• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

拓扑折纸:串联DNA折纸术

Topogami: Catenating DNA Origami.

作者信息

Wilkens Gerrit, Stepien Piotr, Shaukat Ahmed, Heddle Jonathan

机构信息

Université de Montpellier, Centre de Biochimie Structurale, CNRS, INSERM, Montpellier, France.

School of Biological and Biomedical Sciences, Durham University, Durham, UK.

出版信息

Methods Mol Biol. 2025;2901:49-65. doi: 10.1007/978-1-0716-4394-5_5.

DOI:10.1007/978-1-0716-4394-5_5
PMID:40175867
Abstract

DNA origami is a powerful tool for designing and building functional nanoscale machines. There are practical limitations on the size of a single origami meaning that methods to combine multiple DNA origamis into single functional units would be useful. Catenation of DNA origami structures would provide arguably the most stable linkage method, but true catenation requires linking of the DNA origami scaffold strands. This is achieved in the DNA Topogami method, outlined here, which employs a resolvase to produce the scaffold catenanes, which can then be folded into the required structures by staple strands.

摘要

DNA折纸术是设计和构建功能性纳米级机器的强大工具。单个折纸的尺寸存在实际限制,这意味着将多个DNA折纸组合成单个功能单元的方法将很有用。DNA折纸结构的连环化可以说是最稳定的连接方法,但真正的连环化需要连接DNA折纸支架链。本文概述的DNA拓扑折纸方法实现了这一点,该方法利用一种解离酶来产生支架连环体,然后可以通过短链将其折叠成所需的结构。

相似文献

1
Topogami: Catenating DNA Origami.拓扑折纸:串联DNA折纸术
Methods Mol Biol. 2025;2901:49-65. doi: 10.1007/978-1-0716-4394-5_5.
2
Adjusting Linking Strands to Form Size-Controllable DNA Origami Rings.调整连接链以形成尺寸可控的 DNA 折纸环。
IEEE Trans Nanobioscience. 2020 Apr;19(2):167-172. doi: 10.1109/TNB.2020.2964061. Epub 2020 Jan 6.
3
Assembly of a DNA Origami Chinese Knot by Only 15% of the Staple Strands.仅用 15%的订书钉链组装 DNA 折纸中国结。
Chembiochem. 2020 Aug 3;21(15):2132-2136. doi: 10.1002/cbic.202000106. Epub 2020 Apr 9.
4
Nanomechanical molecular devices made of DNA origami.由 DNA 折纸术制成的纳米机械分子器件。
Acc Chem Res. 2014 Jun 17;47(6):1742-9. doi: 10.1021/ar400328v. Epub 2014 Apr 29.
5
Fully addressable designer superstructures assembled from one single modular DNA origami.由单个模块化DNA折纸组装而成的完全可寻址设计超结构。
Nat Commun. 2025 Feb 12;16(1):1556. doi: 10.1038/s41467-025-56846-2.
6
Topogami: Topologically Linked DNA Origami.拓扑折纸:拓扑连接的DNA折纸
ACS Nanosci Au. 2022 Feb 16;2(1):57-63. doi: 10.1021/acsnanoscienceau.1c00027. Epub 2021 Nov 12.
7
Toward larger DNA origami.迈向更大的 DNA 折纸。
Nano Lett. 2014 Oct 8;14(10):5740-7. doi: 10.1021/nl502626s. Epub 2014 Sep 8.
8
One-pot assembly of a hetero-dimeric DNA origami from chip-derived staples and double-stranded scaffold.从芯片衍生的订书钉和双链支架一锅组装杂二聚体 DNA 折纸。
ACS Nano. 2013 Feb 26;7(2):903-10. doi: 10.1021/nn302322j. Epub 2013 Jan 9.
9
Organizing DNA origami tiles into larger structures using preformed scaffold frames.使用预制支架框架将 DNA 折纸瓦片组织成更大的结构。
Nano Lett. 2011 Jul 13;11(7):2997-3002. doi: 10.1021/nl201603a. Epub 2011 Jun 23.
10
Isothermal assembly of DNA origami structures using denaturing agents.使用变性剂进行DNA折纸结构的等温组装。
J Am Chem Soc. 2008 Aug 6;130(31):10062-3. doi: 10.1021/ja8030196. Epub 2008 Jul 10.

本文引用的文献

1
Structural basis for topological regulation of Tn3 resolvase.Tn3 内切酶拓扑调控的结构基础。
Nucleic Acids Res. 2023 Feb 22;51(3):1001-1018. doi: 10.1093/nar/gkac733.
2
Topogami: Topologically Linked DNA Origami.拓扑折纸:拓扑连接的DNA折纸
ACS Nanosci Au. 2022 Feb 16;2(1):57-63. doi: 10.1021/acsnanoscienceau.1c00027. Epub 2021 Nov 12.
3
DNA Origami Catenanes Templated by Gold Nanoparticles.DNA 折纸超分子绞辫结构由金纳米粒子模板化。
Small. 2020 Feb;16(6):e1905987. doi: 10.1002/smll.201905987. Epub 2020 Jan 9.
4
How We Make DNA Origami.我们如何制作DNA折纸。
Chembiochem. 2017 Oct 5;18(19):1873-1885. doi: 10.1002/cbic.201700377. Epub 2017 Aug 10.
5
Creating complex molecular topologies by configuring DNA four-way junctions.通过配置 DNA 四链结来创建复杂的分子拓扑结构。
Nat Chem. 2016 Oct;8(10):907-14. doi: 10.1038/nchem.2564. Epub 2016 Jul 4.
6
Long-range movement of large mechanically interlocked DNA nanostructures.大型机械互锁 DNA 纳米结构的远距离运动。
Nat Commun. 2016 Aug 5;7:12414. doi: 10.1038/ncomms12414.
7
Folding and cutting DNA into reconfigurable topological nanostructures.将 DNA 折叠和切割成可重构的拓扑纳米结构。
Nat Nanotechnol. 2010 Oct;5(10):712-7. doi: 10.1038/nnano.2010.193. Epub 2010 Oct 3.
8
Rapid prototyping of 3D DNA-origami shapes with caDNAno.利用caDNAno对3D DNA折纸形状进行快速原型制作。
Nucleic Acids Res. 2009 Aug;37(15):5001-6. doi: 10.1093/nar/gkp436. Epub 2009 Jun 16.
9
Diversity in the serine recombinases.丝氨酸重组酶的多样性。
Mol Microbiol. 2002 Apr;44(2):299-307. doi: 10.1046/j.1365-2958.2002.02891.x.
10
Site-specific recombination by Tn3 resolvase.
Trends Genet. 1989 Sep;5(9):304-9. doi: 10.1016/0168-9525(89)90113-3.