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小鼠主要组织相容性同种异体抗原的一级结构：来自H-2Kb分子的溴化氰片段Ia（第139 - 228位）的氨基酸序列。

Primary structure of murine major histocompatibility alloantigens: amino acid sequence of the cyanogen bromide fragment Ia (positions 139-228) from the H-2Kb molecule.

作者信息

Uehara H, Ewenstein B M, Martinko J M, Nathenson S G, Kindt T J, Coligan J E

出版信息

Biochemistry. 1980 Dec 23;19(26):6182-8. doi: 10.1021/bi00567a036.

DOI:10.1021/bi00567a036
PMID:7470457
Abstract

The complete amino acid sequence of the cyanogen bromide (CNBr) fragment Ia (CN-Ia) from the murine histocompatibility antigen H-2Kb has been obtained by using radiosequence methodology. This glycopeptide is the largest CNBr cleavage product of the H-2K molecule and extends from position 139 to position 228. The sequence determined for CN-Ia was Ala-Ala-Leu-Ile-Thr-Lys-His-Lys-Trp-Glu-Gln-Ala-Gly-Glu-Ala-Glu-Arg-Leu-Arg-Ala -Tyr-Leu-Glu-Gly-Thr-Cys-Val-Glu-Trp-Leu-Arg-Arg-Tyr-Leu-Lys-Ans-Gly-(Asn)-Ala- Thr-Leu-Leu-Arg-Thr-Asp-Ser-Pro-Lys-Ala-His-Val-Thr-His-His-Ser-Arg-Pro-Asp-Asp -Lys-Val-Thr-Leu-Arg-Cys-Trp-Ala-Leu-Gly-Phe-Tyr-Pro-Ala-Asp-Ile-Thr-Leu-Thr-Tr p-Gln-Leu-Asn-Gly-Glu-Glu-Leu-Ile-Gln-Aps-Met. The data were obtained by analysis of fragments derived by thrombic, tryptic, chymotryptic, and V8 protease digestion of CN-Ia. A carbohydrate moiety is attached to Asn at position 176. Homology between this 90 amino acid stretch of H-2Kb and HLA-B7 [Orr, H. T., Lopez de Castro, J. A., Lancer, D., & Strominger, J. L. (1979) Biochemistry 18, 5711] is 68%, and differences are noted at positions 176, 177, and 178 which in the H-2 molecule are the attachment region for a second carbohydrate moiety. No carbohydrate was detected in this position for HLA-B7 [Orr, H. T. Lopez de Castro, J. A. Lancet, D., & Strominger, J. L. (1979) Biochemistry 18, 5711].

摘要

通过放射性序列分析方法，已获得小鼠组织相容性抗原H-2Kb的溴化氰（CNBr）片段Ia（CN-Ia）的完整氨基酸序列。该糖肽是H-2K分子最大的CNBr裂解产物，从第139位延伸至第228位。确定的CN-Ia序列为：丙氨酸-丙氨酸-亮氨酸-异亮氨酸-苏氨酸-赖氨酸-组氨酸-赖氨酸-色氨酸-谷氨酸-谷氨酰胺-丙氨酸-甘氨酸-谷氨酸-丙氨酸-谷氨酸-精氨酸-亮氨酸-精氨酸-丙氨酸-酪氨酸-亮氨酸-谷氨酸-甘氨酸-苏氨酸-半胱氨酸-缬氨酸-谷氨酸-色氨酸-亮氨酸-精氨酸-精氨酸-酪氨酸-亮氨酸-赖氨酸-ANS-甘氨酸-（天冬酰胺）-丙氨酸-苏氨酸-亮氨酸-亮氨酸-精氨酸-苏氨酸-天冬氨酸-丝氨酸-脯氨酸-赖氨酸-丙氨酸-组氨酸-缬氨酸-苏氨酸-组氨酸-组氨酸-丝氨酸-精氨酸-脯氨酸-天冬氨酸-天冬氨酸-赖氨酸-缬氨酸-苏氨酸-亮氨酸-精氨酸-半胱氨酸-色氨酸-丙氨酸-亮氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-酪氨酸-脯氨酸-丙氨酸-天冬氨酸-异亮氨酸-苏氨酸-亮氨酸-苏氨酸-色氨酸-谷氨酰胺-亮氨酸-天冬酰胺-甘氨酸-谷氨酸-谷氨酸-亮氨酸-异亮氨酸-谷氨酰胺-天冬氨酸-甲硫氨酸。这些数据是通过对CN-Ia经凝血酶、胰蛋白酶、糜蛋白酶和V8蛋白酶消化产生的片段进行分析获得的。一个碳水化合物部分连接在第176位的天冬酰胺上。H-2Kb的这90个氨基酸片段与HLA-B7[奥尔，H.T.，洛佩斯·德·卡斯特罗，J.A.，兰斯，D.，&斯特罗明格，J.L.（1979年）《生物化学》18，5711]之间的同源性为68%，在第176、177和178位存在差异，在H-2分子中这是第二个碳水化合物部分的连接区域。对于HLA-B7[奥尔，H.T.洛佩斯·德·卡斯特罗]，在这个位置未检测到碳水化合物。J.A.兰斯，D.，&斯特罗明格，J.L.（1979年）《生物化学》18，5711]。

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