• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

多项式和有理系统的结构可辨识性。

Structural identifiability of polynomial and rational systems.

机构信息

Centrum Wiskunde and Informatica, Amsterdam, The Netherlands.

出版信息

Math Biosci. 2010 Feb;223(2):83-96. doi: 10.1016/j.mbs.2009.11.002. Epub 2009 Nov 12.

DOI:10.1016/j.mbs.2009.11.002
PMID:19913563
Abstract

Since analysis and simulation of biological phenomena require the availability of their fully specified models, one needs to be able to estimate unknown parameter values of the models. In this paper we deal with identifiability of parametrizations which is the property of one-to-one correspondence of parameter values and the corresponding outputs of the models. Verification of identifiability of a parametrization precedes estimation of numerical values of parameters, and thus determination of a fully specified model of a considered phenomenon. We derive necessary and sufficient conditions for the parametrizations of polynomial and rational systems to be structurally or globally identifiable. The results are applied to investigate the identifiability properties of the system modeling a chain of two enzyme-catalyzed irreversible reactions. The other examples deal with the phenomena modeled by using Michaelis-Menten kinetics and the model of a peptide chain elongation.

摘要

由于分析和模拟生物现象需要有其完整指定模型的支持,因此需要能够估计模型中未知参数的值。在本文中,我们处理参数化的可识别性问题,这是参数值和模型对应输出之间一一对应关系的属性。参数化的可识别性验证先于参数数值的估计,因此确定所考虑现象的完整指定模型。我们推导出多项式和有理系统参数化在结构上或全局上可识别的充要条件。这些结果应用于研究模拟两个酶促不可逆反应链的系统的可识别性特性。其他示例涉及使用米氏动力学和肽链延伸模型建模的现象。

相似文献

1
Structural identifiability of polynomial and rational systems.多项式和有理系统的结构可辨识性。
Math Biosci. 2010 Feb;223(2):83-96. doi: 10.1016/j.mbs.2009.11.002. Epub 2009 Nov 12.
2
Parameter identifiability and estimation of HIV/AIDS dynamic models.艾滋病动态模型的参数可识别性与估计
Bull Math Biol. 2008 Apr;70(3):785-99. doi: 10.1007/s11538-007-9279-9. Epub 2008 Feb 5.
3
Cellular signaling identifiability analysis: a case study.细胞信号识别分析:案例研究。
J Theor Biol. 2010 May 21;264(2):528-37. doi: 10.1016/j.jtbi.2010.02.029. Epub 2010 Feb 24.
4
Global identifiability of nonlinear models of biological systems.生物系统非线性模型的全局可识别性。
IEEE Trans Biomed Eng. 2001 Jan;48(1):55-65. doi: 10.1109/10.900248.
5
Modeling aerobic carbon source degradation processes using titrimetric data and combined respirometric-titrimetric data: structural and practical identifiability.利用滴定数据以及呼吸量测定-滴定联合数据对好氧碳源降解过程进行建模:结构可识别性与实际可识别性
Biotechnol Bioeng. 2002 Sep 30;79(7):754-67. doi: 10.1002/bit.10337.
6
Practical identifiability of biokinetic parameters of a model describing two-step nitrification in biofilms.描述生物膜中两步硝化作用模型的生物动力学参数的实际可识别性
Biotechnol Bioeng. 2008 Oct 15;101(3):497-514. doi: 10.1002/bit.21932.
7
Prediction of enzyme kinetic parameters based on statistical learning.基于统计学习的酶动力学参数预测
Genome Inform. 2006;17(1):80-7.
8
Structural identifiability of PBPK models: practical consequences for modeling strategies and study designs.生理药代动力学(PBPK)模型的结构可识别性:对建模策略和研究设计的实际影响。
Crit Rev Toxicol. 1997 May;27(3):261-72. doi: 10.3109/10408449709089895.
9
The total quasi-steady-state approximation for fully competitive enzyme reactions.完全竞争性酶反应的总准稳态近似法
Bull Math Biol. 2007 Jan;69(1):433-57. doi: 10.1007/s11538-006-9136-2. Epub 2006 Jul 19.
10
A simplified method to assess structurally identifiable parameters in Monod-based activated sludge models.一种评估基于莫诺德方程的活性污泥模型中结构可识别参数的简化方法。
Water Res. 2003 Jul;37(12):2893-904. doi: 10.1016/S0043-1354(03)00114-3.

引用本文的文献

1
Parameter estimation and identifiability in a neural population model for electro-cortical activity.针对脑电活动的神经元群体模型中的参数估计和可识别性。
PLoS Comput Biol. 2019 May 30;15(5):e1006694. doi: 10.1371/journal.pcbi.1006694. eCollection 2019 May.
2
Structural identifiability for mathematical pharmacology: models of myelosuppression.结构可识别性在数学药理学中的应用:骨髓抑制模型。
J Pharmacokinet Pharmacodyn. 2018 Feb;45(1):79-90. doi: 10.1007/s10928-018-9569-x. Epub 2018 Feb 2.
3
The best models of metabolism.最佳代谢模型。
Wiley Interdiscip Rev Syst Biol Med. 2017 Nov;9(6). doi: 10.1002/wsbm.1391. Epub 2017 May 19.
4
Dynamic compensation, parameter identifiability, and equivariances.动态补偿、参数可识别性和等变性。
PLoS Comput Biol. 2017 Apr 6;13(4):e1005447. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005447. eCollection 2017 Apr.
5
Structural identifiability of equilibrium ligand-binding parameters.平衡配体结合参数的结构可识别性。
J Gen Physiol. 2017 Jan;149(1):105-119. doi: 10.1085/jgp.201611702. Epub 2016 Dec 19.
6
Reverse engineering and identification in systems biology: strategies, perspectives and challenges.系统生物学中的逆向工程与辨识:策略、观点与挑战。
J R Soc Interface. 2013 Dec 4;11(91):20130505. doi: 10.1098/rsif.2013.0505. Print 2014 Feb 6.
7
On the identifiability of metabolic network models.关于代谢网络模型的可识别性
J Math Biol. 2013 Dec;67(6-7):1795-832. doi: 10.1007/s00285-012-0614-x. Epub 2012 Nov 15.