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四株石莼噬菌体的基因组草图序列:亚历山大藻噬菌体 EhV-88、EhV-201、EhV-207 和 EhV-208。

Draft genome sequence of four coccolithoviruses: Emiliania huxleyi virus EhV-88, EhV-201, EhV-207, and EhV-208.

机构信息

Plymouth Marine Laboratory, Plymouth, United Kingdom.

出版信息

J Virol. 2012 Mar;86(5):2896-7. doi: 10.1128/JVI.07046-11.

DOI:10.1128/JVI.07046-11
PMID:22328700
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3302265/
Abstract

The Coccolithoviridae are a group of viruses which infect the marine coccolithophorid microalga Emiliania huxleyi. The Emiliania huxleyi viruses (known as EhVs) described herein have 160- to 180-nm diameter icosahedral structures, have genomes of approximately 400 kbp, and consist of more than 450 predicted coding sequences (CDSs). Here, we describe the genomic features of four newly sequenced coccolithoviruses (EhV-88, EhV-201, EhV-207, and EhV-208) together with their draft genome sequences and their annotations, highlighting the homology and heterogeneity of these genomes to the EhV-86 model reference genome.

摘要

球石藻病毒科是一类感染海洋球石藻微藻的病毒。本文所描述的海洋球石藻病毒(简称 EhVs)具有 160-180nm 直径的二十面体结构,基因组约 400kbp,由超过 450 个预测的编码序列(CDS)组成。在这里,我们描述了四种新测序的球石藻病毒(EhV-88、EhV-201、EhV-207 和 EhV-208)的基因组特征,包括它们的草图基因组序列和注释,突出了这些基因组与 EhV-86 模型参考基因组的同源性和异质性。