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Easyfig:基因组比较可视化工具。

Easyfig: a genome comparison visualizer.

机构信息

Australian Infectious Diseases Research Centre, School of Chemistry and Molecular Biosciences, University of Queensland, Brisbane, QLD 4072, Australia.

出版信息

Bioinformatics. 2011 Apr 1;27(7):1009-10. doi: 10.1093/bioinformatics/btr039. Epub 2011 Jan 28.

DOI:10.1093/bioinformatics/btr039
PMID:21278367
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3065679/
Abstract

UNLABELLED

Easyfig is a Python application for creating linear comparison figures of multiple genomic loci with an easy-to-use graphical user interface. BLAST comparisons between multiple genomic regions, ranging from single genes to whole prokaryote chromosomes, can be generated, visualized and interactively coloured, enabling a rapid transition between analysis and the preparation of publication quality figures.

AVAILABILITY

Easyfig is freely available (under a GPL license) for download (for Mac OS X, Unix and Microsoft Windows) from the SourceForge web site: http://easyfig.sourceforge.net/.

摘要

未标注

Easyfig 是一个 Python 应用程序,用于创建多个基因组基因座的线性比较图,具有易于使用的图形用户界面。可以生成、可视化和交互式着色多个基因组区域(从单个基因到整个原核染色体)之间的 BLAST 比较,从而可以在分析和准备出版质量的图形之间快速转换。

可用性

Easyfig 可从 SourceForge 网站(http://easyfig.sourceforge.net/)免费下载(GPL 许可证),适用于 Mac OS X、Unix 和 Microsoft Windows。

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