• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

枯萎短小杆菌UCD - AKU菌株(放线菌门)的基因组序列草图

Draft Genome Sequence of Curtobacterium flaccumfaciens Strain UCD-AKU (Phylum Actinobacteria).

作者信息

Flanagan Jennifer C, Lang Jenna M, Darling Aaron E, Eisen Jonathan A, Coil David A

机构信息

University of California Davis, Genome Center, Davis, California, USA.

出版信息

Genome Announc. 2013 May 16;1(3):e00244-13. doi: 10.1128/genomeA.00244-13.

DOI:10.1128/genomeA.00244-13
PMID:23682147
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3656209/
Abstract

Here we present the draft genome of an actinobacterium, Curtobacterium flaccumfaciens strain UCD-AKU, isolated from a residential carpet. The genome assembly contains 3,692,614 bp in 130 contigs. This is the first member of the Curtobacterium genus to be sequenced.

摘要

在此,我们展示了一种从家用地毯中分离出的放线菌——萎蔫短小杆菌菌株UCD - AKU的基因组草图。基因组组装包含130个重叠群,共3,692,614碱基对。这是短小杆菌属中首个被测序的成员。

相似文献

1
Draft Genome Sequence of Curtobacterium flaccumfaciens Strain UCD-AKU (Phylum Actinobacteria).枯萎短小杆菌UCD - AKU菌株(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 May 16;1(3):e00244-13. doi: 10.1128/genomeA.00244-13.
2
Draft Genome Sequence of Curtobacterium sp. Strain UCD-KPL2560 (Phylum Actinobacteria).短小杆菌属菌株UCD-KPL2560(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2016 Oct 6;4(5):e01040-16. doi: 10.1128/genomeA.01040-16.
3
Draft Genome Sequence of Dietzia sp. Strain UCD-THP (Phylum Actinobacteria).Dietzia sp.菌株UCD - THP(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 May 9;1(3):e00197-13. doi: 10.1128/genomeA.00197-13.
4
Draft Genome Sequence of Microbacterium sp. Strain UCD-TDU (Phylum Actinobacteria).微小杆菌属菌株UCD - TDU(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 Mar 21;1(2):e0012013. doi: 10.1128/genomeA.00120-13.
5
Complete Genome Sequence Resource of a Strain of pv. , the Causal Agent of Bacterial Wilt of Common Bean, from Turkey.一株土耳其引起菜豆细菌性萎蔫病菌的全基因组序列资源。
Phytopathology. 2020 Dec;110(12):2010-2013. doi: 10.1094/PHYTO-04-20-0131-A. Epub 2020 Nov 4.
6
Draft Genome Sequence of Gordonia sp. Strain UCD-TK1 (Phylum Actinobacteria).戈登氏菌属菌株UCD-TK1(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2016 Oct 13;4(5):e01121-16. doi: 10.1128/genomeA.01121-16.
7
Draft Genome Sequence of sp. Strain UCD-GKA (Phylum ).sp. 菌株UCD-GKA(门 )的基因组序列草图
Genome Announc. 2017 Feb 9;5(6):e01599-16. doi: 10.1128/genomeA.01599-16.
8
Draft Genome Sequence of Kocuria sp. Strain UCD-OTCP (Phylum Actinobacteria).科氏菌属菌株UCD-OTCP(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 May 9;1(3):e00172-13. doi: 10.1128/genomeA.00172-13.
9
Draft Genome Sequence of Leucobacter sp. Strain UCD-THU (Phylum Actinobacteria).勒克氏菌属菌株UCD - THU(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 Jun 27;1(3):e00325-13. doi: 10.1128/genomeA.00325-13.
10
Complete Genome Sequencing Provides Novel Insight Into the Virulence Repertories and Phylogenetic Position of Dry Beans Pathogen pv. .完整基因组测序为干豆病原菌 pv. 的毒力库和系统发育位置提供了新的见解。
Phytopathology. 2021 Feb;111(2):268-280. doi: 10.1094/PHYTO-06-20-0243-R. Epub 2020 Dec 1.

引用本文的文献

1
Comparative genomics of Bacteria commonly identified in the built environment.常见建筑环境中细菌的比较基因组学。
BMC Genomics. 2019 Jan 28;20(1):92. doi: 10.1186/s12864-018-5389-z.
2
High-Quality Draft Genome Sequence of sp. Strain Ferrero.费列罗氏菌(Ferrero sp.)菌株的高质量基因组草图序列
Genome Announc. 2017 Nov 30;5(48):e01378-17. doi: 10.1128/genomeA.01378-17.
3
Draft Genome Sequence of Curtobacterium sp. Strain UCD-KPL2560 (Phylum Actinobacteria).短小杆菌属菌株UCD-KPL2560(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2016 Oct 6;4(5):e01040-16. doi: 10.1128/genomeA.01040-16.
4
Swabs to genomes: a comprehensive workflow.从拭子到基因组:一个全面的工作流程。
PeerJ. 2015 May 14;3:e960. doi: 10.7717/peerj.960. eCollection 2015.

本文引用的文献

1
Draft Genome Sequence of Microbacterium sp. Strain UCD-TDU (Phylum Actinobacteria).微小杆菌属菌株UCD - TDU(放线菌门)的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 Mar 21;1(2):e0012013. doi: 10.1128/genomeA.00120-13.
2
Draft genome sequence of an Actinobacterium, Brachybacterium muris strain UCD-AY4.一种放线菌——鼠短杆菌UCD-AY4菌株的基因组序列草图
Genome Announc. 2013 Mar 21;1(2):e0008613. doi: 10.1128/genomeA.00086-13.
3
An integrated pipeline for de novo assembly of microbial genomes.用于从头组装微生物基因组的集成管道。
PLoS One. 2012;7(9):e42304. doi: 10.1371/journal.pone.0042304. Epub 2012 Sep 13.
4
Genetic diversity among Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens populations in the American high plains.美洲高平原上野油菜黄单胞菌致病变种群体间的遗传多样性。
Can J Microbiol. 2012 Jun;58(6):788-801. doi: 10.1139/w2012-052. Epub 2012 May 29.
5
Characteristics of microbial biofilm on wooden vats ('gerles') in PDO Salers cheese.PDO 萨莱奶酪木槽(“gerles”)中微生物生物膜的特征。
Int J Food Microbiol. 2012 May 15;156(2):91-101. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2012.03.007. Epub 2012 Mar 15.
6
Curtobacterium flaccumfaciens septic arthritis following puncture with a Coxspur Hawthorn thorn.短梗霉属细菌性关节炎继发于胡颓子刺穿刺伤。
J Clin Microbiol. 2011 Jul;49(7):2759-60. doi: 10.1128/JCM.00340-11. Epub 2011 May 11.
7
progressiveMauve: multiple genome alignment with gene gain, loss and rearrangement.渐进紫:具有基因增益、缺失和重排的多基因组比对。
PLoS One. 2010 Jun 25;5(6):e11147. doi: 10.1371/journal.pone.0011147.
8
The Ribosomal Database Project: improved alignments and new tools for rRNA analysis.核糖体数据库项目:改进的比对方法及用于rRNA分析的新工具。
Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue):D141-5. doi: 10.1093/nar/gkn879. Epub 2008 Nov 12.
9
Curtobacterium ginsengisoli sp. nov., isolated from soil of a ginseng field.人参土壤短小杆菌新种,从人参田土壤中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2008 Oct;58(Pt 10):2393-7. doi: 10.1099/ijs.0.65591-0.
10
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.RAST服务器:使用子系统技术进行快速注释。
BMC Genomics. 2008 Feb 8;9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75.