• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

施陶丁格1871年(鳞翅目:枯叶蛾科)的基因组序列。

The genome sequence of Staudinger, 1871 (Lepidoptera: Lasiocampidae).

作者信息

Potocký Pavel, Klečková Irena, Matos-Maraví Pavel, Wright Charlotte J, Meier Joana I, Blaxter Mark L

机构信息

Institute of Entomology, Biology Centre CAS (Czech Academy of Sciences), České Budějovice, Czech Republic.

Tree of Life, Wellcome Sanger Institute, Hinxton, England, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2025 Aug 11;10:420. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24677.1. eCollection 2025.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.24677.1
PMID:40873553
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12378395/
Abstract

We present a genome assembly from a female specimen of (Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Lasiocampidae). The assembly contains two haplotypes with total lengths of 572.73 megabases and 530.23 megabases. Most of haplotype 1 (98.92%) is scaffolded into 31 chromosomal pseudomolecules, including the Z sex chromosome. Haplotype 2 was assembled to scaffold level. The mitochondrial genome has also been assembled, with a length of 16.7 kilobases.

摘要

我们展示了一种来自[物种名称](节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;枯叶蛾科)雌性标本的基因组组装结果。该组装包含两个单倍型,总长度分别为572.73兆碱基和530.23兆碱基。单倍型1的大部分(98.92%)被组装成31条染色体假分子,包括Z性染色体。单倍型2被组装到支架水平。线粒体基因组也已被组装,长度为16.7千碱基。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/d13fa755da2c/wellcomeopenres-10-27192-g0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/52e6ea3aeb19/wellcomeopenres-10-27192-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/3430de45a020/wellcomeopenres-10-27192-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/e20685f9a949/wellcomeopenres-10-27192-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/47dc00b8742e/wellcomeopenres-10-27192-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/f10183b4d895/wellcomeopenres-10-27192-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/d13fa755da2c/wellcomeopenres-10-27192-g0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/52e6ea3aeb19/wellcomeopenres-10-27192-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/3430de45a020/wellcomeopenres-10-27192-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/e20685f9a949/wellcomeopenres-10-27192-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/47dc00b8742e/wellcomeopenres-10-27192-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/f10183b4d895/wellcomeopenres-10-27192-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f541/12378395/d13fa755da2c/wellcomeopenres-10-27192-g0005.jpg

相似文献

1
The genome sequence of Staudinger, 1871 (Lepidoptera: Lasiocampidae).施陶丁格1871年(鳞翅目:枯叶蛾科)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Aug 11;10:420. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24677.1. eCollection 2025.
2
The genome sequence of the Cranberry Fritillary, (Stichel, 1908) (Lepidoptera: Nymphalidae).越橘豹蛱蝶(Stichel,1908)(鳞翅目:蛱蝶科)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Jul 28;10:378. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24620.1. eCollection 2025.
3
The genome sequence of the Slender-footed Robberfly, (Meigen, 1804).细足盗虻(梅根,1804年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 May 23;10:273. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24277.1. eCollection 2025.
4
The genome sequence of the banded centipede, Leach, 1814.条斑蜈蚣的基因组序列,利奇,1814年。
Wellcome Open Res. 2025 Jun 2;10:285. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24329.1. eCollection 2025.
5
The genome sequence of the Tortix moth, (Scopoli, 1763).蔷薇卷蛾(蔷薇卷蛾,斯科波利,1763年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Apr 11;10:189. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23921.1. eCollection 2025.
6
The genome sequence of the Uncertain moth, (Goeze, 1781).不确定蛾(戈泽,1781年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Apr 22;10:201. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23983.1. eCollection 2025.
7
The genome sequence of the Poplar Cosmet moth, (Haworth, 1828).杨树美蛾(霍沃思,1828年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Jun 2;10:288. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24308.1. eCollection 2025.
8
The genome sequence of the Thistle Conch moth, (Westwood, 1854).蓟螺蛾(韦斯特伍德,1854年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Jun 2;10:289. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24252.1. eCollection 2025.
9
The genome sequence of the Common Grey moth, Treitschke, 1829.普通灰蛾(1829年,特赖奇克)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Apr 23;10:205. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23998.1. eCollection 2025.
10
The genome sequence of the Small Dotted Buff moth, Haworth, 1809.小点黄褐蛾的基因组序列,霍沃思,1809年。
Wellcome Open Res. 2025 Jun 2;10:299. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24264.1. eCollection 2025.

本文引用的文献

1
Comparative genomics reveals the dynamics of chromosome evolution in Lepidoptera.比较基因组学揭示鳞翅目染色体进化的动态。
Nat Ecol Evol. 2024 Apr;8(4):777-790. doi: 10.1038/s41559-024-02329-4. Epub 2024 Feb 21.
2
MitoHiFi: a python pipeline for mitochondrial genome assembly from PacBio high fidelity reads.MitoHiFi:一个从 PacBio 高保真reads 组装线粒体基因组的 Python 分析流程
BMC Bioinformatics. 2023 Jul 18;24(1):288. doi: 10.1186/s12859-023-05385-y.
3
Genomes on a Tree (GoaT): A versatile, scalable search engine for genomic and sequencing project metadata across the eukaryotic tree of life.
基因组之树(GoaT):一种通用、可扩展的搜索引擎,用于搜索真核生物生命之树中的基因组和测序项目元数据。
Wellcome Open Res. 2023 Jan 17;8:24. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18658.1. eCollection 2023.
4
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool.YaHS:另一个 Hi-C 支架工具。
Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btac808.
5
UniProt: the Universal Protein Knowledgebase in 2023.UniProt:2023 年的通用蛋白质知识库。
Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D523-D531. doi: 10.1093/nar/gkac1052.
6
Gfastats: conversion, evaluation and manipulation of genome sequences using assembly graphs.Gfastats:使用组装图转换、评估和操作基因组序列。
Bioinformatics. 2022 Sep 2;38(17):4214-4216. doi: 10.1093/bioinformatics/btac460.
7
Haplotype-resolved assembly of diploid genomes without parental data.单体型解析组装二倍体基因组,无需父母本数据。
Nat Biotechnol. 2022 Sep;40(9):1332-1335. doi: 10.1038/s41587-022-01261-x. Epub 2022 Mar 24.
8
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
9
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species.致力于完成所有脊椎动物物种的完整且无错误的基因组组装。
Nature. 2021 Apr;592(7856):737-746. doi: 10.1038/s41586-021-03451-0. Epub 2021 Apr 28.
10
Sensitive protein alignments at tree-of-life scale using DIAMOND.使用 DIAMOND 进行生命之树尺度上的敏感蛋白质比对。
Nat Methods. 2021 Apr;18(4):366-368. doi: 10.1038/s41592-021-01101-x. Epub 2021 Apr 7.