• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种重组 SARS 冠状病毒 nsp12 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的生化特性分析,该聚合酶能够复制病毒 RNA 模板。

Biochemical characterization of a recombinant SARS coronavirus nsp12 RNA-dependent RNA polymerase capable of copying viral RNA templates.

机构信息

Department of Biotechnology, Yonsei University, 134 Shinchon-dong, Seodaemun-gu, Seoul 120-749, Korea.

出版信息

Arch Virol. 2012 Nov;157(11):2095-104. doi: 10.1007/s00705-012-1404-x. Epub 2012 Jul 13.

DOI:10.1007/s00705-012-1404-x
PMID:22791111
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7086750/
Abstract

The severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) RNA genome is replicated by a virus-encoded RNA replicase, the key component of which is the nonstructural protein 12 (nsp12). In this report, we describe the biochemical properties of a full-length recombinant SARS-CoV nsp12 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) capable of copying viral RNA templates. The purified SARS-CoV nsp12 showed both primer-dependent and primer-independent RNA synthesis activities using homopolymeric RNA templates. The RdRp activity was strictly dependent on Mn(2+). The nsp12 preferentially copied homopolymeric pyrimidine RNA templates in the absence of an added oligonucleotide primer. It was also able to initiate de novo RNA synthesis from the 3'-ends of both the plus- and minus-strand genome of SARS-CoV, using the 3'-terminal 36- and 37-nt RNA, respectively. The in vitro RdRp assay system established with a full-length nsp12 will be useful for understanding the mechanisms of coronavirus replication and for the development of anti-SARS-CoV agents.

摘要

严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)的 RNA 基因组由病毒编码的 RNA 复制酶复制,该酶的关键组成部分是非结构蛋白 12(nsp12)。在本报告中,我们描述了全长重组 SARS-CoV nsp12 RNA 依赖性 RNA 聚合酶(RdRp)的生化特性,该聚合酶能够复制病毒 RNA 模板。纯化的 SARS-CoV nsp12 显示出使用同源多聚 RNA 模板的引物依赖性和引物非依赖性 RNA 合成活性。RdRp 活性严格依赖于 Mn(2+)。nsp12 在没有添加寡核苷酸引物的情况下优先复制非聚合嘧啶 RNA 模板。它还能够从 SARS-CoV 的正链和负链基因组的 3'末端从头开始合成 RNA,分别使用 3'末端 36 和 37 个核苷酸的 RNA。使用全长 nsp12 建立的体外 RdRp 测定系统将有助于理解冠状病毒复制的机制,并有助于开发抗 SARS-CoV 药物。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/fed19830689a/705_2012_1404_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/5da8cadfa8bf/705_2012_1404_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/9b61b80a10ff/705_2012_1404_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/ab1e307bea36/705_2012_1404_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/fed19830689a/705_2012_1404_Fig4_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/5da8cadfa8bf/705_2012_1404_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/9b61b80a10ff/705_2012_1404_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/ab1e307bea36/705_2012_1404_Fig3_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0700/7086750/fed19830689a/705_2012_1404_Fig4_HTML.jpg

相似文献

1
Biochemical characterization of a recombinant SARS coronavirus nsp12 RNA-dependent RNA polymerase capable of copying viral RNA templates.一种重组 SARS 冠状病毒 nsp12 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的生化特性分析,该聚合酶能够复制病毒 RNA 模板。
Arch Virol. 2012 Nov;157(11):2095-104. doi: 10.1007/s00705-012-1404-x. Epub 2012 Jul 13.
2
The RNA polymerase activity of SARS-coronavirus nsp12 is primer dependent.严重急性呼吸综合征冠状病毒 nsp12 的 RNA 聚合酶活性依赖于引物。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(1):203-14. doi: 10.1093/nar/gkp904. Epub 2009 Oct 29.
3
A recombinant hepatitis C virus RNA-dependent RNA polymerase capable of copying the full-length viral RNA.一种能够复制全长病毒RNA的重组丙型肝炎病毒RNA依赖性RNA聚合酶。
J Virol. 1999 Sep;73(9):7694-702. doi: 10.1128/JVI.73.9.7694-7702.1999.
4
The SARS-coronavirus nsp7+nsp8 complex is a unique multimeric RNA polymerase capable of both de novo initiation and primer extension.严重急性呼吸综合征冠状病毒 nsp7+nsp8 复合物是一种独特的多聚体 RNA 聚合酶,能够从头起始和引物延伸。
Nucleic Acids Res. 2012 Feb;40(4):1737-47. doi: 10.1093/nar/gkr893. Epub 2011 Oct 29.
5
A second, non-canonical RNA-dependent RNA polymerase in SARS coronavirus.严重急性呼吸综合征冠状病毒中的第二种非典型RNA依赖性RNA聚合酶。
EMBO J. 2006 Oct 18;25(20):4933-42. doi: 10.1038/sj.emboj.7601368. Epub 2006 Oct 5.
6
Identification and characterization of severe acute respiratory syndrome coronavirus replicase proteins.严重急性呼吸综合征冠状病毒复制酶蛋白的鉴定与特性分析
J Virol. 2004 Sep;78(18):9977-86. doi: 10.1128/JVI.78.18.9977-9986.2004.
7
Expression, purification, and characterization of SARS coronavirus RNA polymerase.严重急性呼吸综合征冠状病毒RNA聚合酶的表达、纯化及特性分析
Virology. 2005 May 10;335(2):165-76. doi: 10.1016/j.virol.2005.02.017.
8
Point mutations at specific sites of the nsp12-nsp8 interface dramatically affect the RNA polymerization activity of SARS-CoV-2.特定部位的点突变显著影响 SARS-CoV-2 的 nsp12-nsp8 界面的 RNA 聚合酶活性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Jul 16;121(29):e2317977121. doi: 10.1073/pnas.2317977121. Epub 2024 Jul 11.
9
The SARS-CoV nsp12 Polymerase Active Site Is Tuned for Large-Genome Replication.SARS-CoV nsp12 聚合酶活性位点为大片段基因组复制而优化。
J Virol. 2022 Aug 24;96(16):e0067122. doi: 10.1128/jvi.00671-22. Epub 2022 Aug 4.
10
Zn(2+) inhibits coronavirus and arterivirus RNA polymerase activity in vitro and zinc ionophores block the replication of these viruses in cell culture.锌(2+)在体外抑制冠状病毒和动脉病毒 RNA 聚合酶的活性,而锌离子载体则阻断这些病毒在细胞培养中的复制。
PLoS Pathog. 2010 Nov 4;6(11):e1001176. doi: 10.1371/journal.ppat.1001176.

引用本文的文献

1
Carrimycin exhibited broad spectrum inhibitory activities against coronaviruses replication through down-regulating host factor TMEM41B.卡里霉素通过下调宿主因子TMEM41B对冠状病毒复制表现出广谱抑制活性。
Acta Pharmacol Sin. 2025 May 15. doi: 10.1038/s41401-025-01577-9.
2
Single-molecule assay reveals the impact of composition, RNA duplex, and inhibitors on the binding dynamics of SARS-CoV-2 polymerase complex.单分子检测揭示了组成、RNA 双链体和抑制剂对 SARS-CoV-2 聚合酶复合物结合动力学的影响。
bioRxiv. 2025 Jan 10:2025.01.10.632212. doi: 10.1101/2025.01.10.632212.
3
Nanoscale cellular organization of viral RNA and proteins in SARS-CoV-2 replication organelles.

本文引用的文献

1
Interference of ribosomal frameshifting by antisense peptide nucleic acids suppresses SARS coronavirus replication.反义肽核酸干扰核糖体移码抑制 SARS 冠状病毒复制。
Antiviral Res. 2011 Jul;91(1):1-10. doi: 10.1016/j.antiviral.2011.04.009. Epub 2011 Apr 23.
2
De novo polymerase activity and oligomerization of hepatitis C virus RNA-dependent RNA-polymerases from genotypes 1 to 5.从头聚合酶活性和丙型肝炎病毒 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 1 至 5 基因型的寡聚化。
PLoS One. 2011 Apr 7;6(4):e18515. doi: 10.1371/journal.pone.0018515.
3
Achieving a golden mean: mechanisms by which coronaviruses ensure synthesis of the correct stoichiometric ratios of viral proteins.
SARS-CoV-2 复制细胞器中病毒 RNA 和蛋白质的纳米级细胞结构。
Nat Commun. 2024 May 31;15(1):4644. doi: 10.1038/s41467-024-48991-x.
4
Drug repurposing screen to identify inhibitors of the RNA polymerase (nsp12) and helicase (nsp13) from SARS-CoV-2 replication and transcription complex.针对 SARS-CoV-2 复制和转录复合物的 RNA 聚合酶(nsp12)和解旋酶(nsp13)抑制剂的药物再利用筛选。
Virus Res. 2024 May;343:199356. doi: 10.1016/j.virusres.2024.199356. Epub 2024 Mar 16.
5
Classification, replication, and transcription of ..的分类、复制和转录。 (你提供的原文不完整,请检查一下是否有遗漏内容)
Front Microbiol. 2024 Jan 24;14:1291761. doi: 10.3389/fmicb.2023.1291761. eCollection 2023.
6
SARS-CoV-2 helicase NSP13 hijacks the host protein EWSR1 to promote viral replication by enhancing RNA unwinding activity.严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)解旋酶NSP13通过增强RNA解旋活性劫持宿主蛋白EWSR1以促进病毒复制。
Infect Med (Beijing). 2022 Feb 24;1(1):7-16. doi: 10.1016/j.imj.2021.12.004. eCollection 2022 Mar.
7
Nanoscale cellular organization of viral RNA and proteins in SARS-CoV-2 replication organelles.严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)复制细胞器中病毒RNA和蛋白质的纳米级细胞组织
bioRxiv. 2024 Apr 1:2023.11.07.566110. doi: 10.1101/2023.11.07.566110.
8
A systematic review of RdRp of SARS-CoV-2 through artificial intelligence and machine learning utilizing structure-based drug design strategy.通过利用基于结构的药物设计策略的人工智能和机器学习对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)进行的系统综述。
Turk J Chem. 2021 Dec 27;46(3):583-594. doi: 10.55730/1300-0527.3355. eCollection 2022.
9
Structural and non-structural proteins in SARS-CoV-2: potential aspects to COVID-19 treatment or prevention of progression of related diseases.SARS-CoV-2 的结构蛋白和非结构蛋白:COVID-19 治疗或预防相关疾病进展的潜在方面。
Cell Commun Signal. 2023 May 15;21(1):110. doi: 10.1186/s12964-023-01104-5.
10
Targeting the vital non-structural proteins (NSP12, NSP7, NSP8 and NSP3) from SARS-CoV-2 and inhibition of RNA polymerase by natural bioactive compound naringenin as a promising drug candidate against COVID-19.以严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的重要非结构蛋白(NSP12、NSP7、NSP8和NSP3)为靶点,天然生物活性化合物柚皮素作为一种有前景的抗2019冠状病毒病(COVID-19)候选药物对RNA聚合酶的抑制作用。
J Mol Struct. 2023 Sep 5;1287:135642. doi: 10.1016/j.molstruc.2023.135642. Epub 2023 Apr 26.
实现中庸之道:冠状病毒确保病毒蛋白正确化学计量比合成的机制。
J Virol. 2010 May;84(9):4330-40. doi: 10.1128/JVI.02480-09. Epub 2010 Feb 17.
4
The RNA polymerase activity of SARS-coronavirus nsp12 is primer dependent.严重急性呼吸综合征冠状病毒 nsp12 的 RNA 聚合酶活性依赖于引物。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(1):203-14. doi: 10.1093/nar/gkp904. Epub 2009 Oct 29.
5
SARS-coronavirus replication is supported by a reticulovesicular network of modified endoplasmic reticulum.严重急性呼吸综合征冠状病毒的复制由修饰内质网的网状囊泡网络支持。
PLoS Biol. 2008 Sep 16;6(9):e226. doi: 10.1371/journal.pbio.0060226.
6
SARS-coronavirus replication/transcription complexes are membrane-protected and need a host factor for activity in vitro.严重急性呼吸综合征冠状病毒复制/转录复合体受到膜的保护,且在体外发挥活性需要一种宿主因子。
PLoS Pathog. 2008 May 2;4(5):e1000054. doi: 10.1371/journal.ppat.1000054.
7
Genetic interactions between an essential 3' cis-acting RNA pseudoknot, replicase gene products, and the extreme 3' end of the mouse coronavirus genome.一种必需的3'顺式作用RNA假结、复制酶基因产物与小鼠冠状病毒基因组3'末端之间的遗传相互作用。
J Virol. 2008 Feb;82(3):1214-28. doi: 10.1128/JVI.01690-07. Epub 2007 Nov 21.
8
Stimulation of picornavirus replication by the poly(A) tail in a cell-free extract is largely independent of the poly(A) binding protein (PABP).在无细胞提取物中,多聚腺苷酸尾对小核糖核酸病毒复制的刺激在很大程度上不依赖于多聚腺苷酸结合蛋白(PABP)。
RNA. 2007 Dec;13(12):2330-40. doi: 10.1261/rna.606407. Epub 2007 Oct 17.
9
Biochemical characterization of a recombinant Japanese encephalitis virus RNA-dependent RNA polymerase.重组日本脑炎病毒RNA依赖性RNA聚合酶的生化特性
BMC Mol Biol. 2007 Jul 11;8:59. doi: 10.1186/1471-2199-8-59.
10
De novo initiation of RNA synthesis by the arterivirus RNA-dependent RNA polymerase.动脉病毒RNA依赖性RNA聚合酶对RNA合成的从头起始。
J Virol. 2007 Aug;81(16):8384-95. doi: 10.1128/JVI.00564-07. Epub 2007 May 30.