellcomeopenres-7-20076-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/f0569577e82b/wellcomeopenres-7-20076-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/9a62fa81f899/wellcomeopenres-7-20076-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/5d501c3ee102/wellcomeopenres-7-20076-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/2f804b89b810/wellcomeopenres-7-20076-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/ad35bbc96d8d/wellcomeopenres-7-20076-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/f0569577e82b/wellcomeopenres-7-20076-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/9a62fa81f899/wellcomeopenres-7-20076-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a173/11316177/5d501c3ee102/wellcomeopenres-7-20076-g0004.jpg

相似文献

1
The genome sequence of the satellite, (Hufnagel, 1766).卫星的基因组序列,(胡夫纳格尔,1766年)
Wellcome Open Res. 2022 Oct 19;7:266. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18105.1. eCollection 2022.
2
The genome sequence of the Dark Arches (Hufnagel, 1766).暗拱蛱蝶(胡夫纳格尔,1766年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 8;8:63. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18947.1. eCollection 2023.
3
The genome sequence of the Buff Ermine, (Hufnagel, 1766).黄褐带蛱蝶(Hufnagel,1766年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 21;8:92. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19065.1. eCollection 2023.
4
The genome sequence of the Marbled White Spot, (Hufnagel, 1766).大理石白斑蝶(胡夫纳格尔,1766年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Jan 8;9:7. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20571.1. eCollection 2024.
5
The genome sequence of the Grey Shoulder-knot, (Hufnagel, 1766).灰肩夜蛾(胡夫纳格尔,1766年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Apr 23;9:214. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21280.1. eCollection 2024.
6
The genome sequence of the Oak Hook-tip, (Hufnagel, 1767).栎钩蛾(胡夫纳格尔,1767年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 26;8:324. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19634.1. eCollection 2023.
7
The genome sequence of the Beautiful China-mark moth (Hufnagel, 1767).美丽水螟(胡夫纳格尔,1767年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 8;9:135. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21102.1. eCollection 2024.
8
The genome sequence of the Light Brocade, (Hufnagel, 1766).轻锦(胡夫纳格尔,1766年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 11;8:299. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19653.1. eCollection 2023.
9
The genome sequence of the clay, (Fabricius, 1787).泥蜂(法布尔,1787年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2022 Jul 4;7:177. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17923.1. eCollection 2022.
10
The genome sequence of the Brown Rustic, (Esper, 1785).褐带夜蛾(埃斯珀,1785年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Nov 23;8:547. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20137.1. eCollection 2023.

本文引用的文献

1
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
2
Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm.使用带有 hifiasm 的相定装配图进行单体型解析从头组装。
Nat Methods. 2021 Feb;18(2):170-175. doi: 10.1038/s41592-020-01056-5. Epub 2021 Feb 1.
3
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.
通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
4
MitoFinder: Efficient automated large-scale extraction of mitogenomic data in target enrichment phylogenomics.MitoFinder:目标富集系统发育基因组学中高效自动化的大规模线粒体基因组数据提取。
Mol Ecol Resour. 2020 Jul;20(4):892-905. doi: 10.1111/1755-0998.13160. Epub 2020 Apr 25.
5
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.
6
Identifying and removing haplotypic duplication in primary genome assemblies.鉴定和去除初级基因组组装中的单倍型重复。
Bioinformatics. 2020 May 1;36(9):2896-2898. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa025.
7
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly.将 Hi-C 链接与组装图整合用于染色体尺度的组装。
PLoS Comput Biol. 2019 Aug 21;15(8):e1007273. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007273. eCollection 2019 Aug.
8
UniProt: a worldwide hub of protein knowledge.UniProt:蛋白质知识的全球枢纽。
Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D506-D515. doi: 10.1093/nar/gky1049.
9
HiGlass: web-based visual exploration and analysis of genome interaction maps.HiGlass:基于网络的基因组互作图谱可视化探索和分析工具
Genome Biol. 2018 Aug 24;19(1):125. doi: 10.1186/s13059-018-1486-1.
10
The Ensembl gene annotation system.Ensembl基因注释系统。
Database (Oxford). 2016 Jun 23;2016. doi: 10.1093/database/baw093. Print 2016.