Suppr超能文献

通过 CRISPR/Cas9 外显子平铺扫描发现 FOXO1 的功能基序。

Functional Motif Discovery in FOXO1 Through CRISPR/Cas9 Exon Tiling Scan.

机构信息

College of Pharmacy, Ewha Womans University, Seoul, Republic of Korea.

Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medicine, New York, NY, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2025;2871:57-68. doi: 10.1007/978-1-0716-4217-7_6.

Abstract

The study of FOXO1, a pivotal transcription factor, has garnered significant attention due to its critical role in diverse cellular processes, including lineage differentiation, apoptosis, cell cycle regulation, and metabolism. To comprehensively understand the functional intricacies of FOXO1, an innovative approach is essential. This chapter highlights employing CRISPR exon scanning as a strategic tool to dissect the functional domains of FOXO1 and unravel its diverse regulatory functions. CRISPR exon scan allows for the identification of functionally important domains based on the levels of sgRNA depletion or enrichment within the FOXO1 gene, providing a unique opportunity to investigate the domain function under relevant biological contexts. This approach enables the systematic exploration of FOXO1's structural domains, shedding light on how distinct regions contribute to its overall function. The comprehensive exon scan analysis using CRISPR technology allows gaining a nuanced understanding of FOXO1's functional diversity and regulatory mechanisms.

摘要

FOXO1 是一个关键的转录因子,对其的研究受到了广泛关注,因为它在多种细胞过程中都发挥着关键作用,包括谱系分化、细胞凋亡、细胞周期调控和代谢。为了全面了解 FOXO1 的功能复杂性,需要采用一种创新的方法。本章强调了使用 CRISPR 外显子扫描作为一种策略性工具,以剖析 FOXO1 的功能域,并揭示其多样化的调控功能。CRISPR 外显子扫描可以根据 sgRNA 在 FOXO1 基因内的耗竭或富集水平,识别出功能重要的结构域,从而提供了一个独特的机会,在相关的生物学背景下研究结构域功能。这种方法可以系统地探索 FOXO1 的结构域,揭示不同区域如何共同促成其整体功能。利用 CRISPR 技术进行全面的外显子扫描分析,有助于深入了解 FOXO1 的功能多样性和调控机制。

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