• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

微调氨酰-tRNA合成酶与tRNA之间的相互作用，以高效合成含有非天然氨基酸的蛋白质。

Fine-tuning interaction between aminoacyl-tRNA synthetase and tRNA for efficient synthesis of proteins containing unnatural amino acids.

作者信息

Wang Nanxi, Ju Tong, Niu Wei, Guo Jiantao

机构信息

Department of Chemistry, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, Nebraska 68588, United States.

出版信息

ACS Synth Biol. 2015 Mar 20;4(3):207-12. doi: 10.1021/sb500195w. Epub 2014 May 23.

DOI:10.1021/sb500195w
PMID:24847685
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4384836/
Abstract

By using a directed evolution approach, we have identified aminoacyl-tRNA synthetase variants with significantly enhanced activity for the incorporation of unnatural amino acids into proteins in response to the amber nonsense codon in bacteria. We demonstrated that the optimization of anticodon recognition of tRNA by aminoacyl-tRNA synthetase led to improved incorporation efficiency that is unnatural amino acid-specific. The findings will facilitate the creation of an optimized system for the genetic incorporation of unnatural amino acids in bacteria.

摘要

通过使用定向进化方法，我们鉴定出了氨酰-tRNA合成酶变体，它们在细菌中针对琥珀色无义密码子将非天然氨基酸掺入蛋白质的活性显著增强。我们证明，氨酰-tRNA合成酶对tRNA反密码子识别的优化导致了非天然氨基酸特异性的掺入效率提高。这些发现将有助于创建一个优化的系统，用于在细菌中对非天然氨基酸进行遗传掺入。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/bec7ec86913f/sb-2014-00195w_0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/bb31e0417b8f/sb-2014-00195w_0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/ded158a556a4/sb-2014-00195w_0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/ec71c96b944c/sb-2014-00195w_0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/8be68a56608b/sb-2014-00195w_0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/bec7ec86913f/sb-2014-00195w_0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/bb31e0417b8f/sb-2014-00195w_0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/ded158a556a4/sb-2014-00195w_0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/ec71c96b944c/sb-2014-00195w_0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/8be68a56608b/sb-2014-00195w_0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3d27/4384836/bec7ec86913f/sb-2014-00195w_0005.jpg

相似文献

1
Fine-tuning interaction between aminoacyl-tRNA synthetase and tRNA for efficient synthesis of proteins containing unnatural amino acids.微调氨酰-tRNA合成酶与tRNA之间的相互作用，以高效合成含有非天然氨基酸的蛋白质。
ACS Synth Biol. 2015 Mar 20;4(3):207-12. doi: 10.1021/sb500195w. Epub 2014 May 23.
2
Encoding multiple unnatural amino acids via evolution of a quadruplet-decoding ribosome.通过四重编码核糖体的进化来编码多个非天然氨基酸。
Nature. 2010 Mar 18;464(7287):441-4. doi: 10.1038/nature08817. Epub 2010 Feb 14.
3
An efficient system for incorporation of unnatural amino acids in response to the four-base codon AGGA in Escherichia coli.一种在大肠杆菌中响应四碱基密码子 AGGA 掺入非天然氨基酸的有效系统。
Biochim Biophys Acta Gen Subj. 2017 Nov;1861(11 Pt B):3016-3023. doi: 10.1016/j.bbagen.2017.02.017. Epub 2017 Feb 14.
4
Transferability of N-terminal mutations of pyrrolysyl-tRNA synthetase in one species to that in another species on unnatural amino acid incorporation efficiency.在非天然氨基酸掺入效率方面，一种物种中 Pyrrolysyl-tRNA 合成酶 N 端突变向另一种物种的转移。
Amino Acids. 2021 Jan;53(1):89-96. doi: 10.1007/s00726-020-02927-z. Epub 2020 Dec 17.
5
Genetic Code Expansion in Mammalian Cells Through Quadruplet Codon Decoding.通过四联体密码子解码实现哺乳动物细胞中的遗传密码扩展。
Methods Mol Biol. 2023;2676:181-190. doi: 10.1007/978-1-0716-3251-2_13.
6
Evolution of multiple, mutually orthogonal prolyl-tRNA synthetase/tRNA pairs for unnatural amino acid mutagenesis in Escherichia coli.多种相互正交的脯氨酰-tRNA 合成酶/tRNA 对在大肠杆菌中用于非天然氨基酸诱变的进化。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Sep 11;109(37):14841-6. doi: 10.1073/pnas.1212454109. Epub 2012 Aug 27.
7
A Robust and Quantitative Reporter System To Evaluate Noncanonical Amino Acid Incorporation in Yeast.一种用于评估酵母中非天然氨基酸掺入的强大且定量的报告系统。
ACS Synth Biol. 2018 Sep 21;7(9):2256-2269. doi: 10.1021/acssynbio.8b00260. Epub 2018 Sep 4.
8
A chemical toolkit for proteins--an expanded genetic code.蛋白质的化学工具包——扩展的遗传密码。
Nat Rev Mol Cell Biol. 2006 Oct;7(10):775-82. doi: 10.1038/nrm2005. Epub 2006 Aug 23.
9
Pyrrolysyl-tRNA synthetase: an ordinary enzyme but an outstanding genetic code expansion tool.吡咯赖氨酸-tRNA合成酶：一种普通的酶却是出色的遗传密码扩展工具。
Biochim Biophys Acta. 2014 Jun;1844(6):1059-70. doi: 10.1016/j.bbapap.2014.03.002. Epub 2014 Mar 12.
10
Upgrading aminoacyl-tRNA synthetases for genetic code expansion.提升氨酰-tRNA 合成酶以实现遗传密码扩展。
Curr Opin Chem Biol. 2018 Oct;46:115-122. doi: 10.1016/j.cbpa.2018.07.014. Epub 2018 Jul 27.

引用本文的文献

1
Reaching New Heights in Genetic Code Manipulation with High Throughput Screening.高通量筛选助力基因密码操作技术新突破
Chem Rev. 2024 Nov 13;124(21):12145-12175. doi: 10.1021/acs.chemrev.4c00329. Epub 2024 Oct 17.
2
Minimizing the Anticodon-Recognized Loop of Tyrosyl-tRNA Synthetase to Improve the Efficiency of Incorporating Noncanonical Amino Acids.最小化酪氨酸 tRNA 合成酶的反密码子识别环以提高非规范氨基酸掺入的效率。
Biomolecules. 2023 Mar 28;13(4):610. doi: 10.3390/biom13040610.
3
Proximity-enhanced protein crosslinking through an alkene-tetrazine reaction.

本文引用的文献

1
Construction of a live-attenuated HIV-1 vaccine through genetic code expansion.通过遗传密码扩展构建减毒活HIV-1疫苗。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 May 5;53(19):4867-71. doi: 10.1002/anie.201402092. Epub 2014 Apr 8.
2
Expanding the chemistry of fluorescent protein biosensors through genetic incorporation of unnatural amino acids.通过非天然氨基酸的基因掺入扩展荧光蛋白生物传感器的化学性质。
Mol Biosyst. 2013 Dec;9(12):2961-70. doi: 10.1039/c3mb70204a. Epub 2013 Oct 1.
3
An expanded genetic code in mammalian cells with a functional quadruplet codon.
通过烯炔-四嗪反应增强蛋白质的邻近交联。
Bioorg Chem. 2023 Mar;132:106359. doi: 10.1016/j.bioorg.2023.106359. Epub 2023 Jan 11.
4
Impact of queuosine modification of endogenous tRNAs on sense codon reassignment.内源性tRNA的queuosine修饰对有义密码子重新分配的影响。
Front Mol Biosci. 2022 Aug 31;9:938114. doi: 10.3389/fmolb.2022.938114. eCollection 2022.
5
Biochemistry of Aminoacyl tRNA Synthetase and tRNAs and Their Engineering for Cell-Free and Synthetic Cell Applications.氨酰-tRNA合成酶与tRNA的生物化学及其在无细胞和合成细胞应用中的工程改造
Front Bioeng Biotechnol. 2022 Jul 1;10:918659. doi: 10.3389/fbioe.2022.918659. eCollection 2022.
6
Directed Evolution Pipeline for the Improvement of Orthogonal Translation Machinery for Genetic Code Expansion at Sense Codons.用于改进有义密码子遗传密码扩展的正交翻译机制的定向进化流程
Front Chem. 2022 Feb 17;10:815788. doi: 10.3389/fchem.2022.815788. eCollection 2022.
7
Directed-evolution of translation system for efficient unnatural amino acids incorporation and generalizable synthetic auxotroph construction.定向进化翻译系统以实现高效非天然氨基酸掺入和通用合成营养缺陷型构建。
Nat Commun. 2021 Dec 2;12(1):7039. doi: 10.1038/s41467-021-27399-x.
8
Engineering of a Small Protein Scaffold To Recognize Sulfotyrosine with High Specificity.工程化小蛋白支架以高特异性识别硫酸酪氨酸。
ACS Chem Biol. 2021 Aug 20;16(8):1508-1517. doi: 10.1021/acschembio.1c00382. Epub 2021 Jul 12.
9
Exploring protein phosphorylation by combining computational approaches and biochemical methods.通过结合计算方法和生化方法探索蛋白质磷酸化。
Comput Struct Biotechnol J. 2020 Jul 7;18:1852-1863. doi: 10.1016/j.csbj.2020.06.043. eCollection 2020.
10
Extract-Based Cell-Free Expression System as an Alternative for Difficult-to-Obtain Protein Biosynthesis.基于提取的无细胞表达系统作为难以获得的蛋白质生物合成的替代方法。
Int J Mol Sci. 2020 Jan 31;21(3):928. doi: 10.3390/ijms21030928.
具有功能性四联体密码子的哺乳动物细胞扩展遗传密码。
ACS Chem Biol. 2013 Jul 19;8(7):1640-5. doi: 10.1021/cb4001662. Epub 2013 May 20.
4
Molecular recognition of sulfotyrosine and phosphotyrosine by the Src homology 2 domain.Src同源2结构域对磺基酪氨酸和磷酸酪氨酸的分子识别
Mol Biosyst. 2013 Jul;9(7):1829-32. doi: 10.1039/c3mb70061e. Epub 2013 Apr 9.
5
Designer proteins: applications of genetic code expansion in cell biology.设计蛋白：遗传密码扩展在细胞生物学中的应用。
Nat Rev Mol Cell Biol. 2012 Feb 15;13(3):168-82. doi: 10.1038/nrm3286.
6
Regulation of transcription by unnatural amino acids.非天然氨基酸调控转录。
Nat Biotechnol. 2011 Feb;29(2):164-8. doi: 10.1038/nbt.1741. Epub 2011 Jan 16.
7
Adding new chemistries to the genetic code.向遗传密码中添加新的化学物质。
Annu Rev Biochem. 2010;79:413-44. doi: 10.1146/annurev.biochem.052308.105824.
8
Encoding multiple unnatural amino acids via evolution of a quadruplet-decoding ribosome.通过四重编码核糖体的进化来编码多个非天然氨基酸。
Nature. 2010 Mar 18;464(7287):441-4. doi: 10.1038/nature08817. Epub 2010 Feb 14.
9
Evolution of amber suppressor tRNAs for efficient bacterial production of proteins containing nonnatural amino acids.琥珀终止 tRNA 进化用于高效细菌生产含有非天然氨基酸的蛋白质。
Angew Chem Int Ed Engl. 2009;48(48):9148-51. doi: 10.1002/anie.200904035.
10
An enhanced system for unnatural amino acid mutagenesis in E. coli.一种用于大肠杆菌中非天然氨基酸诱变的增强系统。
J Mol Biol. 2010 Jan 15;395(2):361-74. doi: 10.1016/j.jmb.2009.10.030. Epub 2009 Oct 21.