• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

域服务器:通过BLAST搜索直接预测蛋白质域同源性。

The domain-server: direct prediction of protein domain-homologies from BLAST search.

作者信息

Murvai J, Vlahovicek K, Barta E, Parthasarathy S, Hegyi H, Pfeiffer F, Pongor S

机构信息

International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology, 34012 Trieste, Italy.

出版信息

Bioinformatics. 1999 Apr;15(4):343-4. doi: 10.1093/bioinformatics/15.4.343.

DOI:10.1093/bioinformatics/15.4.343
PMID:10320404
Abstract

RESULTS

A WWW server for protein domain homology prediction, based on BLAST search and a simple data-mining algorithm (Hegyi,H. and Pongor,S. (1993) Comput. Appl. Biosci., 9, 371-372), was constructed providing a tabulated list and a graphic plot of similarities.

AVAILABILITY

http://www.icgeb.trieste.it/domain. Mirror site is available at http://sbase.abc.hu/domain. A standalone programme will be available on request.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

A series of help files is available at the above addresses.

摘要

结果

构建了一个基于BLAST搜索和简单数据挖掘算法(Hegyi, H. 和Pongor, S. (1993) Comput. Appl. Biosci., 9, 371 - 372)的蛋白质结构域同源性预测万维网服务器,它提供相似性的列表表格和图形化展示。

可用性

http://www.icgeb.trieste.it/domain 。镜像站点为http://sbase.abc.hu/domain 。可根据要求提供独立程序。

补充信息

在上述地址可获取一系列帮助文件。

相似文献

1
The domain-server: direct prediction of protein domain-homologies from BLAST search.域服务器:通过BLAST搜索直接预测蛋白质域同源性。
Bioinformatics. 1999 Apr;15(4):343-4. doi: 10.1093/bioinformatics/15.4.343.
2
The SBASE protein domain library, release 6.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第6.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):257-9. doi: 10.1093/nar/27.1.257.
3
The SBASE protein domain library, release 5.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第5.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):240-3. doi: 10.1093/nar/25.1.240.
4
The SBASE protein domain library, release 3.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第3.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3610-5.
5
The SBASE protein domain library, Release 4.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第4.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):210-3. doi: 10.1093/nar/24.1.210.
6
The SBASE protein domain library, release 2.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第2版:带注释的蛋白质序列片段集合
Nucleic Acids Res. 1993 Jul 1;21(13):3111-5. doi: 10.1093/nar/21.13.3111.
7
The SBASE protein domain library, release 9.0: an online resource for protein domain identification.SBASE蛋白质结构域文库,第9.0版:用于蛋白质结构域鉴定的在线资源。
Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):273-5. doi: 10.1093/nar/30.1.273.
8
The SBASE domain library: a collection of annotated protein segments.SBASE结构域文库:带注释的蛋白质片段集合。
Protein Eng. 1993 Jun;6(4):391-5. doi: 10.1093/protein/6.4.391.
9
The SBASE domain sequence library, release 10: domain architecture prediction.SBASE结构域序列库,第10版:结构域架构预测
Nucleic Acids Res. 2003 Jan 1;31(1):403-5. doi: 10.1093/nar/gkg098.
10
The SBASE protein domain library, release 7.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第7.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):260-2. doi: 10.1093/nar/28.1.260.

引用本文的文献

1
Fast and sensitive alignment of microbial whole genome sequencing reads to large sequence datasets on a desktop PC: application to metagenomic datasets and pathogen identification.在台式计算机上实现微生物全基因组测序读数与大型序列数据集的快速灵敏比对:在宏基因组数据集及病原体鉴定中的应用
PLoS One. 2014 Jul 31;9(7):e103441. doi: 10.1371/journal.pone.0103441. eCollection 2014.
2
CX, DPX and PRIDE: WWW servers for the analysis and comparison of protein 3D structures.CX、DPX和PRIDE:用于蛋白质三维结构分析与比较的万维网服务器。
Nucleic Acids Res. 2005 Jul 1;33(Web Server issue):W252-4. doi: 10.1093/nar/gki362.
3
The SBASE domain sequence resource, release 12: prediction of protein domain-architecture using support vector machines.
SBASE结构域序列资源,第12版:使用支持向量机预测蛋白质结构域架构
Nucleic Acids Res. 2005 Jan 1;33(Database issue):D223-5. doi: 10.1093/nar/gki112.
4
Prediction of protein functional domains from sequences using artificial neural networks.使用人工神经网络从序列预测蛋白质功能结构域。
Genome Res. 2001 Aug;11(8):1410-7. doi: 10.1101/gr.168701.
5
The SBASE protein domain library, release 8.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第8.0版:注释蛋白质序列片段集合
Nucleic Acids Res. 2001 Jan 1;29(1):58-60. doi: 10.1093/nar/29.1.58.
6
The SBASE protein domain library, release 7.0: a collection of annotated protein sequence segments.SBASE蛋白质结构域文库,第7.0版:带注释的蛋白质序列片段集合。
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):260-2. doi: 10.1093/nar/28.1.260.