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逆转录转座子对人类基因组进化的影响。

The impact of retrotransposons on human genome evolution.

作者信息

Cordaux Richard, Batzer Mark A

机构信息

CNRS UMR 6556 Ecologie, Evolution, Symbiose, Université de Poitiers, 40 Avenue du Recteur Pineau, Poitiers, France.

出版信息

Nat Rev Genet. 2009 Oct;10(10):691-703. doi: 10.1038/nrg2640.

Abstract

Their ability to move within genomes gives transposable elements an intrinsic propensity to affect genome evolution. Non-long terminal repeat (LTR) retrotransposons--including LINE-1, Alu and SVA elements--have proliferated over the past 80 million years of primate evolution and now account for approximately one-third of the human genome. In this Review, we focus on this major class of elements and discuss the many ways that they affect the human genome: from generating insertion mutations and genomic instability to altering gene expression and contributing to genetic innovation. Increasingly detailed analyses of human and other primate genomes are revealing the scale and complexity of the past and current contributions of non-LTR retrotransposons to genomic change in the human lineage.

摘要

转座元件在基因组内移动的能力使其具有影响基因组进化的内在倾向。非长末端重复(LTR)逆转录转座子——包括LINE-1、Alu和SVA元件——在过去8000万年的灵长类动物进化过程中大量增殖,如今约占人类基因组的三分之一。在本综述中,我们聚焦于这一主要的元件类别,并讨论它们影响人类基因组的多种方式:从产生插入突变和基因组不稳定性到改变基因表达以及促进遗传创新。对人类和其他灵长类动物基因组越来越详细的分析揭示了非LTR逆转录转座子过去和当前对人类谱系基因组变化贡献的规模和复杂性。

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2
Exon-trapping mediated by the human retrotransposon SVA.由人类反转录转座子 SVA 介导的外显子捕获。
Genome Res. 2009 Nov;19(11):1983-91. doi: 10.1101/gr.093153.109. Epub 2009 Jul 27.

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