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RNA序列、DNA序列和染色质特性是如何调节剪接的?

How do RNA sequence, DNA sequence, and chromatin properties regulate splicing?

作者信息

Ringrose Leonie

机构信息

IMBA - Institute of Molecular Biotechnology Dr Bohr-Gasse 3, 1030 Vienna Austria.

出版信息

F1000 Biol Rep. 2010 Oct 12;2:74. doi: 10.3410/B2-74.

Abstract

Recent genome-wide studies have revealed a remarkable correspondence between nucleosome positions and exon-intron boundaries, and several studies have implicated specific histone modifications in regulating alternative splicing. In addition, recent progress in cracking the 'splicing code' shows that sequence motifs carried on the nascent RNA molecule itself are sufficient to accurately predict tissue-specific alternative splicing patterns. Together, these studies shed light on the complex interplay between RNA sequence, DNA sequence, and chromatin properties in regulating splicing.

摘要

最近的全基因组研究揭示了核小体位置与外显子 - 内含子边界之间存在显著对应关系,并且多项研究表明特定的组蛋白修饰在调节可变剪接中发挥作用。此外,在破解“剪接密码”方面的最新进展表明,新生RNA分子自身携带的序列基序足以准确预测组织特异性可变剪接模式。这些研究共同揭示了RNA序列、DNA序列和染色质特性在调节剪接过程中的复杂相互作用。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6d79/2989630/80eff601717d/1757-594X-0002-0000000074-g001.jpg

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