• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
The SBASE protein domain library, release 5.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第5.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):240-3. doi: 10.1093/nar/25.1.240.
2
The SBASE protein domain library, Release 4.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第4.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):210-3. doi: 10.1093/nar/24.1.210.
3
The SBASE protein domain library, release 3.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第3.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3610-5.
4
The SBASE protein domain library, release 6.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第6.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):257-9. doi: 10.1093/nar/27.1.257.
5
The SBASE protein domain library, release 7.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第7.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):260-2. doi: 10.1093/nar/28.1.260.
6
The SBASE protein domain library, release 8.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第8.0版：注释蛋白质序列片段集合
Nucleic Acids Res. 2001 Jan 1;29(1):58-60. doi: 10.1093/nar/29.1.58.
7
The SBASE protein domain library, release 2.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库，第2版：带注释的蛋白质序列片段集合
Nucleic Acids Res. 1993 Jul 1;21(13):3111-5. doi: 10.1093/nar/21.13.3111.
8
The SBASE domain library: a collection of annotated protein segments.SBASE结构域文库：带注释的蛋白质片段集合。
Protein Eng. 1993 Jun;6(4):391-5. doi: 10.1093/protein/6.4.391.
9
The SBASE protein domain library, release 9.0: an online resource for protein domain identification.SBASE蛋白质结构域文库，第9.0版：用于蛋白质结构域鉴定的在线资源。
Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):273-5. doi: 10.1093/nar/30.1.273.
10
The SBASE domain sequence library, release 10: domain architecture prediction.SBASE结构域序列库，第10版：结构域架构预测
Nucleic Acids Res. 2003 Jan 1;31(1):403-5. doi: 10.1093/nar/gkg098.

引用本文的文献

1
HPVMD-C: a disease-based mutation database of human papillomavirus in China.HPVMD-C：中国 HPV 疾病相关突变数据库。
Database (Oxford). 2022 Mar 26;2022. doi: 10.1093/database/baac018.
2
The genome of Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus.红腿蝗昆虫痘病毒的基因组
J Virol. 1999 Jan;73(1):533-52. doi: 10.1128/JVI.73.1.533-552.1999.
3
A seven-gene locus for synthesis of phenazine-1-carboxylic acid by Pseudomonas fluorescens 2-79.荧光假单胞菌2-79合成吩嗪-1-羧酸的七基因位点。
J Bacteriol. 1998 May;180(9):2541-8. doi: 10.1128/JB.180.9.2541-2548.1998.
4
A putative rolB gene homologue of the Agrobacterium rhizogenes TR-DNA has different morphogenetic activity in tobacco than rolB.发根农杆菌TR-DNA的一个假定rolB基因同源物在烟草中具有与rolB不同的形态发生活性。
Plant Mol Biol. 1998 Mar;36(5):803-8. doi: 10.1023/a:1005905327898.
5
The PRINTS protein fingerprint database in its fifth year.处于第五年的PRINTS蛋白质指纹数据库。
Nucleic Acids Res. 1998 Jan 1;26(1):304-8. doi: 10.1093/nar/26.1.304.

本文引用的文献

1
The European Bioinformatics Institute (EBI) databases.欧洲生物信息学研究所（EBI）数据库。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):6-12. doi: 10.1093/nar/24.1.6.
2
REBASE--restriction enzymes and methylases.REBASE——限制性内切酶与甲基化酶
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):223-35. doi: 10.1093/nar/24.1.223.
3
The SWISS-PROT protein sequence data bank and its new supplement TREMBL.SWISS-PROT蛋白质序列数据库及其新的补充数据库TREMBL。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):21-5. doi: 10.1093/nar/24.1.21.
4
The Blocks database--a system for protein classification.Blocks数据库——一种蛋白质分类系统。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):197-200. doi: 10.1093/nar/24.1.197.
5
The PROSITE database, its status in 1995.PROSITE数据库及其1995年的状况。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):189-96. doi: 10.1093/nar/24.1.189.
6
Progress with the PRINTS protein fingerprint database.PRINTS蛋白质指纹数据库的进展。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):182-8. doi: 10.1093/nar/24.1.182.
7
The PIR-International Protein Sequence Database.国际蛋白质信息资源-蛋白质序列数据库。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):17-20. doi: 10.1093/nar/24.1.17.
8
GenBank.基因银行
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):1-5. doi: 10.1093/nar/24.1.1.
9
Predicting potential domain homologies from FASTA search results.从FASTA搜索结果预测潜在的结构域同源性。
Comput Appl Biosci. 1993 Jun;9(3):371-2. doi: 10.1093/bioinformatics/9.3.371.
10
The SBASE domain library: a collection of annotated protein segments.SBASE结构域文库：带注释的蛋白质片段集合。
Protein Eng. 1993 Jun;6(4):391-5. doi: 10.1093/protein/6.4.391.

SBASE蛋白质结构域文库，第5.0版：带注释的蛋白质序列片段集合。

The SBASE protein domain library, release 5.0: a collection of annotated protein sequence segments.

作者信息

Fábián P, Murvai J, Hátsági Z, Vlahovicek K, Hegyi H, Pongor S

机构信息

ABC Institute for Biochemistry and Protein Research, 2100 Gödöllö, Hungary.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):240-3. doi: 10.1093/nar/25.1.240.

DOI:10.1093/nar/25.1.240
PMID:9016545
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC146372/
Abstract

SBASE 5.0 is the fifth release of SBASE, a collection of annotated protein domain sequences that represent various structural, functional, ligand-binding and topogenic segments of proteins. SBASE was designed to facilitate the detection of functional homologies and can be searched with standard database-search programs. The present release contains over 79863 entries provided with standardized names and is cross-referenced to all major sequence databases and sequence pattern collections. The information is assigned to individual domains rather than to entire protein sequences, thus SBASE contains substantially more cross-references and links than do the protein sequence databases. The entries are clustered into >16 000 groups in order to facilitate the detection of distant similarities. SBASE 5.0 is freely available by anonymous 'ftp' file transfer from <ftp.icgeb.trieste.it >. Automated searching of SBASE with BLAST can be carried out with the WWW-server <http://www.icgeb.trieste.it/sbase/ >. and with the electronic mail server <sbase@icgeb.trieste.it >which now also provides a graphic representation of the homologies. A related WWW-server <http://www.abc.hu/blast.html > and e-mail server <domain@hubi.abc.hu > predicts SBASE domain homologies on the basis of SWISS-PROT searches.

摘要

SBASE 5.0是SBASE的第五个版本，它是一个带注释的蛋白质结构域序列集合，代表了蛋白质的各种结构、功能、配体结合和拓扑结构片段。SBASE旨在促进功能同源性的检测，可使用标准数据库搜索程序进行搜索。当前版本包含超过79863个带有标准化名称的条目，并与所有主要序列数据库和序列模式集合交叉引用。信息被分配到各个结构域而不是整个蛋白质序列，因此SBASE包含的交叉引用和链接比蛋白质序列数据库多得多。这些条目被聚类为超过16000个组，以便于检测远缘相似性。可通过匿名“ftp”文件传输从<ftp.icgeb.trieste.it>免费获取SBASE 5.0。可使用WWW服务器http://www.icgeb.trieste.it/sbase/和电子邮件服务器sbase@icgeb.trieste.it对SBASE进行BLAST自动搜索，该电子邮件服务器现在还提供同源性的图形表示。一个相关的WWW服务器http://www.abc.hu/blast.html和电子邮件服务器domain@hubi.abc.hu基于SWISS-PROT搜索预测SBASE结构域同源性。