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《肠膜明串珠菌 KCTC 3525 的基因组序列》

Genome sequence of Leuconostoc carnosum KCTC 3525.

机构信息

Genome Resource Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahangno, Yuseong-gu, Daejeon 305-806, Republic of Korea.

出版信息

J Bacteriol. 2011 Nov;193(21):6100-1. doi: 10.1128/JB.06028-11.

DOI:10.1128/JB.06028-11
PMID:21994929
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3194921/
Abstract

We announce the draft genome sequence of the type strain Leuconostoc carnosum KCTC 3525 (3,234,408 bp with a G+C content of 40.9%), one of the most prevalent lactic acid bacteria present during the manufacturing process of vacuum-packaged meats, which consists of 2,407 large contigs (>500 bp in size). The genome sequence was obtained by a whole-genome shotgun strategy using Roche 454 GS (FLX Titanium) pyrosequencing, and all of the reads were assembled using Newbler Assembler 2.3.

摘要

我们宣布了一种最常见的乳酸细菌——肉罐头制造过程中存在的肠膜明串珠菌 KCTC 3525(3,234,408 bp,GC 含量为 40.9%)的菌株的基因组草案序列,该细菌由 2,407 个大的连续序列(>500 bp 大小)组成。基因组序列是通过使用罗氏 454 GS(FLX Titanium)焦磷酸测序的全基因组鸟枪法获得的,所有的读取序列都使用 Newbler Assembler 2.3 进行组装。