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ACGT——一种比较基因组学工具。

ACGT-a comparative genomics tool.

作者信息

Xie Tao, Hood Leroy

机构信息

Institute for Systems Biology, 1441 North 34th Street, Seattle, WA 98103, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2003 May 22;19(8):1039-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btg121.

Abstract

SUMMARY

ACGT (a comparative genomics tool) is a genomic DNA sequence comparison viewer and analyzer. It can read a pair of DNA sequences in GenBank, Embl or Fasta formats, with or without a comparison file, and provide users with many options to view and analyze the similarities between the input sequences. It is written in Java and can be run on Unix, Linux and Windows platforms.

AVAILABILITY

The ACGT program is freely available with documentation and examples at website: http://db.systemsbiology.net/projects/local/mhc/acgt/

摘要

摘要

ACGT(一种比较基因组学工具)是一个基因组DNA序列比较查看器和分析器。它可以读取GenBank、Embl或Fasta格式的一对DNA序列,有无比较文件均可,并为用户提供许多选项来查看和分析输入序列之间的相似性。它用Java编写,可在Unix、Linux和Windows平台上运行。

可用性

ACGT程序可在网站http://db.systemsbiology.net/projects/local/mhc/acgt/上免费获取,同时还提供文档和示例。

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