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HiTC：高通量 'C' 实验的探索。

HiTC: exploration of high-throughput 'C' experiments.

机构信息

Institut Curie, F-75248 Paris, France.

出版信息

Bioinformatics. 2012 Nov 1;28(21):2843-4. doi: 10.1093/bioinformatics/bts521. Epub 2012 Aug 24.

DOI:10.1093/bioinformatics/bts521
PMID:22923296
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3476334/
Abstract

SUMMARY

The R/Bioconductor package HiTC facilitates the exploration of high-throughput 3C-based data. It allows users to import and export 'C' data, to transform, normalize, annotate and visualize interaction maps. The package operates within the Bioconductor framework and thus offers new opportunities for future development in this field.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

The R package HiTC is available from the Bioconductor website. A detailed vignette provides additional documentation and help for using the package.

摘要

摘要

R/Bioconductor 包 HiTC 促进了高通量 3C 数据的探索。它允许用户导入和导出 'C' 数据，转换、标准化、注释和可视化相互作用图谱。该软件包在 Bioconductor 框架内运行，因此为该领域的未来发展提供了新的机会。

可用性和实现

R 包 HiTC 可从 Bioconductor 网站获得。详细的案例研究提供了使用该软件包的附加文档和帮助。