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氨氧化土壤古菌“韩国亚硝化古菌” MY1 的基因组序列。

Genome sequence of an ammonia-oxidizing soil archaeon, "Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis" MY1.

机构信息

Industrial Biotechnology and Bioenergy Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, KRIBB, 125 Gwahak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 305-806, Republic of Korea.

出版信息

J Bacteriol. 2011 Oct;193(19):5539-40. doi: 10.1128/JB.05717-11.

DOI:10.1128/JB.05717-11
PMID:21914867
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3187385/
Abstract

Ammonia-oxidizing archaea are ubiquitous microorganisms which play important roles in global nitrogen and carbon cycle on earth. Here we present the high-quality draft genome sequence of an ammonia-oxidizing archaeon, "Candidatus Nitrosopumilus koreensis" MY1, that dominated an enrichment culture of a soil sample from the rhizosphere. Its genome contains genes for survival in the rhizosphere environment as well as those for carbon fixation and ammonium oxidation to nitrite.

摘要

氨氧化古菌是一种广泛存在的微生物，在地球的全球氮碳循环中发挥着重要作用。在这里，我们呈现了一株氨氧化古菌“Candidatus Nitrosopumilus koreensis”MY1 的高质量草图基因组序列，该菌在根际土壤样本的富集培养中占主导地位。其基因组包含了在根际环境中生存的基因，以及用于固碳和将氨氧化为亚硝酸盐的基因。