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1
Draft genome sequence of Citreicella aestuarii strain 357, a member of the Roseobacter clade isolated without xenobiotic pressure from a petroleum-polluted beach.河口栖海菌 357 株的基因组草案序列，该菌属于玫瑰杆菌群，是从受石油污染的海滩上未经异生物质压力筛选而分离得到的。
J Bacteriol. 2012 Oct;194(19):5464-5. doi: 10.1128/JB.01261-12.
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Genome sequence of strain TW15, a novel member of the genus Ruegeria, belonging to the marine Roseobacter clade.TW15 菌株的基因组序列，一种新型的 Ruegeria 属成员，属于海洋红杆菌群。
J Bacteriol. 2011 Jul;193(13):3401-2. doi: 10.1128/JB.05067-11. Epub 2011 May 6.
3
Phylogenomic analyses of a clade within the roseobacter group suggest taxonomic reassignments of species of the genera Aestuariivita, Citreicella, Loktanella, Nautella, Pelagibaca, Ruegeria, Thalassobius, Thiobacimonas and Tropicibacter, and the proposal of six novel genera.对玫瑰杆菌群内一个进化枝的系统基因组分析表明，需对河口维他菌属、柠檬黄杆菌属、洛氏菌属、瑙氏菌属、海洋芽孢杆菌属、红杆菌属、嗜盐杆菌属、硫杆菌属和嗜热栖菌属的物种进行分类重新划分，并提议设立六个新属。
Int J Syst Evol Microbiol. 2018 Jul;68(7):2393-2411. doi: 10.1099/ijsem.0.002833. Epub 2018 May 29.
4
Citreicella aestuarii sp. nov., isolated from a tidal flat.河口海栖杆菌（Citreicella aestuarii），从潮滩中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2011 Nov;61(Pt 11):2595-2599. doi: 10.1099/ijs.0.028332-0. Epub 2010 Dec 3.
5
Silicimonas algicola gen. nov., sp. nov., a member of the Roseobacter clade isolated from the cell surface of the marine diatom Thalassiosira delicatula.嗜藻硅单胞菌属，新属，新种，一种从海洋硅藻精致海链藻细胞表面分离得到的玫瑰杆菌分支成员。
Int J Syst Evol Microbiol. 2016 Nov;66(11):4580-4588. doi: 10.1099/ijsem.0.001394. Epub 2016 Aug 5.
6
Draft genome sequence of Rhodococcus sp. strain P14, a biodegrader of high-molecular-weight polycyclic aromatic hydrocarbons.罗地考克斯氏菌 P14 菌株的基因组草案，该菌能生物降解高分子量多环芳烃。
J Bacteriol. 2012 Jul;194(13):3546. doi: 10.1128/JB.00555-12.
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J Bacteriol. 2011 Sep;193(17):4538-9. doi: 10.1128/JB.05388-11. Epub 2011 Jul 1.
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Antonie Van Leeuwenhoek. 2014 Apr;105(4):671-8. doi: 10.1007/s10482-014-0121-8. Epub 2014 Feb 1.
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Biodegradation of Diesel, Crude Oil and Spent Lubricating Oil by Soil Isolates of Bacillus spp.芽孢杆菌属土壤分离株对柴油、原油和废润滑油的生物降解作用
Bull Environ Contam Toxicol. 2017 May;98(5):698-705. doi: 10.1007/s00128-017-2039-0. Epub 2017 Feb 16.
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Phaeobacter gallaeciensis genomes from globally opposite locations reveal high similarity of adaptation to surface life.来自全球相反地理位置的噬盐菌基因组揭示了对表面生活适应的高度相似性。
ISME J. 2012 Dec;6(12):2229-44. doi: 10.1038/ismej.2012.62. Epub 2012 Jun 21.

引用本文的文献

1
Identification of a putative novel polycyclic aromatic hydrocarbon-biodegrading gene cluster in a marine bacterium sp. MA-2.在海洋细菌sp. MA-2中鉴定出一个假定的新型多环芳烃降解基因簇。
Microbiol Spectr. 2025 Jan 7;13(1):e0107424. doi: 10.1128/spectrum.01074-24. Epub 2024 Nov 27.
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Microbiol Spectr. 2024 Jan 11;12(1):e0340923. doi: 10.1128/spectrum.03409-23. Epub 2023 Dec 12.
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Int J Mol Sci. 2020 Dec 22;22(1):17. doi: 10.3390/ijms22010017.

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Genome characteristics of a generalist marine bacterial lineage.海洋细菌谱系的基因组特征。
ISME J. 2010 Jun;4(6):784-98. doi: 10.1038/ismej.2009.150. Epub 2010 Jan 14.
2
KAAS: an automatic genome annotation and pathway reconstruction server.KAAS：一个自动基因组注释和通路重建服务器。
Nucleic Acids Res. 2007 Jul;35(Web Server issue):W182-5. doi: 10.1093/nar/gkm321. Epub 2007 May 25.
3
Overview of the marine roseobacter lineage.海洋玫瑰杆菌谱系概述。
Appl Environ Microbiol. 2005 Oct;71(10):5665-77. doi: 10.1128/AEM.71.10.5665-5677.2005.
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The Pathway Tools software.通路工具软件。
Bioinformatics. 2002;18 Suppl 1:S225-32. doi: 10.1093/bioinformatics/18.suppl_1.s225.

河口栖海菌 357 株的基因组草案序列，该菌属于玫瑰杆菌群，是从受石油污染的海滩上未经异生物质压力筛选而分离得到的。

Draft genome sequence of Citreicella aestuarii strain 357, a member of the Roseobacter clade isolated without xenobiotic pressure from a petroleum-polluted beach.

机构信息

Microbiologia, Departament de Biologia, Universitat de les Illes Balears, Palma de Mallorca, Spain.

出版信息

J Bacteriol. 2012 Oct;194(19):5464-5. doi: 10.1128/JB.01261-12.

DOI:10.1128/JB.01261-12
PMID:22965089
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3457245/
Abstract

Citreicella aestuarii 357 is a member of the Roseobacter clade that was isolated without xenobiotic pressure from an oil-polluted sand sample from the Galician coast (Spain). Its genome sequence suggests an organoheterotrophic metabolism, including a wide catabolic potential for aromatic hydrocarbons.

摘要

港湾杆菌 357 号是玫瑰杆菌群的一个成员，它是在没有外来压力的情况下从西班牙加利西亚海岸的一个受石油污染的沙样中分离出来的。它的基因组序列表明其具有有机异养代谢能力，包括对芳烃类化合物的广泛代谢潜力。