• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

古菌中复制蛋白A的新型同源物:对单链DNA结合蛋白进化的启示。

Novel homologs of replication protein A in archaea: implications for the evolution of ssDNA-binding proteins.

作者信息

Chédin F, Seitz E M, Kowalczykowski S C

机构信息

Section of Microbiology, University of California, Davis 95616-8665, USA.

出版信息

Trends Biochem Sci. 1998 Aug;23(8):273-7. doi: 10.1016/s0968-0004(98)01243-2.

DOI:10.1016/s0968-0004(98)01243-2
PMID:9757822
Abstract

In Bacteria and Eukarya, ssDNA-binding proteins are central to most aspects of DNA metabolism. Until recently, however, no counterpart of an ssDNA-binding protein had been identified in the third domain of life, Archaea. Here, we report the discovery of a novel type of ssDNA-binding protein in the genomes of several archaeons. These proteins, in contrast to all known members of this protein family, possess four conserved DNA-binding sites within a single polypeptide or, in one case, two polypeptides. This peculiar structural organization allows us to propose a model for the evolution of this class of proteins.

摘要

在细菌和真核生物中,单链DNA结合蛋白是DNA代谢大多数方面的核心。然而,直到最近,在生命的第三个域——古菌中,尚未发现单链DNA结合蛋白的对应物。在此,我们报告在几种古菌的基因组中发现了一种新型单链DNA结合蛋白。与该蛋白家族的所有已知成员不同,这些蛋白在单个多肽内或在一种情况下在两个多肽内具有四个保守的DNA结合位点。这种独特的结构组织使我们能够提出这类蛋白的进化模型。

相似文献

1
Novel homologs of replication protein A in archaea: implications for the evolution of ssDNA-binding proteins.古菌中复制蛋白A的新型同源物:对单链DNA结合蛋白进化的启示。
Trends Biochem Sci. 1998 Aug;23(8):273-7. doi: 10.1016/s0968-0004(98)01243-2.
2
Identification and characterization of a single-stranded DNA-binding protein from the archaeon Methanococcus jannaschii.詹氏甲烷球菌单链DNA结合蛋白的鉴定与特性分析
Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Dec 8;95(25):14634-9. doi: 10.1073/pnas.95.25.14634.
3
Insights into ssDNA recognition by the OB fold from a structural and thermodynamic study of Sulfolobus SSB protein.通过对嗜热栖热菌单链结合蛋白的结构和热力学研究洞察OB折叠对单链DNA的识别。
EMBO J. 2003 Jun 2;22(11):2561-70. doi: 10.1093/emboj/cdg272.
4
Structural and functional analyses of five conserved positively charged residues in the L1 and N-terminal DNA binding motifs of archaeal RADA protein.古菌 RADA 蛋白 L1 和 N 端 DNA 结合基序中五个保守正电荷残基的结构和功能分析。
PLoS One. 2007 Sep 12;2(9):e858. doi: 10.1371/journal.pone.0000858.
5
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) -- sources and applications in molecular biology.单链DNA结合蛋白(SSB)——分子生物学中的来源及应用
Acta Biochim Pol. 2005;52(3):569-74. Epub 2005 Aug 4.
6
Escherichia coli RecO protein anneals ssDNA complexed with its cognate ssDNA-binding protein: A common step in genetic recombination.大肠杆菌RecO蛋白使与其同源单链DNA结合蛋白复合的单链DNA退火:基因重组中的一个常见步骤。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Nov 26;99(24):15327-32. doi: 10.1073/pnas.252633399. Epub 2002 Nov 18.
7
Single-Stranded DNA-Binding Proteins in the Archaea.古菌中的单链 DNA 结合蛋白。
Methods Mol Biol. 2021;2281:23-47. doi: 10.1007/978-1-0716-1290-3_2.
8
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains.嗜热栖热菌和嗜热水栖热菌单链DNA结合蛋白的鉴定与表征——结合结构域的新排列
Microbiology (Reading). 2002 Oct;148(Pt 10):3307-3315. doi: 10.1099/00221287-148-10-3307.
9
A distinctive single-strand DNA-binding protein from the Archaeon Sulfolobus solfataricus.一种来自嗜热栖热菌的独特单链DNA结合蛋白。
Mol Microbiol. 2002 Mar;43(6):1505-15. doi: 10.1046/j.1365-2958.2002.02807.x.
10
Identification and characterization of the fourth single-stranded-DNA binding domain of replication protein A.复制蛋白A的第四个单链DNA结合结构域的鉴定与表征
Mol Cell Biol. 1998 Dec;18(12):7225-34. doi: 10.1128/MCB.18.12.7225.

引用本文的文献

1
Design, Expression, and Purification of a Fusion Enzyme Containing Terminal Deoxynucleotidyl Transferase from and DNA-Binding Proteins from .一种包含来自[具体来源1]的末端脱氧核苷酸转移酶和来自[具体来源2]的DNA结合蛋白的融合酶的设计、表达及纯化
Protein Pept Lett. 2025;32(5):353-367. doi: 10.2174/0109298665372636250504084653.
2
The Impact of Single-Stranded DNA-Binding Protein SSB and Putative SSB-Interacting Proteins on Genome Integrity in the Thermophilic Crenarchaeon .单链结合蛋白 SSB 及其假定的 SSB 相互作用蛋白对嗜热古菌基因组完整性的影响。
Int J Mol Sci. 2023 Feb 25;24(5):4558. doi: 10.3390/ijms24054558.
3
The Finely Coordinated Action of SSB and NurA/HerA Complex Strictly Regulates the DNA End Resection Process in .
SSB 和 NurA/HerA 复合物的精细协调作用严格调节 . 中的 DNA 末端切除过程。
Int J Mol Sci. 2022 Feb 26;23(5):2582. doi: 10.3390/ijms23052582.
4
Single-Stranded DNA-Binding Proteins in the Archaea.古菌中的单链 DNA 结合蛋白。
Methods Mol Biol. 2021;2281:23-47. doi: 10.1007/978-1-0716-1290-3_2.
5
The Essential, Ubiquitous Single-Stranded DNA-Binding Proteins.必需的、普遍存在的单链 DNA 结合蛋白。
Methods Mol Biol. 2021;2281:1-21. doi: 10.1007/978-1-0716-1290-3_1.
6
-a model archaeon for studying DNA replication and repair.一种研究 DNA 复制和修复的模式古菌。
Open Biol. 2020 Dec;10(12):200293. doi: 10.1098/rsob.200293. Epub 2020 Dec 2.
7
Dynamic elements of replication protein A at the crossroads of DNA replication, recombination, and repair.复制蛋白 A 的动态元件在 DNA 复制、重组和修复的交汇点。
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2020 Oct;55(5):482-507. doi: 10.1080/10409238.2020.1813070. Epub 2020 Aug 28.
8
Snapshots of archaeal DNA replication and repair in living cells using super-resolution imaging.利用超分辨率成像技术在活细胞中观察古菌 DNA 的复制和修复。
Nucleic Acids Res. 2018 Nov 16;46(20):10757-10770. doi: 10.1093/nar/gky829.
9
Evolving Linear Chromosomes and Telomeres: A C-Strand-Centric View.线性染色体和端粒的进化:以 C 链为中心的观点。
Trends Biochem Sci. 2018 May;43(5):314-326. doi: 10.1016/j.tibs.2018.02.008. Epub 2018 Mar 14.
10
Archaeal genome guardians give insights into eukaryotic DNA replication and damage response proteins.古菌基因组守护者为真核生物 DNA 复制和损伤反应蛋白提供了新的见解。
Archaea. 2014 Feb 20;2014:206735. doi: 10.1155/2014/206735. eCollection 2014.