• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

半经验方法参数的优化IV:将MNDO、AM1和PM3扩展到更多主族元素。

Optimization of parameters for semiempirical methods IV: extension of MNDO, AM1, and PM3 to more main group elements.

作者信息

Stewart James J P

机构信息

Stewart Computational Chemistry, 15210 Paddington Circle, Colorado Springs CO 80921, USA.

出版信息

J Mol Model. 2004 Apr;10(2):155-64. doi: 10.1007/s00894-004-0183-z. Epub 2004 Mar 2.

DOI:10.1007/s00894-004-0183-z
PMID:14997367
Abstract

The NDDO semiempirical methods MNDO, AM1, and PM3 have been extended to all the remaining non-radioactive elements of the main group, excluding the noble gases. Most of the new elements are of Groups I and II. 44 sets of parameters are presented for the following methods and elements. MNDO: Na, Mg, K, Ca, Ga, As, Se, Rb, Sr, In, Sb, Te, Cs, Ba, Tl, and Bi; AM1: Li, Be, Na, Mg, K, Ca, Ga, As, Se, Rb, Sr, In, Sn, Sb, Te, Cs, Ba, Tl, Pb, and Bi; PM3: B, Na, K, Ca, Rb, Sr, Cs, and Ba. Average errors are presented for heats of formation, molecular geometries, etc.

摘要

NDDO半经验方法MNDO、AM1和PM3已扩展到主族中除稀有气体外的所有其余非放射性元素。大多数新元素属于第I族和第II族。给出了针对以下方法和元素的44组参数。MNDO:钠、镁、钾、钙、镓、砷、硒、铷、锶、铟、锑、碲、铯、钡、铊和铋;AM1:锂、铍、钠、镁、钾、钙、镓、砷、硒、铷、锶、铟、锡、锑、碲、铯、钡、铊、铅和铋;PM3:硼、钠、钾、钙、铷、锶、铯和钡。给出了生成热、分子几何结构等的平均误差。

相似文献

1
Optimization of parameters for semiempirical methods IV: extension of MNDO, AM1, and PM3 to more main group elements.半经验方法参数的优化IV:将MNDO、AM1和PM3扩展到更多主族元素。
J Mol Model. 2004 Apr;10(2):155-64. doi: 10.1007/s00894-004-0183-z. Epub 2004 Mar 2.
2
Extension of the PDDG/PM3 and PDDG/MNDO semiempirical molecular orbital methods to the halogens.将PDDG/PM3和PDDG/MNDO半经验分子轨道方法扩展至卤素。
J Comput Chem. 2004 Jan 15;25(1):138-50. doi: 10.1002/jcc.10356.
3
A discriminant analysis of trace elements in scalp hair of healthy controls and stage-IIIB non-small cell lung cancer (NSCLC) patients.健康对照者和 IIIB 期非小细胞肺癌(NSCLC)患者头皮头发中微量元素的判别分析。
Biol Trace Elem Res. 2011 Dec;144(1-3):272-94. doi: 10.1007/s12011-011-9086-x. Epub 2011 May 27.
4
Evaluation of strontium isotope abundance ratios in combination with multi-elemental analysis as a possible tool to study the geographical origin of ciders.结合多元素分析评估锶同位素丰度比作为研究苹果酒地理来源的一种可能工具。
Anal Chim Acta. 2007 May 2;590(1):55-66. doi: 10.1016/j.aca.2007.03.016. Epub 2007 Mar 15.
5
PDDG/PM3 and PDDG/MNDO: improved semiempirical methods.PDDG/PM3和PDDG/MNDO:改进的半经验方法。
J Comput Chem. 2002 Dec;23(16):1601-22. doi: 10.1002/jcc.10162.
6
Improved semiempirical heats of formation through the use of bond and group equivalents.通过使用键和基团当量改进半经验生成热。
J Comput Chem. 2002 Mar;23(4):498-510. doi: 10.1002/jcc.10023.
7
Extension of the PDDG/PM3 Semiempirical Molecular Orbital Method to Sulfur, Silicon, and Phosphorus.将PDDG/PM3半经验分子轨道方法扩展至硫、硅和磷
J Chem Theory Comput. 2005;1(5):817-23. doi: 10.1021/ct0500287.
8
RM1: a reparameterization of AM1 for H, C, N, O, P, S, F, Cl, Br, and I.RM1:对氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯、溴和碘的AM1进行的重新参数化。
J Comput Chem. 2006 Jul 30;27(10):1101-11. doi: 10.1002/jcc.20425.
9
Comparison of SCC-DFTB and NDDO-based semiempirical molecular orbital methods for organic molecules.用于有机分子的SCC-DFTB和基于NDDO的半经验分子轨道方法的比较。
J Phys Chem A. 2006 Dec 21;110(50):13551-9. doi: 10.1021/jp064544k.
10
Using elemental profiles and stable isotopes to trace the origin of green coffee beans on the global market.利用元素特征和稳定同位素追踪全球市场上的绿咖啡豆的来源。
J Mass Spectrom. 2012 Sep;47(9):1132-40. doi: 10.1002/jms.3018.

引用本文的文献

1
Xylazine as an emerging new psychoactive substance; focuses on both 5-HT and κ-opioid receptors' molecular interactions and isosteric replacement.赛拉嗪作为一种新兴的新型精神活性物质;聚焦于5-羟色胺和κ-阿片受体的分子相互作用及等排取代。
Arch Pharm (Weinheim). 2025 Mar;358(3):e2500041. doi: 10.1002/ardp.202500041.
2
Legion: A Platform for Gaussian Wavepacket Nonadiabatic Dynamics.《军团:高斯波包非绝热动力学的一个平台》
J Chem Theory Comput. 2025 Mar 11;21(5):2189-2205. doi: 10.1021/acs.jctc.4c01697. Epub 2025 Mar 2.
3
Production of Prophylactic Nanoformulation for Dental Caries and Investigation of Its Effectiveness by In Vitro and In Silico Methods.
用于龋齿的预防性纳米制剂的制备及其体外和计算机模拟方法有效性研究。
Pharmaceutics. 2025 Jan 27;17(2):167. doi: 10.3390/pharmaceutics17020167.
4
Geometry-Corrected Quadratic Optimization Algorithm for NDDO-Descendant Semiempirical Models.用于NDDO衍生半经验模型的几何校正二次优化算法
J Chem Theory Comput. 2025 Jan 14;21(1):138-154. doi: 10.1021/acs.jctc.4c01070. Epub 2024 Dec 18.
5
Antiviral efficacy of heparan sulfate and enoxaparin sodium against SARS-CoV-2.硫酸乙酰肝素和依诺肝素钠对严重急性呼吸综合征冠状病毒2的抗病毒疗效。
Arch Pharm (Weinheim). 2025 Jan;358(1):e2400545. doi: 10.1002/ardp.202400545. Epub 2024 Nov 9.
6
Substrate Turnover Dynamics Guide Ketol-Acid Reductoisomerase Redesign for Increased Specific Activity.底物周转动力学指导酮酸还原异构酶的重新设计以提高比活性。
ACS Catal. 2024 Jun 26;14(14):10491-10509. doi: 10.1021/acscatal.4c01446. eCollection 2024 Jul 19.
7
Benchmarking different docking protocols for predicting the binding poses of ligands complexed with cyclooxygenase enzymes and screening chemical libraries.对不同对接协议进行基准测试,以预测与环氧化酶复合的配体的结合姿势并筛选化学文库。
Bioimpacts. 2024;14(2):29955. doi: 10.34172/bi.2023.29955. Epub 2023 Sep 12.
8
Cysteine and homocysteine can be exploited by GPX4 in ferroptosis inhibition independent of GSH synthesis.半胱氨酸和同型半胱氨酸可在谷胱甘肽过氧化物酶 4(GPX4)的作用下被抑制,而不依赖于谷胱甘肽(GSH)的合成,这一过程在铁死亡中起关键作用。
Redox Biol. 2024 Feb;69:102999. doi: 10.1016/j.redox.2023.102999. Epub 2023 Dec 22.
9
Açaí ( Mart.) Seed Oil Exerts a Cytotoxic Role over Colorectal Cancer Cells: Insights of Annexin A2 Regulation and Molecular Modeling.阿萨伊(Mart.)籽油对结肠癌细胞发挥细胞毒性作用:膜联蛋白A2调控及分子建模的见解
Metabolites. 2023 Jun 25;13(7):789. doi: 10.3390/metabo13070789.
10
Molecular Dynamics Force Field Parameters for the EGFP Chromophore and Some of Its Analogues.EGFP 发色团及其一些类似物的分子动力学力场参数。
J Phys Chem B. 2023 Jul 6;127(26):5772-5788. doi: 10.1021/acs.jpcb.3c01486. Epub 2023 Jun 26.