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一个用于对大群体进行高效顺时群体遗传模拟的C++模板库。

A C++ template library for efficient forward-time population genetic simulation of large populations.

作者信息

Thornton Kevin R

机构信息

Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California, Irvine, California 92697

出版信息

Genetics. 2014 Sep;198(1):157-66. doi: 10.1534/genetics.114.165019. Epub 2014 Jun 20.

DOI:10.1534/genetics.114.165019
PMID:24950894
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4174927/
Abstract

fwdpp is a C++ library of routines intended to facilitate the development of forward-time simulations under arbitrary mutation and fitness models. The library design provides a combination of speed, low memory overhead, and modeling flexibility not currently available from other forward simulation tools. The library is particularly useful when the simulation of large populations is required, as programs implemented using the library are much more efficient than other available forward simulation programs.

摘要

fwdpp是一个C++例程库，旨在促进在任意突变和适应度模型下进行正向时间模拟的开发。该库的设计结合了速度、低内存开销和建模灵活性，这是目前其他正向模拟工具所不具备的。当需要模拟大群体时，该库特别有用，因为使用该库实现的程序比其他可用的正向模拟程序效率更高。