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核糖核酸酶P数据库。

The Ribonuclease P database.

作者信息

Brown J W, Haas E S, Gilbert D G, Pace N R

机构信息

Department of Microbiology, North Carolina State University, Raleigh 27695.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3660-2. doi: 10.1093/nar/22.17.3660.

Abstract

The Ribonuclease P Sequence database is a compilation of RNase P sequences, sequence alignments, secondary structures, three-dimensional models, and accessory information. In its initial form, the database contains information on RNase P RNA in bacteria and archaea, and RNase P protein in bacteria. The sequences themselves are presented phylogenetically ordered and aligned. The database also contains secondary structures of bacterial and archaeal RNAs, including specially annotated 'reference' secondary structures of Escherichia coli and Bacillus subtilis RNase P RNAs, a minimum phylogenetic consensus structure, and coordinates for models of three-dimensional structure.

摘要

核糖核酸酶P序列数据库是核糖核酸酶P序列、序列比对、二级结构、三维模型及辅助信息的汇编。其初始形式包含细菌和古细菌中核糖核酸酶P RNA以及细菌中核糖核酸酶P蛋白的信息。序列本身按系统发育顺序呈现并比对。该数据库还包含细菌和古细菌RNA的二级结构,包括大肠杆菌和枯草芽孢杆菌核糖核酸酶P RNA经过特别注释的“参考”二级结构、最小系统发育共有结构以及三维结构模型的坐标。

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