• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Predicting potential domain homologies from FASTA search results.

作者信息

Hegyi H, Pongor S

机构信息

ABC Institute for Biochemistry and Protein Research, Gödöllö, Hungary.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1993 Jun;9(3):371-2. doi: 10.1093/bioinformatics/9.3.371.

DOI:10.1093/bioinformatics/9.3.371
PMID:8324638
Abstract
摘要

相似文献

1
Predicting potential domain homologies from FASTA search results.从FASTA搜索结果预测潜在的结构域同源性。
Comput Appl Biosci. 1993 Jun;9(3):371-2. doi: 10.1093/bioinformatics/9.3.371.
2
FASTA-SWAP and FASTA-PAT: pattern database searches using combinations of aligned amino acids, and a novel scoring theory.FASTA-SWAP和FASTA-PAT:使用比对氨基酸组合进行模式数据库搜索以及一种新颖的评分理论。
J Mol Biol. 1996 Jun 21;259(4):840-54. doi: 10.1006/jmbi.1996.0362.
3
Further evaluation of the utility of "sliding window" FASTA in predicting cross-reactivity with allergenic proteins.“滑动窗口”FASTA在预测与变应原蛋白交叉反应性方面的效用的进一步评估。
Regul Toxicol Pharmacol. 2009 Aug;54(3 Suppl):S20-5. doi: 10.1016/j.yrtph.2008.11.006. Epub 2008 Dec 11.
4
Searching protein sequence libraries: comparison of the sensitivity and selectivity of the Smith-Waterman and FASTA algorithms.搜索蛋白质序列文库:Smith-Waterman算法与FASTA算法的灵敏度和选择性比较
Genomics. 1991 Nov;11(3):635-50. doi: 10.1016/0888-7543(91)90071-l.
5
Finding protein and nucleotide similarities with FASTA.使用FASTA查找蛋白质和核苷酸的相似性。
Curr Protoc Bioinformatics. 2004 Feb;Chapter 3:Unit3.9. doi: 10.1002/0471250953.bi0309s04.
6
Domain identification by clustering sequence alignments.通过聚类序列比对进行结构域鉴定。
Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol. 1997;5:124-30.
7
The effect of sequence quality on sequence alignment.序列质量对序列比对的影响。
Bioinformatics. 2008 Apr 1;24(7):897-900. doi: 10.1093/bioinformatics/btn052. Epub 2008 Feb 23.
8
Comparison of methods for searching protein sequence databases.蛋白质序列数据库搜索方法的比较。
Protein Sci. 1995 Jun;4(6):1145-60. doi: 10.1002/pro.5560040613.
9
Using the FASTA program to search protein and DNA sequence databases.使用FASTA程序搜索蛋白质和DNA序列数据库。
Methods Mol Biol. 1994;25:365-89. doi: 10.1385/0-89603-276-0:365.
10
Database similarity searches.数据库相似性搜索。
Methods Mol Biol. 2008;484:361-78. doi: 10.1007/978-1-59745-398-1_24.

引用本文的文献

1
The SBASE domain sequence resource, release 12: prediction of protein domain-architecture using support vector machines.SBASE结构域序列资源,第12版:使用支持向量机预测蛋白质结构域架构
Nucleic Acids Res. 2005 Jan 1;33(Database issue):D223-5. doi: 10.1093/nar/gki112.
2
Characterization of zebrafish caspase-3 and induction of apoptosis through ceramide generation in fish fathead minnow tailbud cells and zebrafish embryo.斑马鱼半胱天冬酶-3的特性以及通过在黑头软口鲦鱼尾芽细胞和斑马鱼胚胎中生成神经酰胺诱导细胞凋亡
Biochem J. 2001 Nov 15;360(Pt 1):39-47. doi: 10.1042/0264-6021:3600039.
3
Prediction of protein functional domains from sequences using artificial neural networks.
使用人工神经网络从序列预测蛋白质功能结构域。
Genome Res. 2001 Aug;11(8):1410-7. doi: 10.1101/gr.168701.
4
The SBASE protein domain library, release 5.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第5.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):240-3. doi: 10.1093/nar/25.1.240.
5
The SBASE protein domain library, Release 4.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第4.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):210-3. doi: 10.1093/nar/24.1.210.
6
The SBASE protein domain library, release 3.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第3.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3610-5.