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FlyTED:果蝇睾丸基因表达数据库。

FlyTED: the Drosophila Testis Gene Expression Database.

机构信息

Department of Zoology, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3PS, UK.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D710-5. doi: 10.1093/nar/gkp1006. Epub 2009 Nov 24.

DOI:10.1093/nar/gkp1006
PMID:19934263
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2808924/
Abstract

FlyTED, the Drosophila Testis Gene Expression Database, is a biological research database for gene expression images from the testis of the fruit fly Drosophila melanogaster. It currently contains 2762 mRNA in situ hybridization images and ancillary metadata revealing the patterns of gene expression of 817 Drosophila genes in testes of wild type flies and of seven meiotic arrest mutant strains in which spermatogenesis is defective. This database has been built by adapting a widely used digital library repository software system, EPrints (http://eprints.org/software/), and provides both web-based search and browse interfaces, and programmatic access via an SQL dump, OAI-PMH and SPARQL. FlyTED is available at http://www.fly-ted.org/.

摘要

FlyTED,即 Drosophila 睾丸基因表达数据库,是一个生物学研究数据库,用于存储果蝇 Drosophila melanogaster 睾丸基因表达的图像。它目前包含 2762 个 mRNA 原位杂交图像和辅助元数据,揭示了 817 个果蝇基因在野生型果蝇睾丸和 7 种减数分裂阻滞突变株中的基因表达模式,这些突变株的精子发生存在缺陷。这个数据库是通过改编一个广泛使用的数字图书馆存储库软件系统 EPrints(http://eprints.org/software/)构建的,它提供了基于网络的搜索和浏览界面,以及通过 SQL 转储、OAI-PMH 和 SPARQL 进行的编程访问。FlyTED 可在 http://www.fly-ted.org/ 获取。

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