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酵母基因组应用程序:触手可及的酿酒酵母基因组数据库。

The YeastGenome app: the Saccharomyces Genome Database at your fingertips.

机构信息

Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305-5120, USA.

出版信息

Database (Oxford). 2013 Feb 8;2013:bat004. doi: 10.1093/database/bat004. Print 2013.

DOI:10.1093/database/bat004
PMID:23396302
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3567487/
Abstract

The Saccharomyces Genome Database (SGD) is a scientific database that provides researchers with high-quality curated data about the genes and gene products of Saccharomyces cerevisiae. To provide instant and easy access to this information on mobile devices, we have developed YeastGenome, a native application for the Apple iPhone and iPad. YeastGenome can be used to quickly find basic information about S. cerevisiae genes and chromosomal features regardless of internet connectivity. With or without network access, you can view basic information and Gene Ontology annotations about a gene of interest by searching gene names and gene descriptions or by browsing the database within the app to find the gene of interest. With internet access, the app provides more detailed information about the gene, including mutant phenotypes, references and protein and genetic interactions, as well as provides hyperlinks to retrieve detailed information by showing SGD pages and views of the genome browser. SGD provides online help describing basic ways to navigate the mobile version of SGD, highlights key features and answers frequently asked questions related to the app. The app is available from iTunes (http://itunes.com/apps/yeastgenome). The YeastGenome app is provided freely as a service to our community, as part of SGD's mission to provide free and open access to all its data and annotations.

摘要

酿酒酵母基因组数据库(SGD)是一个科学数据库,为研究人员提供关于酿酒酵母的基因和基因产物的高质量精选数据。为了在移动设备上提供即时和便捷的访问,我们开发了 YeastGenome,这是适用于苹果 iPhone 和 iPad 的原生应用程序。YeastGenome 可用于快速查找关于 S. cerevisiae 基因和染色体特征的基本信息,无论是否具有互联网连接。无论是否具有网络连接,都可以通过搜索基因名称和基因描述,或者通过在应用程序内浏览数据库来查找感兴趣的基因,快速查看感兴趣基因的基本信息和基因本体论注释。有了互联网访问权限,该应用程序还可以提供有关该基因的更详细信息,包括突变表型、参考文献和蛋白质和遗传相互作用,并提供超链接,通过显示 SGD 页面和基因组浏览器视图来检索详细信息。SGD 提供了在线帮助,描述了导航 SGD 移动版本的基本方法,突出了关键功能并回答了与该应用程序相关的常见问题。该应用程序可从 iTunes(http://itunes.com/apps/yeastgenome)获得。YeastGenome 应用程序是作为我们社区的一项免费服务提供的,这是 SGD 提供免费和开放访问其所有数据和注释的使命的一部分。

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