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相似文献

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A single rRNA gene region in Bradyrhizobium japonicum.日本慢生根瘤菌中的一个单一核糖体RNA基因区域。
J Bacteriol. 1995 Sep;177(17):5151-4. doi: 10.1128/jb.177.17.5151-5154.1995.
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Characterization of the three ribosomal RNA operons rrnA, rrnB, and rrnC, from Brucella melitensis.来自羊种布鲁氏菌的三个核糖体RNA操纵子rrnA、rrnB和rrnC的特征分析。
Gene. 2000 Sep 5;255(1):117-26. doi: 10.1016/s0378-1119(00)00273-0.
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Mol Cell Probes. 2008 Oct-Dec;22(5-6):338-40. doi: 10.1016/j.mcp.2008.09.002. Epub 2008 Oct 7.
10
Studies on the ribosomal RNA operons of Listeria monocytogenes.单核细胞增生李斯特菌核糖体RNA操纵子的研究。
FEMS Microbiol Lett. 1992 Sep 15;75(2-3):219-24. doi: 10.1016/0378-1097(92)90407-f.

引用本文的文献

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Bradyrhizobium japonicum HmuP is an RNA-binding protein that positively controls hmuR operon expression by suppression of a negative regulatory RNA element in the 5' untranslated region.大豆慢生根瘤菌 HmuP 是一种 RNA 结合蛋白，通过抑制 5'非翻译区中负调控 RNA 元件，正向调控 hmuR 操纵子的表达。
Mol Microbiol. 2024 Jun;121(6):1217-1227. doi: 10.1111/mmi.15274. Epub 2024 May 9.
2
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Genome Res. 2001 Aug;11(8):1434-40. doi: 10.1101/gr.185001.
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Appl Environ Microbiol. 2001 Aug;67(8):3655-64. doi: 10.1128/AEM.67.8.3655-3664.2001.
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RNase III processing of intervening sequences found in helix 9 of 23S rRNA in the alpha subclass of Proteobacteria.变形菌纲α亚类中23S rRNA螺旋9中居间序列的核糖核酸酶III加工。
J Bacteriol. 2000 Sep;182(17):4719-29. doi: 10.1128/JB.182.17.4719-4729.2000.
5
Genotypic characterization of Bradyrhizobium strains nodulating endemic woody legumes of the Canary Islands by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis of genes encoding 16S rRNA (16S rDNA) and 16S-23S rDNA intergenic spacers, repetitive extragenic palindromic PCR genomic fingerprinting, and partial 16S rDNA sequencing.通过对编码16S rRNA（16S rDNA）和16S - 23S rDNA基因间隔区的基因进行PCR - 限制性片段长度多态性分析、重复外显子回文PCR基因组指纹分析以及部分16S rDNA测序，对加那利群岛特有的木本豆科植物根瘤菌菌株进行基因型特征分析。
Appl Environ Microbiol. 1998 Jun;64(6):2096-104. doi: 10.1128/AEM.64.6.2096-2104.1998.
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J Bacteriol. 1998 May;180(9):2395-401. doi: 10.1128/JB.180.9.2395-2401.1998.
7
In vivo genomic footprinting analysis reveals that the complex Bradyrhizobium japonicum fixRnifA promoter region is differently occupied by two distinct RNA polymerase holoenzymes.体内基因组足迹分析表明，复杂的日本慢生根瘤菌fixRnifA启动子区域被两种不同的RNA聚合酶全酶以不同方式占据。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Feb 3;95(3):1014-9. doi: 10.1073/pnas.95.3.1014.
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Dissection of the transcription machinery for housekeeping genes of Bradyrhizobium japonicum.慢生根瘤菌持家基因转录机制的剖析。
J Bacteriol. 1997 Jan;179(2):364-9. doi: 10.1128/jb.179.2.364-369.1997.

本文引用的文献

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Copy number of the 16S rRNA gene in Rickettsia prowazekii.普氏立克次体中16S rRNA基因的拷贝数。
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Genomic mapping with I-Ceu I, an intron-encoded endonuclease specific for genes for ribosomal RNA, in Salmonella spp., Escherichia coli, and other bacteria.利用I-Ceu I（一种对核糖体RNA基因具有特异性的内含子编码内切核酸酶）对沙门氏菌属、大肠杆菌及其他细菌进行基因组图谱绘制。
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日本慢生根瘤菌中的一个单一核糖体RNA基因区域。

A single rRNA gene region in Bradyrhizobium japonicum.

作者信息

Kündig C, Beck C, Hennecke H, Göttfert M

机构信息

Mikrobiologisches Institut, Eidgenössische Technische Hochschule, ETH-Zentrum, Zürich, Switzerland.

出版信息

J Bacteriol. 1995 Sep;177(17):5151-4. doi: 10.1128/jb.177.17.5151-5154.1995.

DOI:10.1128/jb.177.17.5151-5154.1995
PMID:7665496
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC177297/
Abstract

Bradyrhizobium japonicum contains only a single rRNA (rrn) gene region, despite its comparatively large genome size of 8,700 kb. The nucleotide sequence revealed an organization of rRNA and tRNA genes that is frequently found in bacteria: 5'-rrs (16S rRNA)-ileT (tRNA(Ile))-alaT (tRNA(Ala))-rrl (23S rRNA)-rrf (5S rRNA)-3'. The 5' end of the primary transcript, one of the 16S rRNA processing sites, and the 5' end of the mature 16S rRNA were determined by primer extension. DNA hybridization experiments showed that the slowly growing Bradyrhizobium strains generally have only a single copy of the 16S rRNA gene, whereas the faster-growing Rhizobium species contain three rrs copies.

摘要

尽管日本慢生根瘤菌的基因组相对较大，达8700 kb，但它仅含有一个rRNA（rrn）基因区域。核苷酸序列显示了一种在细菌中常见的rRNA和tRNA基因组织形式：5'-rrs（16S rRNA）-ileT（tRNA（Ile））-alaT（tRNA（Ala））-rrl（23S rRNA）-rrf（5S rRNA）-3'。通过引物延伸确定了初级转录本的5'端、16S rRNA加工位点之一以及成熟16S rRNA的5'端。DNA杂交实验表明，生长缓慢的慢生根瘤菌菌株通常只有16S rRNA基因的单拷贝，而生长较快的根瘤菌物种则含有三个rrs拷贝。