• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

将微阵列数据提交至公共数据库。

Submission of microarray data to public repositories.

作者信息

Ball Catherine A, Brazma Alvis, Causton Helen, Chervitz Steve, Edgar Ron, Hingamp Pascal, Matese John C, Parkinson Helen, Quackenbush John, Ringwald Martin, Sansone Susanna-Assunta, Sherlock Gavin, Spellman Paul, Stoeckert Chris, Tateno Yoshio, Taylor Ronald, White Joseph, Winegarden Neil

机构信息

Department of Biochemistry, Stanford University School of Medicine, Stanford, California, USA.

出版信息

PLoS Biol. 2004 Sep;2(9):E317. doi: 10.1371/journal.pbio.0020317. Epub 2004 Aug 31.

DOI:10.1371/journal.pbio.0020317
PMID:15340489
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC514887/
Abstract

The Microarray Gene Expression Data Society believe that the time is right for journals to require that microarray data be deposited in public repositories, as a condition for publication

摘要

微阵列基因表达数据协会认为,现在是时候让期刊要求将微阵列数据存入公共储存库,作为发表的条件了。

相似文献

1
Submission of microarray data to public repositories.将微阵列数据提交至公共数据库。
PLoS Biol. 2004 Sep;2(9):E317. doi: 10.1371/journal.pbio.0020317. Epub 2004 Aug 31.
2
Mandatory submission of microarray data to public repositories: how is it working?将微阵列数据强制提交至公共数据库:进展如何?
Physiol Genomics. 2005 Jan 20;20(2):153-6. doi: 10.1152/physiolgenomics.00264.2004.
3
MARS: microarray analysis, retrieval, and storage system.MARS:微阵列分析、检索与存储系统。
BMC Bioinformatics. 2005 Apr 18;6:101. doi: 10.1186/1471-2105-6-101.
4
MicroGen: a MIAME compliant web system for microarray experiment information and workflow management.MicroGen:一个符合MIAME标准的用于微阵列实验信息和工作流程管理的网络系统。
BMC Bioinformatics. 2005 Dec 1;6 Suppl 4(Suppl 4):S6. doi: 10.1186/1471-2105-6-S4-S6.
5
Microarray databases: storage and retrieval of microarray data.微阵列数据库:微阵列数据的存储与检索
Methods Mol Biol. 2003;224:235-48. doi: 10.1385/1-59259-364-X:235.
6
Microarray databases: standards and ontologies.微阵列数据库:标准与本体论。
Nat Genet. 2002 Dec;32 Suppl:469-73. doi: 10.1038/ng1028.
7
GeneCruiser: a web service for the annotation of microarray data.基因巡航者:一个用于微阵列数据注释的网络服务。
Bioinformatics. 2005 Sep 15;21(18):3681-2. doi: 10.1093/bioinformatics/bti587. Epub 2005 Jul 19.
8
Bioinformatics: bringing it all together.生物信息学:整合一切。
Nature. 2002 Oct 17;419(6908):751, 753, 755 passim. doi: 10.1038/419751a.
9
BarleyExpress: a web-based submission tool for enriched microarray database annotations.大麦表达:一个用于丰富微阵列数据库注释的基于网络的提交工具。
Bioinformatics. 2005 Feb 1;21(3):399-401. doi: 10.1093/bioinformatics/bti002. Epub 2004 Sep 3.
10
A method of microarray data storage using array data type.一种使用阵列数据类型的微阵列数据存储方法。
Comput Biol Chem. 2007 Apr;31(2):143-7. doi: 10.1016/j.compbiolchem.2007.01.004. Epub 2007 Jan 12.

引用本文的文献

1
Responsible, practical genomic data sharing that accelerates research.负责任、实用的基因组数据共享,加速研究。
Nat Rev Genet. 2020 Oct;21(10):615-629. doi: 10.1038/s41576-020-0257-5. Epub 2020 Jul 21.
2
Common Gene Expression Patterns in Environmental Model Organisms Exposed to Engineered Nanomaterials: A Meta-Analysis.暴露于工程纳米材料的环境模式生物中的常见基因表达模式:一项荟萃分析。
Environ Sci Technol. 2020 Jan 7;54(1):335-344. doi: 10.1021/acs.est.9b05170. Epub 2019 Dec 13.
3
Predictability of human differential gene expression.人类差异基因表达的可预测性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Mar 26;116(13):6491-6500. doi: 10.1073/pnas.1802973116. Epub 2019 Mar 7.
4
How Many Lymph Nodes Are Enough? Assessing the Adequacy of Lymph Node Yield for Papillary Thyroid Cancer.多少个淋巴结才算足够?评估甲状腺乳头状癌淋巴结切除量的充足性
J Clin Oncol. 2016 Oct 1;34(28):3434-9. doi: 10.1200/JCO.2016.67.6437. Epub 2016 Aug 15.
5
From System-Wide Differential Gene Expression to Perturbed Regulatory Factors: A Combinatorial Approach.从全系统差异基因表达到受干扰的调控因子:一种组合方法。
PLoS One. 2015 Nov 12;10(11):e0142147. doi: 10.1371/journal.pone.0142147. eCollection 2015.
6
Databases for Microbiologists.微生物学家专用数据库。
J Bacteriol. 2015 Aug 1;197(15):2458-67. doi: 10.1128/JB.00330-15. Epub 2015 May 26.
7
The carbon starvation response of the ectomycorrhizal fungus Paxillus involutus.外生菌根真菌卷缘桩菇的碳饥饿响应
FEMS Microbiol Ecol. 2015 Apr;91(4). doi: 10.1093/femsec/fiv027. Epub 2015 Mar 15.
8
The molecular components of the extracellular protein-degradation pathways of the ectomycorrhizal fungus Paxillus involutus.外生菌根真菌离褶伞(Paxillus involutus)细胞外蛋白降解途径的分子成分。
New Phytol. 2013 Nov;200(3):875-887. doi: 10.1111/nph.12425. Epub 2013 Jul 31.
9
Using genome-wide expression profiling to define gene networks relevant to the study of complex traits: from RNA integrity to network topology.利用全基因组表达谱分析定义与复杂性状研究相关的基因网络:从 RNA 完整性到网络拓扑结构。
Int Rev Neurobiol. 2012;104:91-133. doi: 10.1016/B978-0-12-398323-7.00005-7.
10
How can microarrays unlock asthma?微阵列如何揭示哮喘的奥秘?
J Allergy (Cairo). 2012;2012:241314. doi: 10.1155/2012/241314. Epub 2012 Feb 6.

本文引用的文献

1
CIBEX: center for information biology gene expression database.CIBEX:信息生物学基因表达数据库中心
C R Biol. 2003 Oct-Nov;326(10-11):1079-82. doi: 10.1016/j.crvi.2003.09.034.
2
ArrayExpress--a public repository for microarray gene expression data at the EBI.ArrayExpress——欧洲生物信息研究所(EBI)的一个微阵列基因表达数据公共储存库。
Nucleic Acids Res. 2003 Jan 1;31(1):68-71. doi: 10.1093/nar/gkg091.
3
The underlying principles of scientific publication.科学出版的基本原则。
Bioinformatics. 2002 Nov;18(11):1409. doi: 10.1093/bioinformatics/18.11.1409.
4
Standards for microarray data.微阵列数据标准。
Science. 2002 Oct 18;298(5593):539. doi: 10.1126/science.298.5593.539b.
5
Design and implementation of microarray gene expression markup language (MAGE-ML).微阵列基因表达标记语言(MAGE-ML)的设计与实现。
Genome Biol. 2002 Aug 23;3(9):RESEARCH0046. doi: 10.1186/gb-2002-3-9-research0046.
6
Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository.基因表达综合数据库:美国国立生物技术信息中心的基因表达与杂交阵列数据储存库。
Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):207-10. doi: 10.1093/nar/30.1.207.
7
Minimum information about a microarray experiment (MIAME)-toward standards for microarray data.微阵列实验最少信息(MIAME)——迈向微阵列数据标准
Nat Genet. 2001 Dec;29(4):365-71. doi: 10.1038/ng1201-365.