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斐济:一个用于生物影像分析的开源平台。

Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.

机构信息

Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany.

出版信息

Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):676-82. doi: 10.1038/nmeth.2019.

Abstract

Fiji is a distribution of the popular open-source software ImageJ focused on biological-image analysis. Fiji uses modern software engineering practices to combine powerful software libraries with a broad range of scripting languages to enable rapid prototyping of image-processing algorithms. Fiji facilitates the transformation of new algorithms into ImageJ plugins that can be shared with end users through an integrated update system. We propose Fiji as a platform for productive collaboration between computer science and biology research communities.

摘要

Fiji 是一个专注于生物图像分析的流行开源软件 ImageJ 的发行版。 Fiji 采用现代软件工程实践,将强大的软件库与广泛的脚本语言相结合,使图像处理算法的快速原型设计成为可能。 Fiji 便于将新算法转换为 ImageJ 插件,并通过集成的更新系统与最终用户共享。我们提议将 Fiji 作为计算机科学和生物学研究社区之间富有成效的协作平台。

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